Id Trinity | TRINITY_DN47675_c1_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_359257 |
Sequence | AAAGCTGCAATCAAGAAGATGGATATGCAAGCATCAAAAGAGTTTCTTGCTGAATTGAAAGTCCTTACACATGTTCATCATCTTAACCTGGTAATAAACC TTTCAAACTTCAATTATTTATAAGTATCATCCTATTTATTTGCATACCATAGACTCCGATTAATTTCAGTCATATCTAGAGTTAGCTCGAGATATGAATG TAGTAATTTCCTCCTGCGTCTCTAGATCATAAACACTATCGGAATCCTTTTAATTGTTGTGAAGATTTATTGTATAGGTATAGCAGATACAACACAATCA GATAAATACAATTATTATCTAATAGAATGTCATAATATATCAACACATACAAACACTTTGCCTGCTTCCATTAACTGAAAATGTGGTTTGCGTATATCCA TCATTCCTTATCGGTAGACTAGGATAGGATAATTAGTCATGCATGTTAGTTAATACTTATAGAGGCACCATTAGATTGTTGTCAAGATCATTCTTTTCAT TAGATTCTTTTAATGGCGGAAACTGAACCCTGTTATCTGGCAAAACTATATGGATTAAGAATTCATGTGGCTTTATTATTTGAGAATGATATCTGTTTTA CTTTAATATGCATAATAGTGAAAGAGAAAGACTTCATCATATCATCTAAATATAGAAAGGGTTGTGTAATGCACGAGCATCCCATCTCGTGCGGTTTGAG GAGGGTAAGTGTATGCAGGCTTGTCCCTACAAACATGGAGACTCTGCCAAGGATTTAAACTTGTAACCTCCATACAAGTCACAAAGCGACAACCTTACTA TTCCCAACTTTACTGTTGTAGAAAATTTCAGACAGAACAGAAGGCTACCCTTAAATTTTAAGTGATGTCACTCAATACTCGGTAGTAGGTTGGATTCGAA TCTAAAGATTCTCTGGAAGCTTCTACACATAAGATATTGTAACAAACATAAAATGCTTAAATATTTTGTTTGCTTACATAATTAGCTTAGAGAACTTCTG TGTTACCCTTAGTTATTCCTCTTATAAGTTGTGTACATAATTTTGCATATGGAGACATTGGAATTTCTTCATATAAACATGAATTCTTACATCTTATGTT GTGTATGTCTTCAACTCTTATTGGCCCTTAAGGTGCGGTTGATCGGGTACAGTATAGAGGGCTCTCTTTTCCTTGTCTATGAATTCATTGAGAATGGAAA CTTGAGTCAACATCTGCGTGGTTCAGGTTAGATCAGCTCATAGTTTAGTTCTTATTTACTAATGAGGTATCATGAATGTCATCAAGTTATAATGTTGACA GGAAGAGACCCACTGCCATGGCCTACCCGGGTGCAGATTGCTTTGGATTCAGCCAGAGGTCTTGAATATATCCATGAGCATACGGTGCCTGTATATATTC ATCGCGACATAAAGTCAGCAAATATATTAATAGACAAAAACTTCCGGGGAAAGGTTCGATATGTATTAAGATCTTTATTTTTAATATCTGGATTGCTATG AAAGCTCTAAGGGTGAGCCTCAATGCAATAGTAAGGTTGTTGGCTTAGTGACATGAGGTCACGAGTTCAAATTTCCCAGACCTTACTGGGTGGGAGCTTT ATTCCCTATGAAAGCTCTAAACATATTCTTATTTGCAGGTTGCCGATTTTGGTTTGACCAAACTGACAGAAGTCGGAGGCTCGTCGCTTCCCACTGCTCG TCTTGTTGGAACATTTGGATACATGCCTCCCGAGTATGACAACTCATATTCTTTAAATATAAGTAGCTGTTCATACTAGAACTTTTAATCATTTATCTTC CAAGTTTTCTAAAATCTTAAAGGATGAGAAGTTTAACCGGATACTGTACTAATGCAAAATAGTTTTTAATAGTTTTTACTAATGCAATGGAATCATGGAG TTAATTTTTGGTGTATTATTTATTCTAGTGACTGTTAAGTCTCTTGTCCTGTTAAGTGCATATAGTTTTTATTGAAGTTCAATATTTGATTGACATGGAT TTGTTGTGATGGTTCTGTTTGAAGGTATGCTCAATATGGAGATGTTTCTCCCAAAGTAGATGTGTATGCTTTTGGAGTTGTTCTTTATGAACTTATTTCT GCTAAGGAAGCTATCATTCAACTTATGGGTGACTCAAAGGGCCTCGTAGATTTGGTTAGTCTTGATTTCTCTATTGAACTATTTTAGTCAATAGTATTAT TTTCATATCGACCATAGTATCGTTCCTCGACGATCTAAATGTTGGTATTGATGCAGTTCGAAGAAGTTCTTAGTCAGACTAATTCGATTGAGGATCTTTG TAAATTAGTGGATCCAAGGCTAGGGGACAACTACCCTATTGATTCTGTTCTCAAGGTTTGAACATTTGTTAGATTAAACCTTGGAATGTTTATTTTTATG ATTTCAATAATAGTATACTTATTATTAAGGGTGGAAATGGCCAGGTCAGACTTTGCCTTAAACAGGTCGAGCCTATATAGCATATAGGACTCTAGGCCCG ATCTGTTAGCTTGTTTATAAAAAAATTCAAAACCAGCCTGACCTGTTTCAAAGTTTGGTATGACCTGTTAATCTGTTTAAAGGGCTGCTATATGATCATG AAATAGACCATCATGTCTACATTTAAATGAGCTAATAGGTCTACTTTTTGACTAGGTCAATCTAACTCTAATAATTAAATTATATTTTTGTATACATTTT TATATTAAAATGGT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154573; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_359257
Blastp | - |
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Blastx | Chitin elicitor receptor kinase 1 from Arabidopsis with 63.89% of identity |
Eggnog | Serine Threonine protein kinase(COG0515) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G21630) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425563.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |