Id Trinity | TRINITY_DN47676_c0_g1_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_358951 |
Sequence | GCAATATTGATATTCATTTTCATTATTTATCTTTTTTTCATTTTCATTAATAAAACATAGCAATCAAATCTACTTCACTTCTCTCCTCTAACCCCAACAA CCACCAAATTCTTCTCTCTCTCTCTTCATCCCCTTCTTCCTTCTCTCTAGGGTTTCGTCGCAAACTCTCTCACTCATACTCTCACAACGATTCTAGGGTT CCTCGTTCCGCAATTTTCTCTCATTACGTTACCTCTCTCTCTGCGATCCATCCACTTTCGGTTCCTTCATTTGTTTTGTTCTCGATTCCGTTTGTTTTTT TGGTGAGTTGCAATGGACTTGAATGCTTCGCCGGTCCCGGATGAAGAGGAAGACACTTTTGAGGGACATGCTGTCAGAGAGTTTATCGCATCAGAAGAAC GCGTGGAAAGTGCTGTTGATATAGCACGCCGGGAGCGTGAAGAAAGAAAGAGACGATTGAAGAGAGAACGTCCAGATGATAGGCCTGTGCATGTATCACA GTCACCTGGATATGATCAGCTGTTCCATACTAAGACCCTTAAATCACATGATAAAAGCAGGCTTCCTCCAGGGTGGTTGGATTGTCCTTCATTTGGCCAG GAAATTTATTGCATGGTACCTTCCAAGGTTCCACTTGGTGAATCATTCAATGACTGCATTGCTCCTGGTAAAAGATACTCATTTAAGCAAGTGATACATC AGCAGAGAGTTTTAGGGAGAAAACTTGGTCTCGTGATTGATTTGACAAATACTTCTCGATACTATCCTGTTACAGATTTAAAGAAAGAGGGTATCAAACA TGTTAAGATTCAATGCAAGGGGCGTGATTCTGTACCTGATAATTTAGCTGTGAATCAGTTTGTTTATGAGGTTACTCAATTTCTAGTACGTCAAAAACAC TCGAAGAAGTATATACTTGTTCATTGTACACATGGGCACAATCGTACTGGATATATGATCATCCATTATCTGATGCGTTCTATGTCATTGTCTGTTACTC AGGCAATAAAAATGTTTTCTGATGCGCGCCCTCCAGGAATCTACAAACCCGACTACATTGATGGATTGTACACATTTTATCATGAAAAGAAGCCTGAAAT GGTAGTTTGTCCTCCGACTCCAGAGTGGAAAAGATCTTCTGAACTTGACCTCAATGGTGAAGCAGTTCCAGATGATGATGATGATGGAATACCAGACCCT CATCTGCCTGAGAACCATGAGACTGACACACGAATGACAAATGATGATGTATTGGGAGATGAAATATCTAATGAGCAGCAAGAGGCATTCCGGCAGTTCT GTTATCAATCACTTAAATTGAGTTCCGGGGTAAGCCTTTTAAATGGTTGTCATGCATGAGTCTATTGCATACAGCGGTTTGTGACCTTAGTGTTGGAATT ATGATGATTCATTTTGATAATTGTACTGTCAGCTTTCTATTTCTGGTCATTAAATTGCAATAAAGGAATTGGTGGAAAGTATTCTGCTAGTTGCTACTTT ATCATCTGGTCGTATCTTTGTTTCTGACACTTGTTGGACTATTGCGCTTATTATTTGATGTTCTTGGAGCTGTCATTATATGTTGTCAAAATGTTTTTTA TTATATCATTATCTTTCATTCTAGAGGTTTTCCTTCTTGCTTTTGTTAATAATGTGAATTTGTGCTAGGATTTTGTCATTCCTTGGTCCTTCATTGTGGG TCGTTTCATATGCACTCATATTTGTGTGCCTTCTCCAAGACAAAATTGGTTCCTTATTCATATTTGACATGTATGTTGATGTGGACTTGTTTGTTACATA TTGTTGATTTGATTTAAGGGCTAGTAAGACATTTTTTTGTATGAAGAATTTATAGATTATGTTGGGTTTAAATGGTTGTCATGTTCATCAAATGAATAGA TAAATGCGCTGTATTCATATTTAATTGTATGTTCTATGTGGTTTTATATGTGTAAACCTATGCAGCTGATGACAAGGATTCTTTCAATGATTTCCTGTAT CATGCCTTTTCCATTATATTTTTAAGGTTGGCTACATCATATACCTCATATACTTGTTATAGCAGTTTTACTAATTCTTAGCTTACAGGCCAGAGGACAC GCACAATTTCCAGGTTCCCATCCCGTTTCTCTTAACAGGTTCTACTGATCTGAGCCATTAGCATATTATGTTGTGATATGTTATATTAGTTAAACAATGA TTTTTGAGCTGTTATATCTGTGCCACTATACAATTATTTGTTGTGTTGTTATGCCTTTACTAGTCATGTGATTGTGCATAGTGTTGCTTAAGTGCATTTT CTTTATGTCCATCCTTTTTATTTGATGTCTACCAAAACGATTAGTGCTCCTCACCAGGTATAATAAGTAGAATAACTTTGCCTATGTATTTTGTCCAGAG GTTAATTTTTGTAACGCAGTGGACATTTAATTGTACCCTCATATATATCTTCTTGTTCAAATATTGAATACTGCTTGTCTTATGCTAACTAGTCTTATGC CCTATCTCTTAGTTGCAATATATAGAAGGTAAGCGAGTGATTTCTTAAACGCCTCCCTATTCTACCAGAAAATGAAAACTGTCATTCTGTTTTTGGTAAG AATGTAAAATATATGTTGCAACTGAAAAAATTATATCAACTCAAATCATTTTTAGCTAACACCTTATTATTATTTTTCCACATTCCTTAAAGTAATGCTT TCTTTCTAGCCGCAATTACATGCCTATACTCTGTAAACTGGGCATCTCAAGGATTAGATTCTAATTCCTTATGCTTTAGTCTTGTCAAGTTACAGCACTT CCTTTGCTATTCTTTTTTCGTCGGAGGCATCAGTTTTGTTTTCTCTTAATTTCCTAAATGCCTCCATTCCACCTGTCAATGAAAACCATCATCTTTAATA ACCTCTCGTGTATCATTTTTCCACATTTCACATTCCCTACATTAATGCAATCTTCATGCCTGCAATTACAAGCCAATCCTCCAACTTTCAGATACCTCAA GGATCAAATTCTATTTTACTTCCATTTTTCCTATTTTGTCAGCGGCAGGGAATCCATCTATTCTGTATTCTGTTAAGTTAAATCAGATTCTGCATGGTAT AATTGAGAGTTTTTATGGGTCTCTTCGATCAAACTACCTTGTAGCTTTGAAGGTATCTAGAAGTTTAAAGCTGTGTAGGCAGCTGATACTACAACTGTTT GGTAAAACTATTTGTGGAACTAGCTAAAATTTGTTAATTAACTAAAAAGGACATACAATATTTATTTATTTATTAATTTTATAATTATTAGCTGGAGTAG TTAAATACATAGATAATTAAAAATCAAAATTCCCATTCATGTATTTTAATATTTCTTTGCCACAAACTCAAACTAAGTATTATATATATGTGTGTGCCCA TGAATTCATGATACTAGGTTTTGTCTACTCCACCTTTGTCTTTCAAAATAATTAGTCCTATGCGATATGTTTAGTGTTAATGGGGAGGAGATGAAGTATT AGTACATATTGTAGTTTGGGTTAATTAATGTAATTTGGTAAAACTGACCAATGTATTATTGAAAACTCTTATGCTTTTTGGAAAGCTACCAGAAGAGCTT TCTGGAAGCTAGCTTTCAAACGCTGCAAGCTCTCTTCAACTTTGTTTATGTAATGACACTAATATCTTGTTGACTGATTCCAAAATCTACACCCTACTTG ATAAAGTACAAGCTTACTTTTTCGAACAGCGGCTATATGGACTTACTGCCAAATTTTTAAAGACTATTTTTGTGATGAGATATTTTTTTGCCATTATTTA AAAATTAAACTCTTAGAAACAATCTCTTCGCTTGTGAGGGTAAGGTTGCATATATTTGCCCTCTGCAGATTCATTGTAGATCACAGAGTTCAGAATTAAT TAAATTCCCCAAGTAGGATTCTAACCTATGACCAGATAGTTAACAGTGTGGGAGCCTCATATGCACTGGGCCACTCATTTAAAACTTAATCTCTTTTGTC TTGGTTGTATAAAAATCTAAATCTCAAACCAATGATGTCATTTGTTTATACAATTCCTTAGTTTAGTAAATTTAGTAATTGTGTCAGATTGTTAGTGGAT GGCAGGAGTTATTTTTAAGACACCGTTCCTTATTAAGTTGATATTTTTATTTTTAAATTTATATTAAATTTCAGTACTTTGTTGTGCAGGGATAATTTGC AGTTGTTACGACAACGTTATTATTATGCAACATGGAAAGCTGATGGTACACGATATATGATGCTTATAACTAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154574; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_358951
Blastp | mRNA-capping enzyme from Homo with 39.2% of identity |
---|---|
Blastx | mRNA-capping enzyme from Homo with 38.76% of identity |
Eggnog | Second step of mRNA capping. Transfer of the GMP moiety of GTP to the 5'-end of RNA via an enzyme-GMP covalent reaction intermediate (By similarity)(COG5226) |
Kegg | Link to kegg annotations (8732) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432012.1) |
Pfam | Dual specificity phosphatase, catalytic domain (PF00782.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |