| Id Trinity | TRINITY_DN47676_c0_g1_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_358953 |
| Sequence | CTCTTCTCTCTCTCATACCAATCTTTCTCTCTCTAGGGTTTCGTCGCTAACTCTCTCACACACACTGCTCATCACAATCGTAACACTCTTCCTCTCATTC ACTCACTATCGCTTCCTTCAATTTTCAGGCTAAAGGATTCTAGTTATTACAGAAAAAGAAGGGAAGTCGTGTGGTGTTGGGGTTTTATACCGTGGCGGAC GAATGCTGCTTGATGCTTGATGATAGTTGCAATGGACTTGAATGCCTCGCCAGTCCCGGAGGAAGAGGAAGATATTTTTGAGGGACATACTGTCGAAGAG TATTCTGCAACAGAAGAACGCGTGGAAAGTGGAGTTGATATAGCACGCCGGGAGCGTGAAGAAAGAAAGAGACGATTGAAGAGAGAACGTCCAGATGATA GGCCTGTGCATGTATCACAGTCACCTGGATATGATCAGTTGTTTCATACCAAGAGCCTTAAATCAAATGAGAGAAGCAGGCTTCCTCCAGGGTGGTTGGA TTGCCCTTCATTTGGTCAGGAGATTTGTTACATGGTACCTTCTAAGGTTCCACTTGGTGAATCATTCAATGACTGCATTTTACCTGGTAAAAGATACTCA TTTAAACAAGTGATACATCAACAGAGAGTTTTAGGGAGAAAACTTGGTCTTGTGATTGATTTAACAAATACTTCTCGATACTATCCTGTGTCAGATTTAA AGAAAGAGGGTATCAAACATGTTAAGATTCAATGCAAGGGGCGTGATTCTGTACCTGATAATTTAGCTGTGAATCAGTTTGTTTATGAGGTTACTCAATT TCTAGTACGTCAAAAACACTCGAAGAAGTATATACTTGTTCATTGTACACATGGGCACAATCGTACTGGATATATGATCATCCATTATCTGATGCGTTCT ATGTCATTGTCTGTTACTCAGGCAATAAAAATGTTTTCTGATGCGCGCCCTCCAGGAATCTACAAACCCGACTACATTGATGGATTGTACACATTTTATC ATGAAAAGAAGCCTGAAATGGTAGTTTGTCCTCCGACTCCAGAGTGGAAAAGATCTTCTGAACTTGACCTCAATGGTGAAGCAGTTCCAGATGATGATGA TGATGGAATACCAGACCCTCATCTGCCTGAGAACCATGAGACTGACACACGAATGACAAATGATGATGTATTGGGAGATGAAATATCTAATGAGCAGCAA GAGGCATTCCGGCAGTTCTGTTATCAATCACTTAAATTGAGTTCCGGGGTAAGCCTTTTAAATGGTTGTCATGCATGAGTCTATTGCATACAGCGGTTTG TGACCTTAGTGTTGGAATTATGATGATTCATTTTGATAATTGTACTGTCAGCTTTCTATTTCTGGTCATTAAATTGCAATAAAGGAATTGGTGGAAAGTA TTCTGCTAGTTGCTACTTTATCATCTGGTCGTATCTTTGTTTCTGACACTTGTTGGACTATTGCGCTTATTATTTGATGTTCTTGGAGCTGTCATTATAT GTTGTCAAAATGTTTTTTATTATATCATTATCTTTCATTCTAGAGGTTTTCCTTCTTGCTTTTGTTAATAATGTGAATTTGTGCTAGGATTTTGTCATTC CTTGGTCCTTCATTGTGGGTCGTTTCATATGCACTCATATTTGTGTGCCTTCTCCAAGACAAAATTGGTTCCTTATTCATATTTGACATGTATGTTGATG TGGACTTGTTTGTTACATATTGTTGATTTGATTTAAGGGCTAGTAAGACATTTTTTTGTATGAAGAATTTATAGATTATGTTGGGTTTAAATGGTTGTCA TGTTCATCAAATGAATAGATAAATGCGCTGTATTCATATTTAATTGTATGTTCTATGTGGTTTTATATGTGTAAACCTATGCAGCTGATGACAAGGATTC TTTCAATGATTTCCTGTATCATGCCTTTTCCATTATATTTTTAAGGTTGGCTACATCATATACCTCATATACTTGTTATAGCAGTTTTACTAATTCTTAG CTTACAGGCCAGAGGACACGCACAATTTCCAGGTTCCCATCCCGTTTCTCTTAACAGGTTCTACTGATCTGAGCCATTAGCATATTATGTTGTGATATGT TATATTAGTTAAACAATGATTTTTGAGCTGTTATATCTGTGCCACTATACAATTATTTGTTGTGTTGTTATGCCTTTACTAGTCATGTGATTGTGCATAG TGTTGCTTAAGTGCATTTTCTTTATGTCCATCCTTTTTATTTGATGTCTACCAAAACGATTAGTGCTCCTCACCAGGTATAATAAGTAGAATAACTTTGC CTATGTATTTTGTCCAGAGGTTAATTTTTGTAACGCAGTGGACATTTAATTGTACCCTCATATATATCTTCTTGTTCAAATATTGAATACTGCTTGTCTT ATGCTAACTAGTCTTATGCCCTATCTCTTAGTTGCAATATATAGAAGGTAAGCGAGTGATTTCTTAAACGCCTCCCTATTCTACCAGAAAATGAAAACTG TCATTCTGTTTTTGGTAAGAATGTAAAATATATGTTGCAACTGAAAAAATTATATCAACTCAAATCATTTTTAGCTAACACCTTATTATTATTTTTCCAC ATTCCTTAAAGTAATGCTTTCTTTCTAGCCGCAATTACATGCCTATACTCTGTAAACTGGGCATCTCAAGGATTAGATTCTAATTCCTTATGCTTTAGTC TTGTCAAGTTACAGCACTTCCTTTGCTATTCTTTTTTCGTCGGAGGCATCAGTTTTGTTTTCTCTTAATTTCCTAAATGCCTCCATTCCACCTGTCAATG AAAACCATCATCTTTAATAACCTCTCGTGTATCATTTTTCCACATTTCACATTCCCTACATTAATGCAATCTTCATGCCTGCAATTACAAGCCAATCCTC CAACTTTCAGATACCTCAAGGATCAAATTCTATTTTACTTCCATTTTTCCTATTTTGTCAGCGGCAGGGAATCCATCTATTCTGTATTCTGTTAAGTTAA ATCAGATTCTGCATGGTATAATTGAGAGTTTTTATGGGTCTCTTCGATCAAACTACCTTGTAGCTTTGAAGGTATCTAGAAGTTTAAAGCTGTGTAGGCA GCTGATACTACAACTGTTTGGTAAAACTATTTGTGGAACTAGCTAAAATTTGTTAATTAACTAAAAAGGACATACAATATTTATTTATTTATTAATTTTA TAATTATTAGCTGGAGTAGTTAAATACATAGATAATTAAAAATCAAAATTCCCATTCATGTATTTTAATATTTCTTTGCCACAAACTCAAACTAAGTATT ATATATATGTGTGTGCCCATGAATTCATGATACTAGGTTTTGTCTACTCCACCTTTGTCTTTCAAAATAATTAGTCCTATGCGATATGTTTAGTGTTAAT GGGGAGGAGATGAAGTATTAGTACATATTGTAGTTTGGGTTAATTAATGTAATTTGGTAAAACTGACCAATGTATTATTGAAAACTCTTATGCTTTTTGG AAAGCTACCAGAAGAGCTTTCTGGAAGCTAGCTTTCAAACGCTGCAAGCTCTCTTCAACTTTGTTTATGTAATGACACTAATATCTTGTTGACTGATTCC AAAATCTACACCCTACTTGATAAAGTACAAGCTTACTTTTTCGAACAGCGGCTATATGGACTTACTGCCAAATTTTTAAAGACTATTTTTGTGATGAGAT ATTTTTTTGCCATTATTTAAAAATTAAACTCTTAGAAACAATCTCTTCGCTTGTGAGGGTAAGGTTGCATATATTTGCCCTCTGCAGATTCATTGTAGAT CACAGAGTTCAGAATTAATTAAATTCCCCAAGTAGGATTCTAACCTATGACCAGATAGTTAACAGTGTGGGAGCCTCATATGCACTGGGCCACTCATTTA AAACTTAATCTCTTTTGTCTTGGTTGTATAAAAATCTAAATCTCAAACCAATGATGTCATTTGTTTATACAATTCCTTAGTTTAGTAAATTTAGTAATTG TGTCAGATTGTTAGTGGATGGCAGGAGTTATTTTTAAGACACCGTTCCTTATTAAGTTGATATTTTTATTTTTAAATTTATATTAAATTTCAGTACTTTG TTGTGCAGGGATAATTTGCAGTTGTTACGACAACGTTATTATTATGCAACATGGAAAGCTGATGGTACACGATATATGATGCTTATAACTAT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_154574; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_358953
| Blastp | mRNA-capping enzyme from Homo with 38.64% of identity |
|---|---|
| Blastx | mRNA-capping enzyme from Homo with 38.2% of identity |
| Eggnog | Second step of mRNA capping. Transfer of the GMP moiety of GTP to the 5'-end of RNA via an enzyme-GMP covalent reaction intermediate (By similarity)(COG5226) |
| Kegg | Link to kegg annotations (8732) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432012.1) |
| Pfam | Dual specificity phosphatase, catalytic domain (PF00782.19) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |