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ATTGGATCTTCTTCTTCAGAAGTATTCTGCTGCTGCAGACACAAACACAGGAACTGCTGAGGCTGTCAGAGGATTTCGGATGGCTGTTCTTACATCTTTG AAGCATTTCAACCCTAATGACCTTGATGCATTTGCCATGGTCTACAATCATTTTGATATGAAACATGAGACAGCAGCTCTTTTAGAGTCACGTGCAGAGC AATCAGCTGAGCAGTGGTCCCGCCGCTACAACAAGGACCACAATGAAGACTTATTGGATTCTATGCGCTACTACATTGAAGCAGCTGAAGTTCACTCTTC CATCGATGCTGGCAACAAAACACGTAGAGATTGTGCTCAGGCTTCCCTTCTGTCTCTTCAGATTCGAATGCCAGATTTCCAGTGGCTTTATCGATCAGAA ACCAATGCTAGGCGAGCACTAGTTGAGCAGTCTCGTTTTCAAGAGGCTTTAATCGTAGCTGAAGCTTATAACCTGAACCAGCCAAGTGAATGGTCTTTAG TACTATGGAACCAAATGCTCAAACCTGAAGTGATGGAAGAGTTTGTGGCTGAATTTGTGGCAGTTCTACCTCTTCAGCCATCAATGCTGATTGATTTAGC TAGATTCTATAGAGCCGAAGTGGCTGCCAGAGGGGACCAATCCCATTTCTCTGTCTGGCTCACAGGGGGGGGGTTGCCAGCTGATTGGGCTAAATATTTA GGACGATCATTCAGATGCTTATTAAAGCGGACAAGAGATTTGAGGCTGCGAGTGCAGTTAGCTACAGTGGCAACTGGATTTGGGGATGTCACTGATGCAT GCAATGAAGAATTGGATAAGGTCCCGGACAACGCGGCACCACTAGTGCTGAGGAAGGGTCATGGTGGAGCTTACCTCCCTTTAATGTGAAACTTTCTACT GCAGATTATCATATATGATTGGACAAACTACAATTGACATGAAATTGGTTCTTGACTTCTAGTGCTGGTGTGAAATCAATTAAGTGACTATTGCTGCAAA CATGAAGGGTACCTGAGTATAAACCAAAAACGCAGACAAAATGAAAATTGGATGATTAGTTCATATACCTTAGAGCAAGATGTTTATTTACAATTTTTTG TTGATTGAGTAAACACTTGATGGTTGTACATTAGGCCACTGTATCTGTAGCTCATTCTTGTAAACACTGTTCTAGTTTTGTTTTCTCCATATATTTTTTG AAGGGAGGCAGGGAGCATAGAGTGGTTTATTGTTGATTTTGAAATCAGTAGAATAGAATGTCCCATTAATTTATGATGCTGTTCTCCCCTCACAAAGTGT ATAGTGTTCCTGTACATCAATATAAAAAAAAATTCATTTGCCTTGTCTCACAAAATGATAATGTTATCTGCTATCCTTTCAAAAATTAAATTTCC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154798; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_375925
Blastp | Protein DDB_G0268328 from Dictyostelium with 24.92% of identity |
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Blastx | Protein DDB_G0268328 from Dictyostelium with 26.72% of identity |
Eggnog | spastic paraplegia 11 (autosomal recessive)(ENOG410XR4T) |
Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0268328) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019462547.1) |
Pfam | Spatacsin C-terminus (PF14649.5) |
Rfam | - |
GO | - |