Id Trinity | TRINITY_DN47710_c1_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_376229 |
Sequence | CAAAGTTGAGTAATATAATAAGGAGTAAGCTGATATAAGTTTATAAATTTGAAGACTAAGTTATACAATAATTAGTTTTCGAACTAAAATGTATATGGAG AATAATTCCAGAAATTAAGTTGGTAATTTACTCGCTACTTTAAACTTCAAAGTGTGTTCCTTTTTTAGTTTTAGATCATGTAGGTTATATTGGTTGAGAA AATATTTTTAGTTAAATATTTTTGGTTTTGTTTTTGGTGTTGTTATTGCTATGTGGACTATTGTTTGTTGAAGAATGGCTTGTTTTGATGTAGATGTCGG AGCATTTCAACCAAGACCTCTCACTTTCTGGTAAGATTCCAACAGGCCATTTCAATGATGCGTTTGAGTTTTCAGGAATTTGGCAGAAAGATGCAGCAAG TACCAAAAGTCTCGCTTTTGATGGTGTCTCCATAACACTATACGATGTAGCACTTGATAAAACCCAGGTTGTTCTTCGTGATTATGTCAAACAAGCTGTT CCCTCATCATGGGATCCTGCTGCATTGGCGAGGTTCATTGAGAAGTATGGAACCCATGTTATAGTTGGGGTGAAAATCGGGGGAACCGATATAGTATATG CAAAGCAGCAGTACTCTTCTCCCCTGCAACCTGCTGATGTGCAGAAAAAATTGAAGGACATGGCAGATAGATTCTTCATTGATGGAGCTGGACAAAATAA CACAAATGATCGGAGATTTAATGGAAAGCTAAAGGTTTGAAGCTTTCGATTTCGGATTTATTGTTCATCTCTTTCTCTTTTTTGGATTGAAATAGTGATC ATTTCCATAAAGTGAACTGTAAGTCTGTAAAAGCTATCAAAATATTGAAAACATAACAAGTCTATTTTCAGATGATATTGATGAGCCCAAGTTCGACTTG TAGATTGTAAAGTATGTTAAATATCAAACAACAAATAACAAGATATTTTCTGATCTTTAATAAAAAGGATGAGAGTCCTTCTCTACTGGAAGTGTATATT GCTGGTAAAGCAATTGAGTTGTTTGGTAATAAAATACTGTCATTCCATGTTATGGGATAAATTCTGGAAATCTTGGATTTCAACTTCATACATTACAGAT GGTGGTATAGAAGTAATTTGAAGTCCATTTCATATTCTTTAGTAGTGTTTTTGAAAAACGGGAGCGAAAATTGCTACTAGAACATGCTTTCGGCTTTCCG TGTATAGGTAGACCTCTTTTGTAATTTTGTGTGTAGTAAAACTATTCCACATTTCCACTCAGCAACTTTTGTATGCTTCTTCTTTTATTTACTTAAATTA CTACGTACGGCCATTTTAACTCATCATTTTCTCTTCCCCTCCTCTTTTTCCTCAGTTTATGAAGGACAATGAGCTAGGTTTCGTGGACATCCAAACTCGT TCCTACTCCGAATTAGAGGTAAAAACATTTTCATTTTTAAATGAATTTATGGCAGATTCAGGATTCTTCTTGTTATTAGTATTTGCTTTACTGGGAGCAG CACTACCTGGTTTCTTTTTCATGCTTCTATTATATAAATTGTTGTGCAGCATGCTGACAGAGTGTCAGGTGATATGATTGTCTGTCATGGTTTATTTTTG ACAAGTTTCTAGGTTTTCTAACTCACTGTAACATCATTCTTATTGTTTCTTTTCTTGCTCGATCAGCCATTAATATAACCTTGCGTTCTATCATTCTATC CATATAAGTCTAAGTTAATTAAATAGAAGAAACAAAATTAAATTCTTCCACTTATTTTTTTTTCTTTTGTTTAAAATCTTTAGGTGCAGGATATCAAGTT CATGTGCAAGAGAAAAGGTGGAAGTGGGAAAAATGACCTAACCCATAATGAATGGTGCCAAACTGTTTTGTCTCAACCTGATGTGATTTCAATTTCATTC ATGCCAATTATATCTCTACTTAATGGAATCAATGGGAGTGGATTTTTAACTCATGCCATAAATCTATATCTTCGATGTAAGCAAGACATCTTTAGTCATT TATTTGCATTTGGCCCTAAAACCAATTGACCTATTCTAATTCTATTGCAGTGAAGATTGTTTAAGATTAACTGTAAGCTATATATTTTGGTTTATTAGGA AACCATGACCTCTTGGTTTAGAAACATGTCATGTGAGTAATCAAATAAAATTTACTAAAAAGTGGAGTACAGGTGATGAACACTATTAACATTAGATAGT CTTACGGTAGTGAGGACTGAGGATGTCTCCAGTCTTTAAATGGAATTTATAACTTTGAACCCTCATTAGTGGTGCTAATTGACTGGTGATATCAAGTTAG TAACTATGAAGACATCAACCATAGATGTTGTCATGTTGCTTCTACTACCATTATTTTACCATGCTCATTCAGATAAAAGTATTATTTTAGTTAATACTTT TCAGGCTTCTGGAGTTTTTGCTTGTATAATCTAACATTCAGCATTGCATGATAAAGAGATTCTATTATGTTCTTAATCAGTTGTTATAATTTTTGTGTTT GTTTGTCATCCATGTTTAAAAGATGGTGTGGGTCATATTTATGTGTACCGTTATTTAAAATAATTTTGTGTTATTTTATTCTATAATTGATATATTAAAT GAAAATAAACCAACAAGTTACTTTCTATTATTCATTCCAGTCCTTCGGAATGGGTGGGACAGTGGTGTTGGAGACATCAAACTTGTCATGGGCAAACATT ATAGCTTAAGCATTTAGGAGGGCCTTCAACATGGTATTAAAACCGATATGATAAATTTGTCAAGAGTTCCATCTCTGTAATAGGTTAATGTAACTGAAGG CGGCCACTATATGAAGTTAATTCAAAGCATATGCAATTCTCAATCCATGCATACCTGAAGTTATGAAAAAACATGTCTGTAGTAAATTATAATTACCATC CTTTTAAACAAGAAGAAAATATAACCACCATACAATATCTTCGGACTGCAGATAAACCACCAGTTGGAGAACTGCATCAATTTTTAGAGTTCCAGATACC AAGGCAGTGGGCGCCTGTATTTGGCGATCTTGCCCTTGGTCCTGACAGGAAGCTACAGAGTAAAACATCTTTGCAGTTCAGTTTTATGGGTCCTAAGCTT TATGTAAATACAACACTGATTGATGTGGGGAAGAGCCCTGTGACGGGCCTCCGGTTGTATTTGGAAGGAAAGAGAAGCAACCAATTGGCAATCCATTTGC AGCACCTTTCCTCCATTCCCAAGACCTTTCAAATTCAGGATGAGCTGGATGGAAATGTGTCTGACGCCACTTCAGAACGCAGTTACTATGAGAAGGTGCA GTGGAAGAGTTTCTCTCATGTTTGCACAGCCCCGGTTGAATCTTACGATGACTACTCAGTTGTGACTGGGGCTCATTTTGAAGTTGGAGATTCTGGCATG AAGAAAGTTCTATTTCTAAGACTTCGTTTCTCTAAAGTTGTCGGTGCAATTCGTGTCAAAGCTCCCGAGTGGGATGGTTCTCCTGGCTTGACCCAGAAAT CCGGAATAGTCTCAACTTTGATCAGCACCCGCTTCTCATCTGCTGCACAAAAACCACCACCACGCCCATCTGATGTAAACATCAACTCTGCGTTATACCC CGATGGACCTCCCGTATCAACACACACACCTAAACTTCTGAAGTTTGTTGACACAACAGAAATGACAAGAGGACCACAAGACTCTCCAGGCTACTGGGTT GTGTCTGGAGCACGGCTTTTGGCCGAGAAGGGTAAAATATCACTCAAAGTAAAATATTCCCTTTTAACTGTGATTCCACCTGATGAAGAGGCACTAAGTT ATTGAAAATACCACATGAGATGGGTGTATATATGATAGTGTGTCTGATTTGTACATCTGCTCTATTCATTTTAGGTTACTAGTTGATAGATATTGCCATT ATTTGTGTGTCCTTTACAGTGCAGATCTCTTGGGAGAAATTCCATTATGTGGTTCTTGGAAAAGCTTGTATGATCATGCCCATTATGCCTTTTTGTGTGT ATCATTGTATGTGTTTCCATTATGTTAGTGGCTTGGTTATGCAGTAACTATCAATGTTCTGCTCTCAAAAAATGAATGCATTGAGCTGGGAAGTGATCTT TCAATGGGGATTTGGGAAGTGGGAACCACATTAATGTCTTTGCCATGGTTTATTCGTGGTTATGTTCATGTAGTGTTTTTTCCCTTAGTTTTGTAGAGAA CTAAAATTATAAAGAGTGTAATATTTATTTACTGTCAGTGTAAAGATTTATACGCAGCCAATACATTATACACTAGTTATTTGTATTTCTTTTTTTGAAG AGTTAATGATGATAAAATATGAACGGTGGATAATGCAATGATGATGTATAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154812; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_376229
Blastp | MACPF domain-containing protein At4g24290 from Arabidopsis with 70.77% of identity |
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Blastx | MACPF domain-containing protein At4g24290 from Arabidopsis with 70.77% of identity |
Eggnog | MAC/Perforin domain(ENOG410Y9MJ) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G24290) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416771.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |