| Id Trinity | TRINITY_DN47767_c1_g1_i18 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_375298 |
| Sequence | ATCTACTCTACCTTCTCCAACACCAAAACTCTAAAAGTCTCTCTCATCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTTTCTCTCTCCAAATTCTTCAAAGTTTAAATCTT AAACCATAAAACCCCATCAAAATAATAGTGTATGTGTGTATTTCTGTATTTTCATTTACTAAATAAAAATCAAAGTCGTTGAGTTGTATCGGTAGGAAGA CCCCAAGACTGGACGCCGGAGCAAACGCGACAACGAATATGGAAAATGGTCAGCCTAGATTGGCTCATTTTGTTAATGTAGCAACCGGCCGATTCAGTAC CAACTCGGCCGGTTCACCGATTTTGAGGAATTCCGGCAGATTTTCACCGGTCTAGTGCATATCCGGTACAACAACCATCTCGTACCGGTCATTGGTCCGA TTCACCGGTTTTCTGGTTGAACCAGCTGATCAGTGACCAGGAAGCTGTGAAGAAGTTACTGGCTGGACAAGACAACTTACAAGAGAAGGATGATAAAGCA ACAGAAGGCATAGAAAATGAGCTAGAGCAAACTGAAGCAAGTGATCCTAAGAAAAGAAAGTTATGCACATCTGAAGTTGTAGTGGATATCAACTTTTCAT TTTCCGAAGCCAAGAGCAAATACAAGGATGCTACCCTTTTACCAAACTGGAAGGCGTTCCAAACCGTCATATTTCTTGAACGGGCTGATGGTCTGAATGA TTCAAGTAAAATTGCTGCATTTGACTTTGATGGATGTCTTGCAAAAACTGATGTGAAAAGAGTGGGTGCAGATGCTTGGTCCCTCATGTACCCTTCAATT CCTGATAAACTACAAAGCCTATACAATGATGGGTTCAAACTGGTCTGTCCCTTTTATCTGTTAAAGAAAGCGGATGTGGGATTTGTGTCTGACATATACT ATTCATTATTATTATTTTACATTATTTGCCTGCTTAGTTGTGCAGCCTGTATGCAGCTTCTGATGTTAGATGCTCTTTATTGTTATCGTGTCTACTGCAG GTAATTTTCACTAATGAATCCAATATTGAACGTTGGAAGAATAGTAGACAGGTAGCTGTGGACTCAAAAATCGGTCGTCTAAATAATTTTATTGAGAATG TGAAGGTCCCAATTCAGGTGATTTTTGTTGGTGCTAGTACATATATATCTCCTATTATCACCATTTCTAGACATAGGATTGCTTGGATGGGAATGCTTTT ACTAGTGAAACGAAAGCAAGATTGTGTTCAATTTCAATGCTTTCTTTTGGTGTAATAAATTAAATGTTCTTGTTGTTCTCCTTTTTTCACCTGGTAGGAT TAAGCAATAAGGTACAGCTGATGACTATCTAAAGTTGTCAGTTCTTAAATTTCAAAGTATACAGTTTGTCTCAAGTTATTTTTTGTTCTGATTTTGAATC ATCTTTAATCAGTCCAAATTCCTTGCCACTAAAGAACTTTTTCCTAAACTGGATTGGCTAGTCCCAATTCTGAAAATTAATTCAACTTCTCGGTTTGATT CTCTTGTCAGCTATCACTTTACCGAGTAACTAGGTTTTACTTTTACATGTCAACTTATTACAGTATTTTCAAATTTTTGGTTGCTTCTCTTCTAGATTAT GTTTTTTTCAGTAATACATGAGGTGAAGCATATTACTAGGTAATCTGTACTATTTTCAAACCACTATTTAATTCCCCCTAAGAATAGTTGAGGAAGCCAA TTAATGACAAAACAGTTCAGATAAGCTAAAGGAGCAAAGTGAAGGCGAGGCACGAGTCAGTTCAAGCAGACGCCCCTGATAAAACATGGCGTTGGATGAC ACTTTCTGAAATTGAGATATGCGCTCAGGGGGTAACCTGATGTGGTACTTGGCTTGGTGAATTTGCAGTGAACTTTGTCCCCAAGATTTAACAACTTGTC ATAGGGAGGTGACTTGATTATTGTGGTAAGAGCAAAGGCTCATAATTGTGTAATAGTGGGTCAAACTAACAGATTTAAAAAGGCCCATCTGTCTCTTTTT CTCTTTGAGCTTTGGGCGTAGGTTGCTCTGGGCTGAGGACGTCATGCACCTGCCACCTCTGAAAGGTGTTGTAGTGCTTTGACGCTGGGCAGGTCTGACC TCATATTATATACGAAAAGAGGTCCTTTCACTATCAGAGAATTTAGTGCTCTCTAGAAAATTTGGTCTGATATCTTAATGATCACTCTATATGAAAAGAG GTCCTTTCACTTCACGAGAATTTGGTCTGATATCTTTCCGGTCCTCCCAGTCTTTCAAGTAACTTTGTTTATTTTTCTTTTCTGTTCTTCCTACAACTAT TTAGTACATGAGTTTTTTTATTATTTGACCTCATATTCTGAGGTAATATAGTGATTATAGTCTATATTAAAATAGTGGTTTGTAAGTAAAAGCATATTTG CTACTTTTTGATTGTTTGTTTTTGTCAGAGTATTATTACCAATCATCTTCAGTGACAGTCATCCTCATGATGAATGCAACTTTCCTATTAATAAATTGTA TTTCCGTGACTTTCACTTGCAAGAGTAGTCACCTTCAGAATAAATTGCATATTGGTTCTATTTATAGCCACTGGTGTTAAAATTGGAACTTGAACCTTTT GCAAATAATAACATTGCTGCACAGTTCTTATAAAAAAACATTGCTGCACAGTGATTTCTCCACCTTTGGAATTTAGGTAAAAAGTTTCTCCACTGGCAAT TGCATGTTTCATTCATAATGCAACAAAAGATCAAAGCAAATGATTTGTATGGCCCATTTTCCCCAGATAATACTATTTGTGAAGTATACTATGAACTGAC CTAAGGAACAATATTTTATTTATATGCAGGTTTTTATAGCCTGTGGGCTAAGTAAATCTGGTAGAGTTCAAGCTGCCATAAAGGAAGATGATCCTTTCCG CAAGCCCGAACCAGGGATGTGGCAGCTTATGAAACAACACTTCAACTCCGACATTTCCATTGATATGGATCAATCCTTTTATGTTGGTGATGCAGCAGGG AGAGGATCAGACCACAGTGATGCTGATATTAAATTTGCAGAGGCCATTGGTTTAAAGTTTTATGTCCCTGAAGATTATTTCTGATTTGGTCATTGTTGCA TCACATTTGAGGTAAGGTCCAACGTTTGGAGGTGACACTTGTTTTTTGCCTCGTGTAAGTGATTTTACTGACGGGAGGATATCAAGTTAATTTCCAAGGT TAATTACCGTTTTCTCTATCAATTGTATGAATGCATATGATTAGATGGATTAATCATCTTAATGTACAAGACTAATTTGTTTGAAATCCATTATTCCTAT GTTGTTCCTACAATTCTAATATGCTGTGGTTGAGTGATTACAAAAGAAGAAGAACCGTGGTTGTGTTTGGCACTTCTTGTCCAAACATCTTTTTTTCGTA TAATTAAAGATATCTTCTCACTCTATCGGTGTGGAAGCG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_155311; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_375298
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Polynucleotide 3'-phosphatase ZDP from Arabidopsis with 75.82% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449579.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |