| Id Trinity | TRINITY_DN47780_c3_g2_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_376248 |
| Sequence | TTAATATCACTCATTATTTTGAGTCTTTATTCTTACTTTTCCTCATTCTTTTTACCTAAAACCCTCTAATTCAACAATCCTTTCCCCCCAAAATATCCAC AGTGCATTTGAATTGAGTAGTTTCACATGCTATACACCTTTCTTGGATACCACCTTTTCCCGTGAAGCTGCACAAAATAGGAAAATCTGATTTTGAAACA TTTGAAATGCATGCCAATACATGTTTTCAAGTTCGTAGCAATGTTTTAAATGCTGAACTTGTGTATTAGTCTTAATGTGTACAAAAATATCACTATTATT TAAATATACCGAGATTGAACTTGTGAGAGCTCTTGGTCGTAGACTCGTAGTTCTATTGGTTCAACCAGCTAAATAAATGGTTCAACTAGGTTGGAACTAG ACAACAGCAATTACAACCAAAGCCTTTTCTTGGTGTTAGTCATGTTGGCTTTATGGGTTAAACAATGCCACTATGTTCTGTCTACAAATCCAGACAATAT AGTTAAAATCATCAGACCGCAAACATGGATGCTTCAGTCTAATTGGCTGAACCACTTTGGTTTTTAAAACATTTCCTATACCTTAAAATCTATGAAAATT TATACCTATACCTCATATCATTTTGGATATGATACTGGTACGCTTACCTATGCAACTTAAACATGGCATAATTTATGGCTATATATTTTTGTGCTGTGAT TCTAGTTCCCTGTAAACTAGAGTGTAACACTAGTTGAATATTCTTCACAGTTGGAACAAGATGGACTTTTTACAAGAATTTTATTATGATTTCAGGTGAT GGCCATGGAATATGAACTTCGTGCTCTGAGGGATCAAATTCGAGAAAAATCTATATTTTCGATTAAGCTTCAGAAAGAGGTTTGTTGGTATCTAGTTTTA CTTGCTTAATTAACTTTGAAGAAAATCTATTGTCATTTTGACTAGATTTGATTGATCAGTTTTGTATTTCATTGTTGTGATAGCATATTAGTAGTTTAGT CCTTGTAACTCCTTTTTCCAGATGCGTAAAATTATATTTAAATATGGCAGTGAGGATCGGCTAAACTGGTACGATTAAAACCCAAATGTATGAATGGGGC CAGCTCCTTTATCCTTCTTTTTGGACCGATCAAAGACTCACATCAGTTGATAAGGTGTGGCAAGAGCCATTTATAATAACTTGGGAAGCTCTCCTCCTAT GAGCTAACTTTTGGGTGGAGTTAAGCCCAATAACTTTAACATGGCATGGGTTTCTGGGCGAGAGGAGTTCTGAAGTATCAAAGTACTACATCGGCTGAAA ATTGAGCCAAGATTCATTTATAATAACTCGAGCAAGTAATATTTTAACCATTTAACTATGAACTCAAACTCGGTGTTTGTGTTAGTTGAGTACAGTTTTT GAGGGTGGTTGCACCCAAATTTTAGGGGGGGGGGGGGAATGGTTAGAGAAAGAGAAATGATTATCACAGTACTCTGTACCTATAAATAGATAATCCTTGA ATGTGATAAATAGAAATCGGGTGGACATTACAAATTTTAGTTATCCTATTTTTCTCTTACTAAGCAGGTACATTTTTTAACTGTTCATAGATCATATAAG GCAGATGCATAGTCCATTTGTTTTTTTCTATTTAAGTGAAGACTAGAAATACCATATCATGATATTTGTGTCAATATCAACTTAGTTGTATGCAGTTTTA CCTCCACAAGCAGAGATGATGTTTTTAGGATTTGAACTTATGACCTCTAGTTCATAAGGCAGGAACCTACCCGCTGCACCAAACTAACCCTGTCAATAAC GGATGTATAGTTGATCTAAAATGTGTCTCATTTTCCCTCTGTTCTCTTATCTCCCTTTTTCCCCATATGAATTAAGCACTAGATACTAAGTTGTTAATTC TTTGAAATATGCTCTTTCTTGCAATAACTTTGTTTCCTCATGCCAGCTAACAATGAGTAAGAGGGATGAGAAGAATAAATCCCGTTCATATATGTTGGAC GGTTCTGAAGCTTTGGGTTCATACCTGCGAGTCCAGCCTAACTCAGATAAAGTGCCACAGATTTCAAAATGTTCATTTCAGTGGTATCGCTTGTCATCTG AAGGCAGCTGGAGGGAAGTTATTTCAGGTATCTCACTTTTCATTGACTGAGTGGTCTTAGTATACTGTTTTTTAATAGTGGCATCTGTAATTGATTCTGC GGAGTATGAATGTATGATATCCAGCCTGTGAATGACATTATTATCTGTGATTGAAAATCAGCCATTTTGTTTCTGCTTAGAGCTATGCTGGAGATGTAAA ACGATTCACGTGCCTCTGCTTAATGGCTTAAGCTTTCAGGAGCTTTGATCCTTGACATGATAAGCATGGACTTTATGCATATATTCACAAGTTTGTGTAT ACATCGTCCAATCTTCATTATCGAACTATTAAATTTAAGCCCAATTGAAGGGAACTTCTGCATAGATCACGCATCAAGCCCAACAGTGCTCTTGCATCGA GAGTGCATTTGAGATATGAAGTCATTCCCTGTCCTCCACCTATTTAGTGTAATTGTTTTGGATTGATTTGTAATTCTCCACCATGCTTTTGTCGCATGTA CCTCCTAAAAAGGGCACTCAGTGTTCGAGGGTCTCACCTAGTGAGTATGAGGAGGGTAGATGTACATAGTCTTACTCTCGCATGTAGCTCCTATTAACTA CTAATGCACTTAAAAAATAGAATGTAATGATGCCGCCTTTATAATTTCACAGAATTGTTTCTACATTTATAAAGTTCATATTGAATGCTGTCTATGCATC TCATTTGAATTTCTTTATCCTGCTCTTTGAAACAGCTAATTAATCCTATTGATTATTCTCATGTTTTTGTTTATGTTTGTTTGCCTTTAACTATCAGGTG CCAGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_155415; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_376248
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Stomatal closure-related actin-binding protein 1 from Arabidopsis with 53.12% of identity |
| Eggnog | NA(ENOG410XTBS) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G26770) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019458689.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |