Ll_transcript_376282

• Id Trinity: TRINITY_DN47780_c3_g2_i22
• Name Transcript: Ll_transcript_376282
• Sequence: TTAATATCACTCATTATTTTGAGTCTTTATTCTTACTTTTCCTCATTCTTTTTACCTAAAACCCTCTAATTCAACAATCCTTTCCCCCCAAAATATCCAC AGTGCATTTGAATTGAGTAGTTTCACATGCTATACACCTTTCTTGGATACCACCTTTTCCCGTGAAGCTGCACAAAATAGGAAAATCTGATTTTGAAACA TTTGAAATGCATGCCAATACATGTTTTCAAGTTCGTAGCAATGTTTTAAATGCTGAACTTGTGTATTAGTCTTAATGTGTACAAAAATATCACTATTATT TAAATATACCGAGATTGAACTTGTGAGAGCTCTTGGTCGTAGACTCGTAGTTCTATTGGTTCAACCAGCTAAATAAATGGTTCAACTAGGTTGGAACTAG ACAACAGCAATTACAACCAAAGCCTTTTCTTGGTGTTAGTCATGTTGGCTTTATGGGTTAAACAATGCCACTATGTTCTGTCTACAAATCCAGACAATAT AGTTAAAATCATCAGACCGCAAACATGGATGCTTCAGTCTAATTGGCTGAACCACTTTGGTTTTTAAAACATTTCCTATACCTTAAAATCTATGAAAATT TATACCTATACCTCATATCATTTTGGATATGATACTGGTACGCTTACCTATGCAACTTAAACATGGCATAATTTATGGCTATATATTTTTGTGCTGTGAT TCTAGTTCCCTGTAAACTAGAGTGTAACACTAGTTGAATATTCTTCACAGTTGGAACAAGATGGACTTTTTACAAGAATTTTATTATGATTTCAGGTGAT GGCCATGGAATATGAACTTCGTGCTCTGAGGGATCAAATTCGAGAAAAATCTATATTTTCGATTAAGCTTCAGAAAGAGGTTTGTTGGTATCTAGTTTTA CTTGCTTAATTAACTTTGAAGAAAATCTATTGTCATTTTGACTAGATTTGATTGATCAGTTTTGTATTTCATTGTTGTGATAGCATATTAGTAGTTTAGT CCTTGTAACTCCTTTTTCCAGATGCGTAAAATTATATTTAAATATGGCAGTGAGGATCGGCTAAACTGGTACGATTAAAACCCAAATGTATGAATGGGGC CAGCTCCTTTATCCTTCTTTTTGGACCGATCAAAGACTCACATCAGTTGATAAGGTGTGGCAAGAGCCATTTATAATAACTTGGGAAGCTCTCCTCCTAT GAGCTAACTTTTGGGTGGAGTTAAGCCCAATAACTTTAACATGGCATGGGTTTCTGGGCGAGAGGAGTTCTGAAGTATCAAAGTACTACATCGGCTGAAA ATTGAGCCAAGATTCATTTATAATAACTCGAGCAAGTAATATTTTAACCATTTAACTATGAACTCAAACTCGGTGTTTGTGTTAGTTGAGTACAGTTTTT GAGGGTGGTTGCACCCAAATTTTAGGGGGGGGGGGGGAATGGTTAGAGAAAGAGAAATGATTATCACAGTACTCTGTACCTATAAATAGATAATCCTTGA ATGTGATAAATAGAAATCGGGTGGACATTACAAATTTTAGTTATCCTATTTTTCTCTTACTAAGCAGGTACATTTTTTAACTGTTCATAGATCATATAAG GCAGATGCATAGTCCATTTGTTTTTTTCTATTTAAGTGAAGACTAGAAATACCATATCATGATATTTGTGTCAATATCAACTTAGTTGTATGCAGTTTTA CCTCCACAAGCAGAGATGATGTTTTTAGGATTTGAACTTATGACCTCTAGTTCATAAGGCAGGAACCTACCCGCTGCACCAAACTAACCCTGTCAATAAC GGATGTATAGTTGATCTAAAATGTGTCTCATTTTCCCTCTGTTCTCTTATCTCCCTTTTTCCCCATATGAATTAAGCACTAGATACTAAGTTGTTAATTC TTTGAAATATGCTCTTTCTTGCAATAACTTTGTTTCCTCATGCCAGCTAACAATGAGTAAGAGGGATGAGAAGAATAAATCCCGTTCATATATGTTGGAC GGTTCTGAAGCTTTGGGTTCATACCTGCGAGTCCAGCCTAACTCAGATAAAGTGCCACAGATTTCAAAATGTTCATTTCAGTGGTATCGCTTGTCATCTG AAGGCAGCTGGAGGGAAGTTATTTCAGGTGCCAGCGGATCAATATATGCTCCAGACCCCTTTGATGTTGGGAGAATCTTGCAAGTAGACATTGTCTCGGA TGGCAAAAAACTAACACTAACAACTAATCCCATTCAATCTGTTTCAGGACTTGGAAGCCATGTGGAGGCACTTCTACGAAAATCGAATGCTGATTTTAAT GTATGTTATCCACACTCTTTTTACATTCAGTAAATATAACTATTCCTGCTCCTGGCAGAAAAATTATCAACTGAGATAATTCGATACAGAAAAATTAGAA AAATGTTTTTTAATTACAAACAGGAAAAACCTCCATTATTCTGCATACACTTTCCCTTCAAAATGATCTTTAAAGCATAGAGTTAAGTTCCTTGTGTTAA TTTAACATTTTCAGTATTATTACTGTTGCAAACTTGCAACCATGGTTTGTGTATTATTTGACCTTGCTCCTCCTCTTCCGGTCGGTGATCAATGCAACCA CAAATTACAAAAGAAAATACCATATCATAGGACAAGTGCTTTATTCATTTGATCATTTTATGTTGATCAGATAAAGGTGGACGCTCTATTTTTTTACTCA TTTCTATCTATCTATTTTCTCTTCTTCTCGTTCTCTGTTTTCTATGATTGTATTACCGGCTTATCTGATGGTTTGTTTGTTTCGGATTAGGGACATTTTT GGAGCTATATTTCTTACACAGTTTATACTTGCTGTTGTATAGGTAGTAATTTCTCAGATGAATGGAAAAGATCACTCGTCGCGTTCTGTGCATACATTTA GTGTGGGGAGAATGAGGATAAAACTATGTAGAGGCTGGATTACAAAATCTAGAGAGATTTACTCTCCATCAATGCAGCTATGTGGAGTTAGAGGTGGCTT CAGTAATGCAGTGAAGGCATTGTTTTGGCAAGCTAGAAAGGGGCTCTCATTTGTATTAACCTTTGAATCTGAGAGAGAAAGAAATGCAGCCATTATGGTT GCCAGGAAATATGCTCTTGATTGCAATGTTGTGCTTGCAGGGCCAGATGATCTAGTTTAGGAGCAAATTTAATTGACTGAATTTCCAACAAAGTGAGTAT TATAGATTCTTGGTGTCAGTATACATGTGTGCTTGGTTTGTTAAAAGATATGATTGCATCTTTGTAATTGGGTTTCCACTAATTTGGTTGCATTGTTTTA GGCATATTTTTTTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_155415;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_376282

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.8
• PS2: 0.7
• PS3: 1.1
• PW1: 0.2
• PW2: 0.3
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_376282

• Blastp: Stomatal closure-related actin-binding protein 2 from Arabidopsis with 73.47% of identity
• Blastx: Stomatal closure-related actin-binding protein 2 from Arabidopsis with 74.76% of identity
• Eggnog: NA(ENOG410XTBS)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G40820)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019458689.1)
• Pfam: Fused Ig-PH domain of plant-specific actin-binding protein (PF16709.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;