Ll_transcript_442130

• Id Trinity: TRINITY_DN47805_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_442130
• Sequence: TTAGTCGATCAAATACTTGAACCTGGAAGAAGAGTTACTGTAGCCATGGGTACCAACCGCAATTTGGATTCAGGTAACAAGTTAATCTTTGCAATATTTT TATGTTGAGTTCTGCTTAAGACATTCCACAATTTTTGAAAATCTAAATTATGCTCCATGATGTTAGCAGGTAACAGGGGTATACTTAGACTGTGCAAACT TTACTTTTTCTGTTTGTCACATGTGTCTTAGTTACTGCAAGGTTTTGCCCCTCTTCCAGTCTTAGTTACGTGCATTTCAACCAAAAAGTTAATGTGAATG TTAAAGAATTGTTTCACAGCAGTACTTACATAAGCTATTGTTACTAACCTAAAAGGAATTGCTGTATGCCTGTACCTTGATTAATTATTAAGCTATCAAT GAAGAAATTGTATTTATGGCAAGAGAAAATTAAGAGTGAGGTGCAGGTTGTTGAAAATGAGTGCTAAATACATGCAAGTATACAACATCTTGGCAACATG AGTTTGCGCTAATTTACATCTCTGTACTTCGTCTAGATTTACCACGCCAGGTTGTCTCATCATCCAAGCCAAGGGAAGAAGGAATGTATTGGGGATATCA AGTTCGTTATGCGCATAATATTAGCTCAGTATTTAAGGATTGTGCATACAAGGGTGGCTATGATTATATAATTGGTACCTCTGAGCATGGCCAGATTATT AAGTCATCTGATCTTGAAATACCTCCTTTCCGGTACTATTGTTGGCTACTAATTTCTTAGTTCATTGCTGATTTAAACCTTTCTTTAGGGTATGTTTGCG AGTTGGTTTTTTTAGGGGAAGAAAGGGAAAGTGAAGACTTTAGATTTCCTTAGGTTGCTGCTTATTTGTAGAGCTTATCAATTCTAATTTCTAACATGGG CTTCGGAAACCATTGATTTCCTTACCTCCTACTAATTTGTTTTCTTTTTAATTCTTTATATTAATCTAAAATGGTAAGTATCCACATTGAATGGATGACA AACTATCCCATACTCTAAAGAGTATACATCAAAATAGTTTTTGCAAGTCAATGGATCAACATCAACTATTAATCACATTATTTCTCTAGAATCTGCTTGA AAAATAATCTGGCCAGACATGGACTAGGGAATTCTATGCAGTTGTGTTGGGAGTACAGCATGTTGTGAAAATGTTCTTATTATCCTAATATGGACGTTCA CAACTATAAATGTAACTGAACACTGAAGTATGATTTATCTGTTTAGGTTTCCTTTTCTTTGTAATTTCTACTTATTTTGAGCTTCACTCACTGACTGAAT TTATATTATGAAGTTTTAAAAAAAAAACATGCCTGTGATGATGCAAGGTAGTTTAAATGTGATTTATTAATGGTTTGTTTCACTGAATTGGCAGGCATTT ATTGATCGCGTTTGGTGGACTGGCTGGGTTGGAAGAGAGTATTGAAGAAGATGAAAACTTAAAGGGAAAGGATGCAGGGGATGCATTTAGTATATACTTA AATACATGTCCACATCAGGGTAGCCGAACAATTCGAACTGAGGAGGCTATTTTAATATCTCTTCAGTACTTCCAAGAACCAATAAGCCGAACATTGCAGA GTTGATTGTTGTGGTGTTTGCCAAAAACTCATTTAGGATTTTTCACATGGGTAGCTGTTCCCTGTCAACACTTTTGTATTAGTTCAAGTGTTTATGACTG AATCTAAGATGCAAGCAATATTTCAAAGCCAGTATTGAATTTTTTCCCTCTACCTCATCCCAAACTGGCCCTCGGGTCTTAAATTGCATTCTCTAACCGC ATTTAGTGTAGTTTTGGGAGTCGCCATAATTACAATTCGCCAGCCACATTTCTCGCAACTGCAGTACATGCAATGTAATCGCCAACGCGATTTAAAACCA TTGCGGGTTCATCAAGATTCTTTGGGAAGTTCTGATATTTTCTGTTTACCTAGACTGTATAAGTTCCAAACAGTATTTGTTGTTCATTTATATATGTATT GTATTCTTATTAACTCTATTAGATAACTGATATTGCATCTGAACTTAATTTAAAAAGTAATTGAAGGGTGTAATAAGAGAACCATGTAAAGCCATCTGAA CTGATGTATTTCCTAGTGTAGAGTGATTTTTGAGCTGCACCACTGAAAGCCTATAGCTATACTTATATTCCTAGGAGAAGCATGTAGCCATGTGGAGAAT GTAATAAGAAATGCAGAATGGTCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_155623;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_442130

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0.2
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_442130

• Blastp: -
• Blastx: Putative methyltransferase C9orf114 homolog from Mus with 59.02% of identity
• Eggnog: chromosome 9 open reading frame 114(COG2106)
• Kegg: Link to kegg annotations (227695)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019441569.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;