Ll_transcript_441387

• Id Trinity: TRINITY_DN47817_c4_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_441387
• Sequence: AAAAAGTTCAGTGATTAAAAGGTTAAACCCCACTCTACAACTGAAGAGTTAAACCTTATTTTCTCTGGCTTGTTGGAGATTTCACTCTCTAACATCAAAG CTAGCATCTTTCTTCAATCAAGCTTCTGCCACAGAATTCATTCTCAGTATGAATAATATTCGCAGTGCTGATTAAACCAATTTCTCTTTTCTTCTATGGC GCAACGAAGCAGATGACTCTCCCATCCCCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCAGTATTTTAGCTTCTAAGATAGCCATCACCCATTACAGTGTTCATACTCAGG TAACACCTTTGCCCCACGATAAAAGTTTAATCATAAGAGCTGAAGCTTGGTTTGTCAAAATCGTTTCCACTATTTTTCTTCGCTATAGCAACTTGGATAA ATTTCTGGGTTATTTTAGTCACCACTTAACTCCATCACTTGCGTTTGAGGTTATTAAAAGAATCAAAAATCCCAACTTGGGTTTCAAGTTCTTTCAGTTT AGCAGGGAAAGGTTGAATTTTTGTCATTCATTCTGGACTTATAATATGCTTTTGAGGTCCCTTTGTGAAGTTGGTATGCACAACTCAGCAAAACTTGTAT ATGATTCTATGAATTCTGATGCCCAATTCCCTGATGGTAGGTTGTTAGGATTTTTAGTTTCTTCTTATGCAATGGCTGGAAGGATCGATATTTCGAAAGA ATTACTTGCTCAAGCTCACCGCAATAATGTTGCAGTGGATGCTGTGCTTTATAATAACTTGTTCAATGTCCTGGTAAAACAGAATAAAATAGACGATGCC GTTCGTCTACTTAGGGAGCTTATGAGATTACGTTATAATCTGGAAACCTTCACCTTCAATGTTTTAATTCGAGGTTTGTGTAGATCGGGAGCAATTGATG AGGGTTTTAAGTTTCTCGCTGATATGACAAGTTTTGGTTATTCCCCTGATATAGTTACATTTAACACTCTTATACATGGTTTATGTAGAATTAATGAGGT TGATAGAGCACAGGAACTACTAAAGGAAGTCTGTTTAAACAGTGATTTTACCCCTACTGTTGTAAGTTATACAACTATAATATCAGGTTATTGCAAATTG GGTAAGATGAAGGAGGCTACCTCTCTTTTTGAAGAATTGGTTAGATCTGGAGTTAAACCTAATGAGGTTACTTTTAATGCCCTTATTGATGGGTTTGTTA AAGTGGGTAGCATGGCTTCTGCACTAGCAATATATGATGCAATGCTATTTCATGGTTGTCACCCTGATGTTGTTACTTTTACTTCCCTTATCGATGGTTA TTGCCGAGTTGGACAGGTGAACCATGGCTTGGAGCTGTGGCGTGAAATGAATGGGAGAAATATTTCTGCGAGTTTGCATACATTCTCTGTTCTTATTAGT GCTTTGTGCAAGGGTAATAGACTAAAAGAAGCGCACGGCCTTTTGAGACTATTGAAGCATAGTGACATTGTCCCACAGGCGTTTATATACAATCCCGTCA TCGATGGATATTGCAAATCTGGAAATGTCGATGAGGCTAATATAATTATGGCAGAAATGGAAGAGAAGAAGTGCAAACCTGATAAGTTGACATTTACCAT TCTTATTATTGGGCATTGTATGAAAGGAAGGTTACATGAGGCAATTGATATTTTTTACAATATGTTGGCAGCTGGTTGTTATCCCGATGATATCACCATT AGAACTTTATGCACCCTTCTTTTGAAGGCTGGAATGCCTAGCGTGGCTGCTCGCATTAAAAAAACTCTATTTGAGAACCAGACCATAGACATTTCATTGA AAAAATCTTACCATGAACGTACAAGGTCAGATATGCCAAATTCTGTGAATTAAAGTGCTACAGTGGCAAATCGCTGGTTAGACATTGCCTCTCATTGTTT GCCCTTAAGGAATGCAGTCATCACTAAGTGTGTAACTATTTTATGAACAATTCGAGCAATTGAAAATGAATTGCCTATTCCTCTTAGATTCTCCTCATCT TTTGGATCTTGTGGGTAGGTTGATTTTCTTTCTCATTTGAATGTGTGTTACTCAAAAGTATATAGATTTGTACCTGAAATAAATTAATGCTGTAAAAATG TATGAAGATTATTAGTGAGGACTTACAGAGATGCGGATATTTGAAAAGTGTCAGGAAGGAATCCCTTTGGCTTAAGTGTGGTAGTGTACAATAACAGAGA GGTGGTTGTCTAATGGAATTCTTCAACATTGTTCTAACCCACAGTTTTTGTAGAAATGTTTACTGTATAAGTCAAGCTTTTTTCGTTGGTTATAACGTGC AATTATTTTCACAAGTGTCGACCCCGGTTCTCTTTTCTTGTTCTGAAAAAAACAAGCTGCAACTAGCACCAGAAATTGAACAATGTTACGTCGAACCAGA AATTGTTGACGGCCTTGATATCAGTTGGGCTTTGAGTATGGCCACCGAGTTGGATTGCAGCAAATCAACAATTGATTGTAGAGACAGATTCAAAGATTGT TTTTTATGCTTTGCAATGGAGGAGTGCTCTCCAGAACTTGATATTATTGTTAATGATGTAAAGAGGAACTTTAACGTTCCTGCTCATTTGTTAACAGCAT TGGAATTAACTGTTCTTATACGTTTCGTTGTGATACTTCTCCATGTCATGTATGTCTTGTCATTGAGATGTTTTGGTACAAACAATAGTCTATACACTTA ACCTAACGAATGCATATTTAGTTTAGTTTCATTGTATGTGTTTCGTTTAATTAGGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_155748;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_441387

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.4
• PS2: 0.4
• PS3: 0.7
• PW1: 0.5
• PW2: 0.8
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_441387

• Blastp: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g06000 from Arabidopsis with 49.9% of identity
• Blastx: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g06000 from Arabidopsis with 49.9% of identity
• Eggnog: Pentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G06000)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019462698.1)
• Pfam: PPR repeat (PF01535.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;