Id Trinity | TRINITY_DN47826_c2_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_442307 |
Sequence | CACAAACCCTTTCAACACTTCACGTGATTTTTCTTTCCTTCATGGCTCTTCACACCATTTCCCCCATCTTCCACTTTTCCCCTCACTTTCCCTCCCACTC TCCTCAATTTTCTCTCCAATTTCCTCCCACTTTCTCTCACAACCCTCGAAACCCTTTCCACCGCCACCACCACCTCAGAGCCTTCCGAGAATGGCGAGAA TACGAAGATGCCGTCAAGCGCAAAGACCTCTCCGGCGCTCTCACCTTCCTCAAATCCCTCGAAACCGAACAACAACAACAACAACAACTAGAACCATTCG GCGAAGATTCTTTATCTTCGCTCGCTGAGTCGACTCGGTCCCGGTTTCGCGAGTTGGAGCGGTTTGGACCGCAGAAGGATTGGGAGATTCTTGATACGTG TTTGAATGCTGATGATATGAAACTTGTTGGGAATGCTTATAAGTTCCTTAGGGATAAAGGTTTTCTTCCCAATTTTGGTAAATGTAGGAATATGGTTTTG GAGGGAACGAGGAATGTAACACCGGATGTCTTGACCGCCTCAACTGGTTTGGAAGTTACTAAATTGGCTCCAAAAAAGTGGGGTCTTTCAGACAGTTCAA GCACTGTCTTGGTTGCTTTTCTTGGCACGATGTCCTTTCTTATTTCACAAGGAATTGATCTAAGACCCAACCTTGCAGTTATATTAGGTTTAGCCACTAT AGACTCTATATTCCTTGGTGGTACTTGCCTAGCTCAAATCTCGAGTTTCTGGCCACCACATAGGCGCCGAATCCTCATTCATGAAGCGGGACATCTCCTA ACAGCTTACCTGATGGGCTGCCCAATTCGAGGAGTGGTTTTAGACCCAATAGTTGCAATGCAAATGGGCATTCAAGGACAGGTATGTTTACTCTTTTGTT CATAATATAACATTTTATTGATTCAGTGGTTCCTGTTGGTGGTACCTTAGATTACAATTTCCACTTGTAATTTCAAGTGAAATCCATGATATTTTTTATA AATAAAGTTTTTTAAGGAGAGGGGTGAATTGTACAATTGTTGGGGTTTGAACTTAGATGCTAACCCTTTATGTCCCACAGTTTTACCAGTTAAGCTGACT CTTGGTGACACTTGATATTTTTTATTGACTATTGAACCATCGAGTAGTTATCTATTTTCTCCCTATTCTTCCCCTCCCGCCTTGCCTATTTCTAGATCTT TCCCTCCTTTCTTTCTCCCTTTTCACATCTTCCCTTCTTGTACTTTTTTTCATTCATCCTACATAGACACAATAGTAAAGTTTCTACGTTGTGACCTAAG AGTGAGCCTTGGCGCAATAGTAAAGCTTCTACGTTGTGACCTGGATGTCACTGCCTCACCAGTTCAAAACATAGACACAACTTCTATGCCTGCTGGTAAG GCCATATACAACCATGTGGGTGCCTTGTGCACTAGGCCACCTTCTTTTCTCTTCATTCTCTCCCTCTAGACAGTTCTGTTTCAGTAAAATGTTCTCCAGC ATAAGGGTTAGTTTAAATGTGACGCACCATTGAATTGCCAGTGGAAAAGCTTAATAGATAACCAAAATCTCAATGGTGTTTCAACTGCTAGCAACAACAA TATTATCACCATTAAGGCGGACAATGGCAATGAGGTTGTTGATGAGCTGAGGGATTGATGTTGTTGCAACTATGTATGAGATTGTTTAACTTATAGTCTA ACCAAGCTTTGGCTGATGAATTTTTCATGGAAGGAGAAGGATAGTCAGTACTGGCTGGATTCATAACTGAAACAAGGATGTCAGCTGTAGTAATTGTACT TGGAGCCAATGTTTAAATTGTGGTCATTGTTGCATTATGTTGCGTCTACCACATTTGCAGAAAATTGTGGGAAAATGTGGCCGATGCAGTCACAATTGCA ATCGTGATGCCATTGTGGAGACTCCCAAAACCGCAACATGATAGCTGGAATTGCGGTTGTGGAGTGCAATTTAAAACACTGCTTGATGCTATCGTTTCCT TTGATTTTCTGCTCTGGATAAAGGGCAAGTCATCATCTGGATGTCGCTGATTGGTATACTTTGATGAGGAAGCCTGAGATAATCATTGGTTGAGTTTCAT TTTAGAGGGAATGCTCATTTCACCAATTCTCTTTCAGATTGGAGGCAATGGTGTAAAACTTGTTGTTCACAATGTTCTGGAGTGGAGGGTGAAAGGAGGA GAAAGGAGAAATTAAAATGAAAAGGAGAAGAAAGGCACTATGTGATATGCTGTCAGATGATGTTTTTAAATGAAGTATTGAACAGTCAATTTTCATCCTT TTTATATGCGCTCCAAGGATATAGCTCTTCTAAAGCGAGATTGTCTCTAAAGTGAGTAAGATTAAGATTAAGATCAGAATACAGATTAGCAAATCTACGA CGCATACACCCTTGCTCACTTTGGAGACAATCTAACTTTAGAGGAATCAAATCCTTACCGCTCTCATCTCTAATGATAAAAAACACTTCGCTTATTTAAT ATGCCATATTTTTTCCTTTCTCTCTCTATTTATTTATAGGGAGAGAGGAAGAGGGACATTGTTCATTTTAAAGCTTGAATACAGAATATAGTTTTGAAGA TATGTCTGTAAGTAAAGTTAGGCCTTGGATCTGACTAAAGAGAGAGAGAAGAGATAAAAAATCTCCTTTAATCTGTCTCTCTGGGTATGACTATTTGTGT GTGAAATATGGCTGAATATTTCATTCATTTAATACAGAACTAGTGTAGTTTCAGTTGATTCTTGAAAATTGAAGTATCAACACTAACACGTCACACACAC ATATCAATAAATTTAAGAAAAAAGATTCATAATATCATATATATATATAGGGAATCACTCAAGTGAGAAAAGTTCTCATAAAAATTGCGTGAACAATAAA TCTGGACCGTACAACCATACATGGATTTAAGATTAAAAGTTATAGATATAAATATATAAGGTTGAAGGTTTATAATATCTTGATATATGTCTCATGGGTC AATATTTCCTATATTATAAGCCCCTCTCGGAAAACATGGAGCGCCATTCCTATTGACACTTCGCTACAAATCCTAAATTAACTTTTCCTAGCAGAACTAG TCTTGTACAAGTACATGTACGTTGAAAAATAATAATACTAGAAGAGACTGGCCCTGCATCCATGCAATATTCATGTTTTACTTGAATTTTTTTGCTTTCA AGTTAGAAATGTATTGGTGTGCGTCAGACAGCTGTTGTTCTACAAAACAATGACATCAAAAGGATGTGTTCGTGCCTCGTCAAATAGTATTTTAGAAATT TAGTGGTCCATGGATGAATTCCATGGTCAAGCAGTGATCTCATCAGTAATGGACTATTTCTATTAACAATTCATTCTTGTTTACTTTTAATTTTACTTTG TTGCACTACATGCCTCCTTATTTTCAACTGTGTTGTTTTACCATTAAGTATTTAACATCATTTTAGTTGCAGTAAATTCTTACTTTTTAGGCAGGGACTC AATTTTGGGATGAGAAAGTTGCCAATGACCTTGCCGAAGGACGACTTGATGGCACAGCTTTTGACAGGTACTGCATGGTACTCTTTTCTGGCATTGCAGC CGAAGCTCTTGTTTATGGTGAGGCGGAGGGTGGAGAAAATGATGAAAATCTATTTAGAAGCATATGTCTTCTTCTTGAGCCTCCATTATCTGTAGCTCAG ATGTCTAATCAAGCAAGATGGTCAGTTTTGCAATCTTATAATTTGCTCAAGTGGCATAGGGCTGCTCACCGAGCTGCCGTTAAAGCATTGGAAAGTGGTG GCAGTCTGAGTGTTGTAATTAGGAGCATCGAGGAGACTTTGTATTTCGAAAAGTGAGCCTTAAAAGTTTCTATGGAAGATAAATTTCTTTTTTGAAGTTC CTTACAGATGCTCATGTATTGCACCTTGCCTACAATTGGAGACAGCAATAAAATGAATGGTTTCTGCTTCAACAAGTGACCTTTTTGTTCAGATACATGA GCTGCTCTCAAGATCCACTCCACATGAATAATACTTACCAAAAAAAAGGGGTGGGAAGTGATCATTTTCTGAATACCTAATACCAGTGGAGACAAAGTGA TTGTGAAAATGGTAGCATATCCTCAGAGTAACTTTGAACATTGCAATTTTTTTTGTATATGCCTGTATTATTGCCCAGAGTTGAAATCAAACATGATTCT GCAAAATGGTCTGTAAATAACTACTTGTTTTTTGATATATGTTTTTTGACATTGTGTGCATTTTTTCATCAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_155838; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_442307
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456680.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |