Ll_transcript_442850

Id TrinityTRINITY_DN47854_c8_g2_i4
Name TranscriptLl_transcript_442850
SequenceCTTTCTCTTTCTTTACCTTTTCAACTTTCAACCCATTTTTCTTTCACTTCAAATTTTTAATCTTTTGCATTCAAATATATCGTTTATGTCTTCAGTTTTT AGATTGAAATATGGGTTTTCGTTTTCCCAATGAACAAGATCAGTTTTTTTGAGTTAATGTTCCTTCAACCAATGTTCATGTATTAACTATCTTCTTATTG CAATTATTCCTTTGATTCTTATTTGATAATGCTTATAATTTAGTGTTTTATTTTTATAAAAAATATGATTTGATGGAAATAATTGGCCTATTGTTTGAGA TAATGAACTATAGCCAATGTCTTCTCCTTTTTGTTTGATTTGGATGTTAATTATAGGATTTGATAAGAGAAAACAATGTGTGTCTATGTTATCTTTAAGT TGAAGATTGTATAACACAACCAACGGGTGGTTGGTTCAAGTGGTACATGTTTGTTTCCCTTTGAGCAAGACCCGAGTTTGAGTCTTGTGTGTGCGGAGGA AAACTCGTTCGAGTGCTAGCCACACTATACTATATATGTTCTCGGCTCTCGAACAGGGTTGTCTATGATGTTGGTTGGTATGATTAGCACACTACATCTC ATAAACTAAACCCATATTAGGATGGTTGATTTATTTGATTAATAGTATAGGTTTAATTGATAAAATTGTAAAATTTCCTTTGATTGAGTTAACTATAATT GCAGCCAATAATTTATAATGACACATGATAAAAAATCATTGTTAGTTGCTACCTAACCATAGCTACCACGTATGTACAATAACAACCACGCCTTTATCTC ACTAGGTGGGGTCGGCTAGCTACCATGTGTATACAAGTTTGTAAATTGTTTTGGGTTAATGGACTCCCGGAATGATATCGTAATTCAGGAAAATGCTATA ATCTTGTATTTCAGCATATAATATGTAATTCGGCATATATTATTGTCTGGATTTGAGATATTAGGGATTTGCTTAGAGTGCAGTTGTCCTTCTATGCATG GAAATATGTAGGATAACTCCAAGGGATCCAACCTCTGAATTTTTCTTTTTAATATGATATCTTTCATTGTTCTTTTAAACTTGAACTATTCACCATATAT TTATGTCTTACTGCTATGCTGGATTTAACATTAGAAGGTCGGAATTATACGATAGTTCGTGCATCGATAGTTTTTCTTTATTTTTGTATTACGTTTTCAC TTTTTTTTTTTTACATTTCCAGTTGTAGCTGCTGGTGCATTTGATGAACAATTCTTGATAGAATAATTCCTTTTGTTTTTGTTATTGAATTCAGGTGAGG ACAGGATCCACAATGTTTTCGTTATTGCAAGTACCTAGATGCAGAATTCACTGCTTAGCTAACTATTGGGGTGAAACATTCCACAGTTTCAATAAGACTT ATGGAGACAATTCTAGTACTATCAGGTTGCTTAGTTCGAAAACTTACGGGCTTCAGGGAGGGCAAAGAAAGAAGTGGACTAGAAGACCGATAACTACAAA TACCGAAGGCACTGGGAGAACCAAATCAAGAAGTACCAAGAATGAAATTTTGAGTGAAACAATTTTAACAAGTGCTACTGTAAATGTACATAAAGCACCG ATAGATCAATCACAGGCAATTCAGGACTGTGTCATACAACAAGAGATTGCCCAGAATAAAGATTTATCTAGCTTAGTCACCGTTATTGTTTTTGACATCG AGACCACCGGGTTTAGCAGGGAGAAGGACCGGATCATTGAGATCGCACTTCGAGACCTTCAGGGTGGTGAGAACAGCACTTTCCAAACTCTTGTAAATCC TCAACGGGATATTCTTAATTCGGAGATTCATAGCATTACTACACAAATGGTCGACAGACCTGATGTTCCAAGGTTACCGAAATCTCTATAGCCCTTGCGT ATTTTGGATTCCTTGGATTATGCTTACCTTTTCAAAATGAAGTATTTTTCTGACTATTATGGGGTCCTATTCATCCACTAAAAAATGCTTGGTTTTGTTA CTTTGACAATCAGAAAAGAAGACTCATACTTTCAATAAAAGACCGATAAGATGATGTTATGTTTTACCTTTTCAATTTATTCAGATGTGTTGTTTGAGTT GTCTTCTTTTTGTGCTTTTCTGTAGGATGGAGGATCTGGTTCCCATTTTAATGCGCTATGTTCAAAGTCGTCAGAAACCTAAGGGACATGTGTTATTGGT TGGTCATAATGCTCGAGTTTTTGACGTACCCTTCATCATTCATGAGTTCCGTCGCTGTTCTACAGAGATTCCTCTGGATTGGCTGTTTCTGGACACAATG TCTTTAGCTCGTGATCTGAGGAATTCGGATGGAACCAAACTTTCTTCGAAATCCCTTGCTGCTCTTCAGGAACTCTACAGAATTAAAGTCGACGGAGAAG CTCACAGGGCTATGGTTGATGTGAACACATTGACGTCGATACTTCCTAGGTTGACATATGATCTGAATCTGACCCTATCCGACCTCGTTTTCAAGAAATC ATTCAGAGGATCGGATATTGTCGATTCGAAGAACAAGAAGAAGAGTTCATAATAGTTTTCTAACAGTATTTTGTAGTGTTATTGTGACCAAAGAATTATT TGTAACTCTAGGAGTTGTATAATTGAAGTGAAAAGAAACATTGTTTGTAATTGTTGACATATTATTAAGAGTAATATACATGGTTATTATGTTCCAAATA TCATCATTGTCAATGAGATTTATGATTATTTAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_156098; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_442850

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_442850
BlastpExonuclease DPD1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 50% of identity
BlastxExonuclease DPD1, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 50.38% of identity
Eggnogthree prime repair exonuclease(ENOG4111YSP)
KeggLink to kegg annotations (AT5G26940)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019419638.1)
PfamExonuclease (PF00929.23)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;