| Id Trinity | TRINITY_DN47875_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_443584 |
| Sequence | CAAATCTGTGTGCAGATTATAATCATATTTAAATATAATCCTAATCTAAAATCATAAGTGTTCATATTTTTCAGGTATAAATTGAATCTATCCCTGCAAA AGTTTATACTTTATAGATTTTCCTAACATAAACCGTTGAATGATGGTATATATCTGAGTCCAATCAATTTCTCAAACCCTTTTAGTTATCGTCTCCACTA ACTACCTCATCCTACTCATTCATTTCAACGCTTTTTCCTCCTATTCAATTTCAAACAAACCCATCTCTGCATAGAGATTCAACTTTTTTCCATCATTCTA AGACAACCCAATTCCGTAAAATTCATCAAAAGCCATTCAATTTCCTATACAGCAATAAAAATCGCTTTTTTATTATCCTTCTATTGGCCTTCAATATGGG GAGGACCGGATTATTTGATCTTGAAAAGCATTTTGCTTTCTATGGTGCATATCACAGCAACCCAATTAACATAGCAATCCATGTTCTATTTGTTTGGCCA ATTTTTTTCACAGCCCTTATGATTCTCTATTTCATCCCTACATTCTTCAATATTCCGAATTCTTTGTTGCAGCACAGCTTGGGTTTCCGCTGGCATGGAA GGTAAACCAGGTTGCTGGGTTTTAAATTTTTTTTGTTTTATGAATACAATTGAATAAGATCACGGGTTCAAATCCGAGACACAATCTCTCCACTCGCAGG GATAAATGCGAGCATAGTGCATTGAGCTGCCTTTTTTTATGAATACAATTATTTTAGTCCATGAAATTGTAAGTGCATGTCATATTAGTTCCAAATTGTA TATAAAAAAATATCATTTTAGTATCTGGATTTACACATAATGATAGTATTAGTGCCTGAAATTATACTGTGATAGTTAAAAGGTCTCTATAATATATAAA TTTCTGGGACTGATATGTCATATGAGTGATGTATGTGTTTTTAAGAACTAATATGAATGATATTTATACTTTTAGGGATTAGAATGATAACTTCTCAAGT TAGGGTCTAGGATCATAAGTATTAAGTAAGTATTATTTGAGGGACTAATACAATGGTTTGCTCATGTTTTATTGATATGTAAATGTTGTTCTATTTTTTG GTGAATTTCTTTGTGTTTCATTTTAGCTGCCAGTGACAGCTACATTTATTTGTCATCTCAGACAAGTAACTTTAAAAATGGAAACTACATTAGCTTAAAA TTTCTTAAATAGGGATAGTCCAATGTTTTGTTCAACCATTTTCTGAACTAAAAACTTCATGGCATGTTGACAAACATAGTTATCTTTGTGGCTCAGTGGA TGCCACTAGGTTCTATTAAATTTTGAGTAAAGCTTTCTTAAAATTGTTTCTCATGATACACCCATAATCCTACCCAGCCAAAAATCCTTTTACTATAAAG GTTCTCTTCACAACTCCAGTTAACAATTAACTCATTCTTTTGGCCCCATCAAAAGAAAATACTTTAAGATGGATGAAAAGAAAATACCTTACTATGTACA TATTGCATTTACATAATTATGATGTCTGTTTGTTTTTAATGATGCCTTTGTTTTGTTTTTATTTCCCTCTTTCATTCTTCCTTTCTTTTTTTGGGTGGTT GAGTAATGCTAAGCCCTCCTAATTTTTTAGCCTAAAATTCTCCTAATACTAAATAAAAGAAGTATTGAATTAAAGAGTAAATGCAGTCAATGTCAGCATT CAATGTTTTCTTTACATAGTATTAGGAGACTTCTAGCCTTCAATTTTAGGACGATTTTGCAATTATTCATTTAGAGGAAGAGTGTTGCTTGCCTTGTGAC CTGAAGGTCTTGGGTACAAATCCTGGAAACATCTTATTCAATTACATAGGTAAGGATGTGTACATCAACCCTCCCTAGACCCTACTAGGTTGGAGCCTCA TGCATCCCCTGTTTAATTAATCATTTGCCATTTGCATTTTCTGTTTAATGAGCACAGATAACAGTTACAGCAGAATTGGAATAAGAAAAACCAAACCCAC CTAAGTTCTGGATATTTTAGTTATTAGTGATCAGATAGTATCCACTTGTCATAGTTTGTTTATGTTTGCCTAAATTTCTTTTTGTACTAAACCATATCAT TATGTTTGTTTGCATGTACTCAGACCAGGATACAAACCTTTCCTGCCTATTGCATTATTTGCTTCTTTATGAAAAAAGGTGGTACAATACACGAGGCTCC CACTTAGTGGAGTCTGAGAAGGGTAAATGTACACAGTCTTACCCCACAAGCAGATAGGCTGATTCCAGGATTTGAATCTGTGACCTGAAGTTTGCATTTT TTTAAATTATTTATAGGTTGAATAAGAATTACAAAGGTATCATTAAGTTATTTGGCTTCCTAACTATTTGTTTCGTTTCTTGGGTATAGAAATCATCAAT TGTTTCTTGGACAGGTAGACTAATAGCTAACAAAACTAAAAAAAGAGAATTTAGATAACGTGAGGGAGAGTGTGAATAACAGACATGGCATATATAATCT TACTTATCCTACAAAGGCTGATATTGGTTGTGTTTTTTACTTCAATAGAGGTTTTCCAAGAGTCTAAGTGTCTAACATGTTAGGTTTGAGAACAATGCCG TGCACCGCTAGTGAAAGCAGATCTTACAAATGCCTTGAAATTTATGATTACAGAAATTGAGTCATTTTTTCTTAGTATTACTTTTTCTTGTAATTATGGG TATATCTTATTCATTGCCCCGCATCTGCCTTGTACTTTTATGTCCTTTTAATGTTGTTGCAATTCTAACTCCTCTCAAGCCCACCACAAAAAATTCTTAT CTCCTTGGGCTAATATCTTGGAATGACAGCTTCCTCTGGCATTCAGTAGCTATGCAGCTCTTTTTGTTAGCGAGATAAGATAATGCTAAAGACTAAAGAT GTTGTCAAATGCATACATATACATCAACGACACATTTGATCTCAATTCTCAACAATATTGTATGTAGGTTGTTCTGGTGGCCCAGATAGTATGTTGGACA GGGCAGCTCATTGGTCATGGAGTATTTGAGAAACGAGCACCTGCCCTTTTGGATAACCTCGTTCAGGCCTTCGTAATGGCTCCTTTCTTTGTATTGCTAG AGGGTCTCCAGACCTTATTTGGTTATGAGCCATATCCAGGATTTCATGCAATTGTGCAAGCAAAAATAGAAGCTGACATCAAACAATGGCAAGAAAGCAA ACAGAGTCTAATTTCTTAGCTTCTGCATGGGTTTGTGTATATTTATTGTTAGATGTTAATTGATCTCCCATTAGCAGATGAAGATAAAGCTATAAATTAT ATAATATGTGTGGATTGTATTGGTATAATGCTTAATCTATTTTCATATAATTTTACATCTTTGTATTGAACTCAATACATCAATACCACTATTATGCTAA TTGATGTTTTCTTACAGAAGCATCAGCCTTGTGTTTTAAAAAAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_156257; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_443584
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Uncharacterized endoplasmic reticulum membrane protein C16E8.02 from Schizosaccharomyces with 41.76% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (SPAC16E8.02) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020236735.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |