Id Trinity | TRINITY_DN47875_c0_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_443587 |
Sequence | CAAATCTGTGTGCAGATTATAATCATATTTAAATATAATCCTAATCTAAAATCATAAGTGTTCATATTTTTCAGGTATAAATTGAATCTATCCCTGCAAA AGTTTATACTTTATAGATTTTCCTAACATAAACCGTTGAATGATGGTATATATCTGAGTCCAATCAATTTCTCAAACCCTTTTAGTTATCGTCTCCACTA ACTACCTCATCCTACTCATTCATTTCAACGCTTTTTCCTCCTATTCAATTTCAAACAAACCCATCTCTGCATAGAGATTCAACTTTTTTCCATCATTCTA AGACAACCCAATTCCGTAAAATTCATCAAAAGCCATTCAATTTCCTATACAGCAATAAAAATCGCTTTTTTATTATCCTTCTATTGGCCTTCAATATGGG GAGGACCGGATTATTTGATCTTGAAAAGCATTTTGCTTTCTATGGTGCATATCACAGCAACCCAATTAACATAGCAATCCATGTTCTATTTGTTTGGCCA ATTTTTTTCACAGCCCTTATGATTCTCTATTTCATCCCTACATTCTTCAATATTCCGAATTCTTTGTTGCAGCACAGCTTGGGTTTCCGCTGGCATGGAA GGTAAACCAGGTTGCTGGGTTTTAAATTTTTTTTGTTTTATGAATACAATTGAATAAGATCACGGGTTCAAATCCGAGACACAATCTCTCCACTCGCAGG GATAAATGCGAGCATAGTGCATTGAGCTGCCTTTTTTTATGAATACAATTATTTTAGTCCATGAAATTGTAAGTGCATGTCATATTAGTTCCAAATTGTA TATAAAAAAATATCATTTTAGTATCTGGATTTACACATAATGATAGTATTAGTGCCTGAAATTATACTGTGATAGTTAAAAGGTCTCTATAATATATAAA TTTCTGGGACTGATATGTCATATGAGTGATGTATGTGTTTTTAAGAACTAATATGAATGATATTTATACTTTTAGGGATTAGAATGATAACTTCTCAAGT TAGGGTCTAGGATCATAAGTATTAAGTAAGTATTATTTGAGGGACTAATACAATGGTTTGCTCATGTTTTATTGATATGTAAATGTTGTTCTATTTTTTG GTGAATTTCTTTGTGTTTCATTTTAGCTGCCAGTGACAGCTACATTTATTTGTCATCTCAGACAAGTAACTTTAAAAATGGAAACTACATTAGCTTAAAA TTTCTTAAATAGGGATAGTCCAATGTTTTGTTCAACCATTTTCTGAACTAAAAACTTCATGGCATGTTGACAAACATAGTTATCTTTGTGGCTCAGTGGA TGCCACTAGGTTCTATTAAATTTTGAGTAAAGCTTTCTTAAAATTGTTTCTCATGATACACCCATAATCCTACCCAGCCAAAAATCCTTTTACTATAAAG GTTCTCTTCACAACTCCAGTTAACAATTAACTCATTCTTTTGGCCCCATCAAAAGAAAATACTTTAAGATGGATGAAAAGAAAATACCTTACTATGTACA TATTGCATTTACATAATTATGATGTCTGTTTGTTTTTAATGATGCCTTTGTTTTGTTTTTATTTCCCTCTTTCATTCTTCCTTTCTTTTTTTGGGTGGTT GAGTAATGCTAAGCCCTCCTAATTTTTTAGCCTAAAATTCTCCTAATACTAAATAAAAGAAGTATTGAATTAAAGAGTAAATGCAGTCAATGTCAGCATT CAATGTTTTCTTTACATAGTATTAGGAGACTTCTAGCCTTCAATTTTAGGACGATTTTGCAATTATTCATTTAGAGGAAGAGTGTTGCTTGCCTTGTGAC CTGAAGGTCTTGGGTACAAATCCTGGAAACATCTTATTCAATTACATAGGTAAGGATGTGTACATCAACCCTCCCTAGACCCTACTAGGTTGGAGCCTCA TGCATCCCCTGTTTAATTAATCATTTGCCATTTGCATTTTCTGTTTAATGAGCACAGATAACAGTTACAGCAGAATTGGAATAAGAAAAACCAAACCCAC CTAAGTTCTGGATATTTTAGTTATTAGTGATCAGATAGTATCCACTTGTCATAGTTTGTTTATGTTTGCCTAAATTTCTTTTTGTACTAAACCATATCAT TATGTTTGTTTGCATGTACTCAGACCAGGATACAAACCTTTCCTGCCTATTGCATTATTTGCTTCTTTATGAAAAAAGGTGGTACAATACACGAGGCTCC CACTTAGTGGAGTCTGAGAAGGGTAAATGTACACAGTCTTACCCCACAAGCAGATAGGCTGATTCCAGGATTTGAATCTGTGACCTGAAGTTTGCATTTT TTTAAATTATTTATAGGTTGAATAAGAATTACAAAGGTATCATTAAGTTATTTGGCTTCCTAACTATTTGTTTCGTTTCTTGGGTATAGAAATCATCAAT TGTTTCTTGGACAGGTAGACTAATAGCTAACAAAACTAAAAAAAGAGAATTTAGATAACGTGAGGGAGAGTGTGAATAACAGACATGGCATATATAATCT TACTTATCCTACAAAGGCTGATATTGGTTGTGTTTTTTACTTCAATAGAGGTTTTCCAAGAGTCTAAGTGTCTAACATGTTAGGTTTGAGAACAATGCCG TGCACCGCTAGTGAAAGCAGATCTTACAAATGCCTTGAAATTTATGATTACAGAAATTGAGTCATTTTTTCTTAGTATTACTTTTTCTTGTAATTATGGG TATATCTTATTCATTGCCCCGCATCTGCCTTGTACTTTTATGTCCTTTTAATGTTGTTGCAATTCTAACTCCTCTCAAGCCCACCACAAAAAATTCTTAT CTCCTTGGGCTAATATCTTGGAATGACAGCTTCCTCTGGCATTCAGTAGCTATGCAGCTCTTTTTGTTAGCGAGATAAGATAATGCTAAAGACTAAAGAT GTTGTCAAATGCATACATATACATCAACGACACATTTGATCTCAATTCTCAACAATATTGTATGTAGGTTGTTCTGGTGGCCCAGATAGTATGTTGGACA GGGCAGCTCATTGGTCATGGAGTATTTGAGAAACGAGCACCTGCCCTTTTGGATAACCTCGTTCAGGCCTTCGTAATGGCTCCTTTCTTTGTATTGCTAG AGGTAGTGTGCTTATAAATTTCACTTTTTTTCTAATATTGTCTGTTCTCTTGCATGGTTCTCTGTCCTTGTTGAATAGTAGTTTATTGCTTTAATCTATG CATTATGCCTTGCTCTTTGTTTTCTGTAGGGTCTCCAGACCTTATTTGGTTATGAGCCATATCCAGGATTTCATGCAATTGTGCAAGCAAAAATAGAAGC TGACATCAAACAATGGCAAGAAAGCAAACAGAGTCTAATTTCTTAGCTTCTGCATGGGTTTGTGTATATTTATTGTTAGATGTTAATTGATCTCCCATTA GCAGATGAAGATAAAGCTATAAATTATATAATATGTGTGGATTGTATTGGTATAATGCTTAATCTATTTTCATATAATTTTACATCTTTGTATTGAACTC AATACATCAATACCACTATTATGCTAATTGATGTTTTCTTACAGAAGCATCAGCCTTGTGTTTTAAAAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_156257; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_443587
Blastp | - |
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Blastx | Uncharacterized endoplasmic reticulum membrane protein C16E8.02 from Schizosaccharomyces with 46.88% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (SPAC16E8.02) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003613865.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |