Ll_transcript_442183

• Id Trinity: TRINITY_DN47877_c1_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_442183
• Sequence: CAACTTTTTTTATAAATAACAAAATGGTGAAACCAAAATGTAGGGTTTGCTTTCATTTCTCGCAGTTTTGTGTTGCTCAATCTATTCACTCCACAGTTAG CTTAGATCTTTAACGCCATTGTTGGTAGTGACATATCTATAACTCATTACATTGGAGTGTCGGTGTCGAAGCATGCGGCATATCTTCCTCGCACAGCTGT AAGGTATTCAGCGAAGCGATTCAGGAAAATATGAGGAAAAACAATCACTTGTCTTGCCTCTCCATTTTAATGGAGAGGATCCTTGTTAATCGTTGAGAGA CTCACAAACCCTCTCATGATTCACAACTGAAACAATGGTGTGCTTCGGTGGATGAATGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATGCTGATAATGTGT ATAGCTTTTATCATATGTACAAATAATGGACTGCTATCATTGTTTTAAGTGCCGATGTTTTTTGTTGTGATTTGGAGAATGCAATGATGATTATTGGTTT TCCCTATTGGTTTGATCGCCTGAATGATGGCATCTTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCCTTGTTTACCTACAATTTTTCTTGTTGCTTTGAAGTAGA TTGTTGTTATCGTCGATAAATGTATGCTATTTGAAGAGAATAATGTATGTCAGTGTTCATTGTTAAGCATTTTCGTTCTATTTTATTTAATTAGTAGTTG GATATATTGAATAGGAAACATAAATTGTTTTCTCTGTTCCGAAAAGTTTTTTTTGGTATTGATTTGGAGAATGCAATGATGACCATTTGTTTTCCCTATT GGTTTGATTGCCTGTATGATGGCATATTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCATTGTTTTCTGATGTTTTTTAAATTTTATTTCTTCTAATATGATATT AGATGTGGGTGAATCAGTAAGCTGGATTGTTCATGATAAAATTATATGCATTATATTTTACCATAGTGTGTATTTGGGTATATGGAACTCATCCGGTAAT CAAAATGATTTGGAGAATTCAATGATGATTAATTGTTTTCCCTATTGGTTTGATTGCCTGAATGATGGCATTTTGTATTAGCTCTATCTGAGCGTTCTCA ATGGTTTCAAATTTTCTTTTATTTTTTCAAATTCTAATTTGATATTTGATGAGTAAAACTGTATGCTATTTGAAGAAATTGATGTAATATCTAGATGTTC ATGAACATCCATGTTACATCTATTTATTAAAAGGTATGCATTGTATTTTGTCATAAGGTTTATCAGATTTATGGAGTTGTCTGGCAATCATAAAGAATGT GTCTTAGAAAAAAATTGTTTGTCTTTATTTGGAGAGTTCAATGCTGATTATTGGTTTTCCCTATTTGTTTGATCGCTCGAATGATGGCATTTTGTATTAG TTTGCTCTATCTGAGCATCTCCTTCTTTCCCAATGTTTTAAAGCTTTGTTTATTCTAATTTGATATTAGTTATTGGTCATAATTGTATAATTTGAAGAAA TCGATGCATGCCAGATGTTCATGATAGAATCTAGGCATTGTCTTTTATCATATGAGCTAGGCATTGCCTTTTATCATCTTTTTATATTTTATTTCAAGTC TGTGTTGTCTTTTTTTTAATCTGGTCATGTAGATAGGAATGACAATAAAGTGGGTCAGGGTCGGGTTTGTAGATACTGAAATCCGAAATTGAAAACCCTA ACTTGAACCTGAGTAAGGAAAATATGATATTATTTTCGTTTCATTTTTTTCTAACATTTATATTTTCTCTTGTATTGTATCATTTATTTGATATTTGAAA AAATTCAATGGTATCTAAACTAATTTTAGAAATTAAAAACAATTGGAAAAAAATTAATTTTAAATTGAATTACTTTATTTCGGGGCGGATATGGGTTATG GTTTTGCTGTACCAAACCCTAACTCAAACTGAACCCAATCATGAAGATGGCCTTAAAACCCTCTAAGTTTTGTTGTGGAATGTTATGATTTCTTGAAGTG ATTGGAGAAGGGCCTTATTAACCCTCCGTTGTAATGTGAGGATAACAAAAACGTGCAATATGACCTTACAACCAAAATTACCTTCGCTTCAGCCCTATGA ATTGATGAGCTCTTTAGGGTGTTTAATTGCAAGTCTACAAAAGAAATGTGGCATAATTTATAGACTATTGATGAAGGAACTGAGTCAGACTTTCCAGACT CAATATTAATATTTATGAAAATAATAATCGATATTTATGAAAATATTAATAATTAGAAATGAGAACATTGTAATTAAATACTTGGATTGGATTTTTTTTT CGAAATAAAGGAGACATTAATTATTTATTAGTATAACAACTAAAATAATATTTTACTAGATAACAATGGAAATTATTTAGGCCTTAGTTTTTCAAAATAA AGGTGGTCTCTAATGTAGTTTGCCTTCTGTGTTAATTAATATCATCATTGTCATTGATATGCAATATAACCAGTTAGACAATTGAATGAGCTATATGAAT TTTTTTACTCTCATGAGAAGAATAGGATGAACATAGATAAGTGAAATATAACTTAATAATTTGATGTTTATATCATTGTCTGAGCATAATATTGTTATAG TTGAGAATTTTCTCATCTACTTATGATTTCCCCTTCCTGTTTTATGAAAATTTTCGATATTATTGAAGATGAATTTAATAATGAGTGTATGTCTGGACTT TAATATATTGTGCCTGAAAGTCAAATTATATTAATTGGAAAATGGAATTTTAAAGTGATTATGGATACATATTAGATGTGATCATCTTCTTGATAGTAAA GCCAAGATATGAATGAGTCATAATATTGAAAATTTGAAGTTAATTTGGGTCATGTTCTCGAGTATGTTGTTATTGAAGGTATGTATCTGAAATCACAATC AAAGCTTGTAAATGACACTGAAGAATGGGAATATAGGAATATTTCTCTTAGATCAAAATCATACACAACTATAATTAAAAAAATCGTAACATCATTTATG ACTTGAAGGAACCTAAATAAATATAAAAAACTTTTTTATAATCTAATAAGATC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_156272;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_442183

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 1.5
• PS1: 0.1
• PS2: 1.4
• PS3: 0.9
• PW1: 0.2
• PW2: 1
• PW3: 0.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_442183

• Blastp: -
• Blastx: 40S ribosomal protein S5 from Cicer with 48.05% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434473.1)
• Pfam: -
• Rfam: snoZ102_R77 (RF00359)
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;