| Id Trinity | TRINITY_DN47877_c1_g1_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_442187 |
| Sequence | CAACTTTTTTTATAAATAACAAAATGGTGAAACCAAAATGTAGGGTTTGCTTTCATTTCTCGCAGTTTTGTGTTGCTCAATCTATTCACTCCACAGTTAG CTTAGATCTTTAACGCCATTGTTGGTAGTGACATATCTATAACTCATTACATTGGAGTGTCGGTGTCGAAGCATGCGGCATATCTTCCTCGCACAGCTGT AAGGTATTCAGCGAAGCGATTCAGGAAAATATGAGGAAAAACAATCACTTGTCTTGCCTCTCCATTTTAATGGAGAGGATCCTTGTTAATCGTTGAGAGA CTCACAAACCCTCTCATGATTCACAACTGAAACAATGGTAAGAAGCTATTGGCTGTCAGGATTATTAAACATGCTATGGAAATTATTCATTTGTTGACTG ACCTTAATCCTATTCTGGTTATTGTCAATGCTGTCGTGAACAGGTGTGCTTCGGTGGATGAATGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATGCTGATA ATGTGTATAGCTTTTATCATATGTACAAATAATGGACTGCTATCATTGTTTTAAGTGCCGATGTTTTTTGTTGTGATTTGGAGAATGCAATGATGATTAT TGGTTTTCCCTATTGGTTTGATCGCCTGAATGATGGCATCTTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCCTTGTTTACCTACAATTTTTCTTGTTGCTTTGA AGTAGATTGTTGTTATCGTCGATAAATGTATGCTATTTGAAGAGAATAATGTATGTCAGTGTTCATTGTTAAGCATTTTCGTTCTATTTTATTTAATTAG TAGTTGGATATATTGAATAGGAAACATAAATTGTTTTCTCTGTTCCGAAAAGTTTTTTTTGGTATTGATTTGGAGAATGCAATGATGACCATTTGTTTTC CCTATTGGTTTGATTGCCTGTATGATGGCATATTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCATTGTTTTCTGATGTTTTTTAAATTTTATTTCTTCTAATAT GATATTAGATGTGGGTGAATCAGTAAGCTGGATTGTTCATGATAAAATTATATGCATTATATTTTACCATAGTGTGTATTTGGGTATATGGAACTCATCC GGTAATCAAAATGATTTGGAGAATTCAATGATGATTAATTGTTTTCCCTATTGGTTTGATTGCCTGAATGATGGCATTTTGTATTAGCTCTATCTGAGAA TTCTCCTTGTTTCCTGGTATTTTTGTTGTTGCTTTTACTTAGATAGTTGATTTGAAGAGAGAAAAAAATGTATGTTAAAAGTGTTGTGGTAAGATGTTTT CATTCTTCTTTGTCACTTGGTTGACTGAATATTTTAAATTACAAACATGAATAATTTGCTGTCAATCAACATTATTTTGTTTTAGAAAAGTTGATTTTTG TCCTTTTTGGAGAATGCAATGATGATTATTGGTTTCCCTATTGGTTTGATTGTCAGAATGATGGCATATTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCATTCT TTCCCTGTATTTTTGTTGCTTATAATTAGATAGTTGATATAGTGTCGAAGTTCATGTTAAAATGTATTCATTCTATTTTGTGGCATGGTTGATTGGATAT ATTGAATTGAAAATGTAAATTGTTTTCTCTGGCAATGATAGTGGACCTGTTTCAAAAAGTTATTTTTTGTGTCTTGATTTGGAGGGTGCAATGATGATTA TTGGTTTTCCCTATTGGTTTGATCGCCTGAATGATGGCATCTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_156272; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_442187
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | 40S ribosomal protein S5 from Cicer with 60.36% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434473.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | snoZ102_R77 (RF00359) |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |