Ll_transcript_442188

• Id Trinity: TRINITY_DN47877_c1_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_442188
• Sequence: CAACTTTTTTTATAAATAACAAAATGGTGAAACCAAAATGTAGGGTTTGCTTTCATTTCTCGCAGTTTTGTGTTGCTCAATCTATTCACTCCACAGTTAG CTTAGATCTTTAACGCCATTGTTGGTAGTGACATATCTATAACTCATTACATTGGAGTGTCGGTGTCGAAGCATGCGGCATATCTTCCTCGCACAGCTGT AAGGTATTCAGCGAAGCGATTCAGGAAAATATGAGGAAAAACAATCACTTGTCTTGCCTCTCCATTTTAATGGAGAGGATCCTTGTTAATCGTTGAGAGA CTCACAAACCCTCTCATGATTCACAACTGAAACAATGGTAAGAAGCTATTGGCTGTCAGGATTATTAAACATGCTATGGAAATTATTCATTTGTTGACTG ACCTTAATCCTATTCTGGTTATTGTCAATGCTGTCGTGAACAGGTGTGCTTCGGTGGATGAATGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTATATATGCTGATA ATGTGTATAGCTTTTATCATATGTACAAATAATGGACTGCTATCATTGTTTTAAGTGCCGATGTTTTTTGTTGTGATTTGGAGAATGCAATGATGATTAT TGGTTTTCCCTATTGGTTTGATCGCCTGAATGATGGCATCTTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCCTTGTTTACCTACAATTTTTCTTGTTGCTTTGA AGTAGATTGTTGTTATCGTCGATAAATGTATGCTATTTGAAGAGAATAATGTATGTCAGTGTTCATTGTTAAGCATTTTCGTTCTATTTTATTTAATTAG TAGTTGGATATATTGAATAGGAAACATAAATTGTTTTCTCTGTTCCGAAAAGTTTTTTTTGGTATTGATTTGGAGAATGCAATGATGACCATTTGTTTTC CCTATTGGTTTGATTGCCTGTATGATGGCATATTGTATTAGCTCTATCTGAGCATTCTCATTGTTTTCTGATGTTTTTTAAATTTTATTTCTTCTAATAT GATATTAGATGTGGGTGAATCAGTAAGCTGGATTGTTCATGATAAAATTATATGCATTATATTTTACCATAGTGTGTATTTGGGTATATGGAACTCATCC GGTAATCAAAATGATTTGGAGAATTCAATGATGATTAATTGTTTTCCCTATTGGTTTGATTGCCTGAATGATGGCATTTTGTATTAGCTCTATCTGAGCG TTCTCAATGGTTTCAAATTTTCTTTTATTTTTTCAAATTCTAATTTGATATTTGATGAGTAAAACTGTATGCTATTTGAAGAAATTGATGTAATATCTAG ATGTTCATGAACATCCATGTTACATCTATTTATTAAAAGGTATGCATTGTATTTTGTCATAAGGTTTATCAGATTTATGGAGTTGTCTGGCAATCATAAA GAATGTGTCTTAGAAAAAAATTGTTTGTCTTTATTTGGAGAGTTCAATGCTGATTATTGGTTTTCCCTATTTGTTTGATCGCTCGAATGATGGCATTTTG TATTAGTTTGCTCTATCTGAGCATCTCCTTCTTTCCCAATGTTTTAAAGCTTTGTTTATTCTAATTTGATATTAGTTATTGGTCATAATTGTATAATTTG AAGAAATCGATGCATGCCAGATGTTCATGATAGAATCTAGGCATTGTCTTTTATCATATGAGCTAGGCATTGCCTTTTATCATCTTTTTATATTTTATTT CAAGTCTGTGTTGTCTTTTTTTTAATCTGGTCATGTAGATAGGAATGACAATAAAGTGGGTCAGGGTCGGGTTTGTAGATACTGAAATCCGAAATTGAAA ACCCTAACTTGAACCTGAGTAAGGAAAATATGATATTATTTTCGTTTCATTTTTTTCTAACATTTATATTTTCTCTTGTATTGTATCATTTATTTGATAT TTGAAAAAATTCAATGGTATCTAAACTAATTTTAGAAATTAAAAACAATTGGAAAAAAATTAATTTTAAATTGAATTACTTTATTTCGGGGCGGATATGG GTTATGGTTTTGCTGTACCAAACCCTAACTCAAACTGAACCCAATCATGAAGATGGCCTTAAAACCCTCTAAGTTTTGTTGTGGAATGTTATGATTTCTT GAAGTGATTGGAGAAGGGCCTTATTAACCCTCCGTTGTAATGTGAGGATAACAAAAACGTGCAATATGACCTTACAACCAAAATTACCTTCGCTTCAGCC CTATGAATTGATGAGCTCTTTAGGGTGTTTAATTGCAAGTCTACAAAAGAAATGTGGCATAATTTATAGACTATTGATGAAGGAACTGAGTCAGACTTTC CAGACTCAATATTAATATTTATGAAAATAATAATCGATATTTATGAAAATATTAATAATTAGAAATGAGAACATTGTAATTAAATACTTGGATTGGATTT TTTTTTCGAAATAAAGGAGACATTAATTATTTATTAGTATAACAACTAAAATAATATTTTACTAGATAACAATGGAAATTATTTAGGCCTTAGTTTTTCA AAATAAAGGTGGTCTCTAATGTAGTTTGCCTTCTGTGTTAATTAATATCATCATTGTCATTGATATGCAATATAACCAGTTAGACAATTGAATGAGCTAT ATGAATTTTTTTACTCTCATGAGAAGAATAGGATGAACATAGATAAGTGAAATATAACTTAATAATTTGATGTTTATATCATTGTCTGAGCATAATATTG TTATAGTTGAGAATTTTCTCATCTACTTATGATTTCCCCTTCCTGTTTTATGAAAATTTTCGATATTATTGAAGATGAATTTAATAATGAGTGTATGTCT GGACTTTAATATATTGTGCCTGAAAGTCAAATTATATTAATTGGAAAATGGAATTTTAAAGTGATTATGGATACATATTAGATGTGATCATCTTCTTGAT AGTAAAGCCAAGATATGAATGAGTCATAATATTGAAAATTTGAAGTTAATTTGGGTCATGTTCTCGAGTATGTTGTTATTGAAGGTATGTATCTGAAATC ACAATCAAAGCTTGTAAATGACACTGAAGAATGGGAATATAGGAATATTTCTCTTAGATCAAAATCATACACAACTATAATTAAAAAAATCGTAACATCA TTTATGACTTGAAGGAACCTAAATAAATATAAAAAACTTTTTTATAATCTAATAAGATC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_156272;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_442188

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 1.3
• PS1: 0.6
• PS2: 0.8
• PS3: 0.3
• PW1: 1.2
• PW2: 0
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_442188

• Blastp: -
• Blastx: 40S ribosomal protein S5 from Cicer with 60.36% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434473.1)
• Pfam: -
• Rfam: snoZ102_R77 (RF00359)
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;