Id Trinity | TRINITY_DN47879_c1_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_442804 |
Sequence | CCTAAACACATGCATTTGAAAAAAAGTTGAAAATGGAAGAGAGGAAAAAATAACAGTACAACATGTCCCCATAAAATTATATACAGACCACAGCAAGAAC ATAAAGGACACTCTTTTCTCCTTTTTGCTTCACTTTTTTCTTCACATTCCTTCCATTTTTTTCTTTGCTGATTCCCCGTGTCAAAAATCAACACCCTTTT CACTCTTTTCCGTGTCTTACTTTTCTTTTTCTATAAAAACCATTTCCCCATTACTAGGGTTTGAAATGTGGAGGGAGAATGGAACCCTCTGAATCCGATT CTGCTCTTGTTTCCATTGGTTCTTCTGTCACTGACCCTCAATTGGGTTCTCAATCAGCACCGTCTTCTATTCATTCCCATCATGATCGCGGTCCTGAACC CTCAGATCTCAGTCATGTGACCCAGGATGAAGAAGAAGAAGCACTTGGTGCAGAGCTTGAGACCAAGTTGGATTTGAAGGGTGAGGGTGAAGTGGGTGGT GAAACTGTGGATAAAGTTTCGAACTTTGATGATGGGGAACAAGTATGTGATGAGGGTAGTGGTGGTGGTGTTATTGAAGTTGAAGAATCTGTTAAGGTTA ATGTGAATGATGGGTTTGGTGGAAATATTAGGGGTTGGGATTGTAATAGTTGGGATGAGGATGTGAATGATGGTGTGAATGTGAATGAGGGTTTTAATGA GTATGAGGTTGGTGGAGATGATTATGCTGTGAATGATGGTGATTGGGCACAGGTAGAAGACAAAATCAGGGGTAGAACTCAACATTACCCTTTAAGGCCT GGTGCTGAGGATTGTGCATATTTTATGAAGACTGGGAATTGTAAATTTGGTTTCAATTGCAAGTTTAACCATCCGATCCGAACGAGAAACCAGGTATTTA 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_156286; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_442804
Blastp | Zinc finger CCCH domain-containing protein 43 from Arabidopsis with 44.3% of identity |
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Blastx | Zinc finger CCCH domain-containing protein 43 from Arabidopsis with 62.3% of identity |
Eggnog | zinc finger(COG5063) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G48440) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019457493.1) |
Pfam | Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) (PF00642.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |