Ll_transcript_441997

• Id Trinity: TRINITY_DN47888_c3_g3_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_441997
• Sequence: TTTGGTGAATTTTAGTGTTTACACGGTTTTTTCTCTTGGATTTGTAAGCTTTTGTTGCGATGTCTCTTATGGATTGATGATGTTATAATCTTTAGTTGCT CTTTGTTGATCTAGATCTACTTTGTAACTTCTATTTTTATGTTTGTGGATTTCTATTTTTGATTTGATTTTACTGTAAGGTGTTAGGGTTTTGACTTTTA TGATTTTGCTAATTTATGCTTTTTGATTTGATAAGTTTTATGATATTATGTTCTATGCAATTGGATAGAGTTACTACTTCCTTTTCCAAAAAATATGGTA TGATATGTGAAGCTGTTTGGTTGGTTGCACAATATGCATATTGATTTGGTCAAAGCTGTCATACATGTATTAAGAGAATTTGAGTTTTCTTTTCGATCAT GAAATAATTTAATGTGGCATGTTTAGCTATTTTGAGAAAAGAGAATTAACTATTTTGATGGAGATACAATGACTCATTGTCTAATGTGGCATGCTTGTTG ATTAGTGAAACAAGGACTTATTCATAAGATTGTTTATAGTGCCATGTGAGGTCACATGATCCAATTAACAAGGAGGGCCACTTGAGTCTGTAAGCTAACT ATGCAACTACAAGATATCAAGTTTTTTTAATTACTATAGTATGAGAAAGGGAATGAGATAAATGGTGGGATATCTGAGATGTTATTTCTTTTACCAAGAT GAGACTATAAATGTGTAACAGTGTCCTTCAAACTGCTAGTGTCGGCCAAAGGGTGTTGTCATTGACCACAGTAAACTCATGTCGGCAGGACAGTAAGTTT TATGGATGAGGATCCTCTGTCCCATGTTCCTGTCCCAACCCCTGTCCCGTCCAGTGATATTTTGCCACGTCATTTAAAAATCCACCTCATACTTAACAGC TCTAAACACTGTCAATTTCTCTTAAAAGTCTTATTATTCTTTATTCTTTCTTGCCTTCCCCTAAGAAGAAGAGTTCATTCTCTTGTGTCAACAAATACTA TGATTTCATCTCATTACATAAGAGTGCTATGCGAGAGAGATAATAGAACGGTTGGGGTCCTCTGATTGTTGATGATACGGTTCCCATTGTTGTAGAGAAG ATTAGAGGACATGTATCGGTGGTAAGTAATATCTTGTAGGAAGCTTTGTGTTTTAAGAAACAACTTTTGATTCTGGTCAAACAATTTCATGTTATCTCTT CTCATTGTTATCCATTTTTGTTATTTATTTTTCAAACTTTCCTGAACTAAATGGAGTTAATGGTTATATTGTCAAAAATTGCATATTAGATGTTCGATGA ACTGTCTAAGAGACTTTAAGGGCCAGAAACATATGCATATAACTTGACAGTGTGTAGAATTACATAATAGAGTAAATCATACAGAATTATAAAATCATAA TACATGGCCAAGGTCACATTACAATTCTCTCTGTTTTTTACCCATATACTAAAATTCATGTATATGTTATTAATCACCTATGTATTAAAAGAAAAAGTGC ATTTAGTGACCTTAGCAACATTGACAGTGTGTTACTTGTGTTAGTGAGAAGATGCATAAATCATGGTTTCTATTGCTAGTCGTATTTGTGGTGGCCAAGA ATGGTTACTGACAATGTAGCTAAGGATTTTTACATAAATTGATGTTGGTGGTTCTGTTAGGTTGGTGTTGTGGAAGATGAAGTGATTTATGGCGAGGGTA GTTTGGGTTTTTCAGAATTAAGATGCGGTAAATTTTATTGGGGATGGGGTTAAAATGAACTCTATTACTTCACCTCATCCTTGTAAGTGACTTAAGTTTT CACTTATCATATAACTTGTTAGCATGTTGCTACCAAAGTTTTTAGTTTTTACACAAATAATGATCATCAATTTGTTCTAAACTTGCATGGCTGCACAAAT TATAATCCTAACCTTCTTAAGTACTCTTGCCATATCAAATGCAGGTTTTATCCTCTCCATGTCATGTCATTTGTATCCATGCTACCAATGTAATTCTCAA TGGAAATAGTGACACATGGAAAGTGTAGTACAACCATTGAAAGTTTCAGGAGTACTTCTTGCAACAAATGATGATAGAGAACAATGTTTAGAAGATCATG GTGGTAGTTGTGGAATGGTGGCAGATCATAAAACTGACATGCAGAATTTTAGCACCAGTGTGATGTTATCAAAACTAATATTAGCAAAGTTTAGTCAAAT GAAGATGTCAGTTGAAACTCTTATTGTACTTTCATGATGCTCAAATTATTTACAAGACCAACATTTGTACACTTGAAAATTGTCTTGTAATGCAAATGTT TCTATATACTTAGAAAATTGTTATGTTGTCTCTTTTATTCCGTAGGATAAGAACAGGGTATGTATTTATGAATAGATACAATATCACTTTTAAGTTAACC TTGAATGCAAAAGTTATGAATCAATCCTTGTAATGCAATATTTTTTACTCTCATGACTCCCACCCTATGACAATCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_156366;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_441997

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 1.9
• PS1: 1.7
• PS2: 3.2
• PS3: 2.1
• PW1: 1.8
• PW2: 3.3
• PW3: 1.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_441997

• Blastp: -
• Blastx: Protein NEOXANTHIN-DEFICIENT 1 from Lycopersicon with 40.79% of identity
• Eggnog: NA(ENOG4111GNU)
• Kegg: Link to kegg annotations (101248551)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_014523161.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;