| Id Trinity | TRINITY_DN47944_c2_g1_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_422887 |
| Sequence | GAAACACTTATATATACACACGCATTATCGTGTAGAAACACTTGTATGCACAAAAAGATGAGAGAGATGCACTGTGGTTAGTCTTATAGAAAATAGTGCA CTACAGTTGAGTGAAGAGTCTGGTTTAAAGGATGAGAGAGAAATGACTTAAAGGGAAGTGCTTCTCATATCGTCCATTATTTTGAAGCTTCAGTTGGTGT GAGACATTGGAGAAGTGTATTTCAGTAAGTATAAGATGTAGTTTATTTGATTTAGATGTTTGTTATCTGCATTACATACACCACTTAACTAGTTAACCAG TTAATATTTCTGCTTAACAATACCACATTGTACACATATTCCCGTATCAAGAAAACATCTCTGATTTTGCATGATTATATGCTGTATTTTGATTTATGTG TTAATTTATCAGTTATGCGTGATTAATCAAAAGGTTAGACTGAAGGACACACTATTCTCTTTTGGTTCAGGGAAATGCTTTTGACAAAATCTGAAAATAT ATTGTCTCCCATTATGTTCTTTAGCACTTGGCAGCATTCAGACCTAGGGTTAGGGTTATTTTTAAGAATACCTTTTCAATAATTTGGCCAACGCATATTA CTTTCCTTGGCACTATCAAGTTTAAAATTGTAATCCCTAAGTTAATAACATATTTTGCAGGGGAGGATTTAACCTATTTTTAGTAACTTTTTCTTCTCCT GTGAAATTAAGTTGGTCTTACAATTGATATTAGGTTTGACATGCCAGTACTCTAATTGAAATATATCTAAAATGATCCTGGTTATTTAAGCTTTAATAAA TGTTGTAATTATCTTTGAGTAAAATCCCATTTTGTTTATGTTTAGTTGGATTTTAGATCTGTTTAATAAATATTATAATGTTCTTGCTATCTAGGACAAT CATTTTCAATTGATTTAATCTTGGTTTTGGATTAATGTTTAAGATGTGAAGTATGAAGAATAGTTTAAGAGAGCTTCCTTCAGCCCACTCATGGACGGAT TAAGGGTTTGAGTTAGCTGCTGACTCATTCATTCAAACACAATAGATCAAACATTATCAAATGCTATTGTGAATGTGTGAATGATGCAGGAGCTAAATTT CTTCCCTTTTTGTCTGTGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCTTTTACTGTTTATATATTCTTTTTTCTTCTGTTAATCATATTTTTTCCTCCCCACAATGAA TTGTTTACAAAGTATACCTCCAATTCAGTGTATTCCCCACATATTCTAACCACTTTTTGTCCTAGAAGCATGCTCAAATCATTTTGAATCTATTTGTTTG CTGGAATTTAAACATTTTATGTAGTTTTAGTTCTAGTTTTATTTTGTCCTGTAAATTATTGTTGTTAGAGAGCTTATTCTTAGTGACTTCACTTCTTGTT TTATATGGGCTATTAGAGTTTAGGCCCCCCATAAAATTTATGGCATGTAACCCTATGTTTTATCTGAAATGTAGAGTTGAAAAATAATTACTGTTGCTGT TTTCCTACAATTTCCTTGTCACCATCTTGTGTGTAATTCCATCTGTGATGGCTGTTTGACAATGATTTTGCTGGTCATACAGTTTATGGTCTTACTGAAT GGCATTGTTTTTTGTATGCTAATTTATTATATGTTGCAAGTGTGTACCAACAAATTCAATGCATAGGTTTAATCTCTTGTAGGACGATGCTCACAAGTCC AGCAACTATAATTTTGCCTTATTGACATAGACCGTAAATTACTCAGCATCATAATATGTTTGAATGGTTTATATGATATGAGTATCTAGGCTTAACTTCA AAACCTATCTTATGGGAAGGATTGCTCAAGTTATTATATGTATATTAGATTTATATAAGCAACAGGAGCAGGAGTTAACATATATAACACACTCAGTGGA CTGGTTTGAGTTCATCTTTTGGGTTCTGTTGGGATTTTTATTTTATTGTCTTGAATTCTTGATCAATGGTCAGCGGGTTCATTTGTGGGGTATCAACTTG GGGATTTTTGTTGTTAAGAATGTGTTCTTTTGTCGTAATATCTCAGTCAAATTTGAAAAATGCTCCTGAGTTCTAAGATTTTTTTAAGCTGTAATAACAT ACACGGTAAAAAGGTTCTCGCCAACTCAATATTTTATCGTAATTATCAATTGTTTTCTTCTCACATTTCCATCACACCCAAGCTGGCTTTTTTCTGATAT TCTCGGGTTTAGTTCTCTGAAAACACTGTTATCTCCTTATTCTGACAATTGTGTCCTTGGTAAATAAGAAGAGATAAATGTGAAAAATAAAGATAATATG ATTTGATGGCATAGAATTGAAGTAGTTAAATATATATAACATCAATGAGGTAATTTACATAGGATGATATACATGTGAACATGTTTTATGGGACTATGGT CTGTGAGAAATTATGTTCAAACAAGAGATGGAGAGAATAACTAAAGTACATTCTTTTACATGTATATTGAATGGCTTGTTGACTATCAACATACTCAGGG TTACCTTAGAAATATGCTACCTTAGACATAGGTTGTATCGTAGTGTAGTGTGTGTCAGTCACTTTATTCCAAGACAAAAGCAAACTTTGGTCTGATAAAG AAAACATAATAGCTAGCGTCCACCACACATCTCTACTATTCGATCGTGAGAAAATCCGGGTCGGTTAGATCTCAATTCAGAGTCTCTCGACATGCTCGTC CAGCATAATCCTGGCAGACTGAAGGCAACTATTCCTACCCGGCGGCCCAAACTTTATACACGTTTGGTCGCCGAGTAGATCTCACGAAGAGCTTCATTAA TTATCATTCTGGTTGGTCATTTTTGATATGTCAACATCATCTACATGTTCATAAAGTTTAAAAATGAAGGAAGCAACTTTGGAAAATAGATAATATATAG ATGATTAAAGCAATATTTTTGTAAAAAGGTGATTTTAGATTATAGAAAATGGTATATGGTGTATATAATCTTATTTTTACCTTTTCATTATGGCTTGAAC TATTTTGTTGTTGGAGTAACGTTGTAGTAATAATTATTGATCAATCTTCTGGGATCTAACCAGTTTTGCAGTGCTTGAATTTTAAAAAACTATTAGACGT GCAATGGCTCCAGAATCTCTCCCTTTTTGTCTCATCACTCTGCTTCTGCTAGAGTCTACCTATGCGGTTGGAACTTGGAGCTATAACGTTCTAGTTTTTT GACATTCGTGACATCCATTAATTATTTGTCTTTAAAATATCGTGCATTTTATAATTACATTAGTACATACCCAAATACTGTCCCAAAATTTGTTCCAAAC GAATAGCAACATGGCATATTAGTCAAAAAAAAGTTAACTATTAATGTTTTTATTTATATTTATTTATTCTGATTGACTTGATACATGATTGATGACATAT TTGGGGACATAAGATCTTCA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_156824; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_422887
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | gma-MIR319e (MI0017843) |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464983.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | MIR159 (RF00638) |
| GO | - |