Ll_transcript_422331

• Id Trinity: TRINITY_DN47957_c3_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_422331
• Sequence: GTTTGGGGCGGCCCTGTATCTGTGCGGGACCTACCTGGCGCAGGACGCTGGGTAGGAACAAATAAATTCACACTACAAATTATAAGTGGAAACTGTTTTT AATGTTCAAACTTAATATTTGTAGTACTTGAAATTTTCAACAGGGAGTAAAGTGAGATTTTCCCTAAACTTAATGTGAAGGTTCACTGTAAACAAATCAA AATTAAAATTTTACTAACTTTTTTAACAAGGTCATAGAAGCTTCATATGGTCTATTGACATCATGTGGCAATAATGATAAAAAGGAAATTACAATACATA GAAGCACATTTTTCTGTTACAAATCTTTACCTACACACCACTCATCAAAAAAAAAAAATCATTACCTACACACCAAGGTAATTTCATAATCTAAATTCTA TGTTTTATGCTAAGAAATAGTTGCAAAAACATATATGGGAGTTTCAGCTAGTTAATCCCCAACATTATGCAATGTGAAAATTCAAGTTGGCATTATTCAT CTTCTTCTGGTTGGGTCTTGAACTCAATTATAAGATTTCTTAAGTAAAACCCTTCAAGTTGGGACTTATTGTTATTCATATTCCTAATAGAGAATACATC TTGTATCCAAAAATTTATGTCATTTCATGTATTACTTTCTGTGTTCGATCAGAAAAATATATTATTATTAAATTTTAAACTTAAATATATATTTTTCAAG TAATTAAAACAAGTGTCACATAGAGTAACACACTTATTTGATACAACAAATGTTGGCCCATGTCATATATTTAGTGACAAGTTTAATATGTATTATAAGC TATTGTACACACTAGTTTAATATGTATGCAATCATTCATGTATATTTCCAAGAGTATTGATTATTTTGGAAAGTATTGCACTATATCACTTAGGATTGTC TTGATAATTTTATAATTTTATAAAACTAAATCTGTGACGATAAAATGTTTATTTAATATTAGTAATACACGTTTTTTTAAACAGTGTTTTTTACTTAACA TTCAAATATTCAATGATATATATCTTTTTAAATAGTATAAAAATAGTTAAAACTTCAATATTTTTTAATGTATTTGCCTATTTGGGCCACTCCACCATAA TCTTCACTCCTACTTCTTGGAATTGTTGGTGTGTGGTTCATAGTGAAAATATGAATTACACCAACAAGGTTAAGACTATCCCAGATACGCGGAGACCAAA AAGTCAAGAGTTCAATTATTATTGGCGACATTTGTTCGAAGGGATAATCACGCACTTTAAAAGAGATAATTTCCTTACTCAAAATTGGGAGAGAGGATAC ATTTGTAGTACCACAAAAAATATAAACTACACACTTAGACATGGTGAGATTGTTACGACTGTGATAATTTTTTCAGTGGTATCACCCCACAATTGTGGTA GGATCACAAATCACATTGGACAGGACAACTGTATCCACCATCTGGTTACATCGAATCAAAAACAATTTGGAAATATCAAAGGAATCAAAAGGAGTTACAC ATTAAGGTAAGAGGTATAATAAGATGCTTAAAGATATATTATGGAAAGATAAAGAAATACGTTCTAATGAGATCAAGACCAACTTGAAAACATAATATGT GGCCTAACAAGATTTTCTTATCAAGCATGAGCCATTGTTGTAATTTCTGAAGACAATACCAAACAAGATCACATGTTAATAGAGTCAATGATTCCCTAAA CATGCAAGCACTAATTAGCTGTTGTTGAGTGCTACCTAAATATTCAGCTGATGAACAATTATTGCACTCTTGCCTAATTCTTAAGCACACTTATCCATGC AACCAGCATTATTTGAAGGCTTTTGTTGTAATTTGCAGAGACAAAACCAGAAGCCCCACGTTATAGCAGATAGAAGTCCTAGAATTTGGTTTTAATTATA AGCAATGTAGTGCAAAACAATGAGCTTTAAGGTACTCTATTACCAGCCGACGTTGGTTCAAGTGGTACATGTTTGATTCCCTTTAAGCAAGGTCTCAGGT TCGAGTCTTGTGGATGAAAAAAATGTCCGCTTGGAAAGTTAACCCCGCATACCTGTAGATTTTCCTGACTTGTACATGATTGCATGTGATGATACATGTG AGAAATAAAAAAAAATATGAAATAAAGCTTAGGAACATCAAATAATGTCCCATTTTTGTTGTACAAAAGATTACTCTTTCTTTAATTAATCAACTTACTT CTACATGCTTTCGACTTTTGAGGAACCACAGGTACATTCACAGATGCATGGTTCTCTTCTTCAGCAGATAGATTGCAATGGAGCATGTACTGCAAGGTGC CGTTTATCATCTCGTCCACGTCTTTGTCAAAGAGCTTGTGGTACTTGTTGCAGACGCTGCAACTGTGTTCCACCAGGCACTGCTGGAAACCAAAAACTGT GTCCTTGTTATGCAAGCTTGACCACCCATGGCGGAACACGCAAGTGCCCTTAGACCCATAGTGGCAAACAAGTCGACTATGTATCACATCGTAAATTTTG TGAATATGAAGTCTTGACTTTGGATCAACGGAAGGTGTAACATGTTGATCGACGTACTTAATATCCTTGGTTTATAATATGTTGGTTAATGTTTTCTGAA GAATAGAGTCATATATGGAAAATAAATAAATGTGTTCAGTACGTGCTGAATCATTGATGAGTGTTGGAACTGTATTTACAAAATTAATAATCATTTTATG AATTTGAGACAGTCACTTTCTTGTCTTTCACTGTATTAGTACTGTGTGCGTTGTTTATATAAATGATAGAAAAAGAATTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_156931;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_422331

FPKM

• PAB: 0.6
• PNAB: 1.5
• PS1: 1.7
• PS2: 0.3
• PS3: 0.5
• PW1: 1
• PW2: 1.2
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_422331

• Blastp: -
• Blastx: Snakin-2 from Solanum with 79.69% of identity
• Eggnog: gast1 protein homolog 1(ENOG410YWQ9)
• Kegg: Link to kegg annotations (102582131)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0001808)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_006595495.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;