Id Trinity | TRINITY_DN47959_c1_g2_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_422080 |
Sequence | CTCACATTGACTTCAATATTGAACTATTCGAAGTGAGTCATTTCTCTGCTTCCTCCGTTTCCTTCCTTGGTAAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCT TTGTCTTTCTCACACTGTGATTTCTTAATTACAATTTCATTTTCTCTTTCGCTCCAAATCATTGATCAACATTTGTTACAAATGTTAGGGTTTCATTGTG CCGATGACTTTTTTTCTCCCTAAAACATTATCCATCGTTGGCTTCAATCTCCATTTTACCTTCATGAACCGTGGAAGACTTTGGTGTTCTTGGAATTTCT TCTTCCGCCATTGGACTTGATCACACTTCACTCTTCACTTTGCAATTAGGGTTCATTTTTATTTAATTACGTTCTTCTTTTAAGAATCATTATTATTGCT CTTCTTGTTTTCGAGGTTTCCATTACGAATCAGACATTGTTATTGCTATTGTTATTTCCACTGCACTGCTAGTGAGGAAGGTTTCGTTTTGGGATTGAGG TTTGTTGTTATTGGAGTTGTTGGAATACTTTTTCTCCATGGCGAAAATGAATATGATTCCAGGTTATCGATTTCACCCTACTGATGTTGAGCTGGTTAAG TATTTCCTTAAGAGGAAGCTCTTAGGGAAGAAATTCCCTTTCGATGTTGTTGCCGAAGTTGAGATTTACAAATATGCTCCTTGGGATCTCCCAGATAAAT CGTTGCTTAAGACTGGGGACTTAGAGTGGTACTTCTTTTGCCCTCGAGGGAAGAAATATGCAAGTGGAGCAAGGATGAATCGAGCAACAGAAGTTGGGTA TTGGAAGACTACTGGGAAGGATAGATCAATTGAACATAGAAATGAAGTTGTGGGGGCAATTAAAACTTTGATATTTCACACGGGTAGAGCACCTAAGGGA GACCGAACTGATTGGGTTATGCATGAATTCAGACTTGAAGACAAGGAGCTAGGTGACAAGGGAATTCCTCAGGACTCCTATGTAATTTGTAAGGTATTTC AAAAGGAAGGCCTTGGTCCCAGGAATGGTGCACAATATGGAAGGCCATTTAATGAAGAAGACTGGGATGAAGAAGCAGAAATTGGTTGTGTAGTATCTTT CCCTGTTGCAGCTCTGTCTACTCCAGCACCCCTTCAGCTTAACACAGGTCATAGTTCCACTGCAAATGACATGCATCCTTCTACAAGTGAATGCATTGGG TTGACCTCTGTGTCATGTCTATCTGAATTGACGCCTTCTTGCTTGACGCTTCCTTCAGCTCCTCCTTGTAGAAATAATCAAGCTGCAGATGACATTTTAT TAATGCTTGGTTCTGTCAAGGAAGATAACACACTGGCTCTGAATGAGAACAACAACATTGAGGTATAGAATCTATTGCTTCTTAGTTGTGCAGGTGCAAT TTGTTTTATGGGAATTTTTGCCAAGATTGTTTTTCTGTTGTGGTTTTTGCCAGATGTTCCCTAATCTTGGATGTCTTTATTTAATTTGTCAACAGCTTTC TATTTTCTACCCCTTTCCATTTTCATTTTCGTTCTTACAATTCAATTTGTTTTCAATATTTGATTGTGAGAACATTTTTATTGACCTTGCTCTTGGTCAG TGTTGTCAAATGCTGGCCATGGTGCTGTCATGGCAGAAAGCGGTATTGGTTCAAGGTAGAATGCCATTCGCCATTTGGAAAAACCCGCTAAATGGTGACG TCCACCATTTATTGATTTCGGGTTGGCATGGCAGTGGCGGCACATGGTGACAGATGGCACTTCTAGTGGGCTCTTTGGGTTAAAATATGGGGTTTTGGGT CAAAGAATCTAACCTCATTCTCCCTCTTTTCTTCGTTTGCGTGTCTACTCTCTCTTTGCTTCGTTTCCCTGGATTAAACTGTGTTGCTCCTATTTTGTTC ATGTCTCTTCTGTTTTGTATGGCTTGTTTAAACTTGAAGTTATTTATTTAACGCACTGGTTCTCACTCTCACCTGAACATTGCATTTTGTTTTATCGCCG CCATGTCACTTACTTTGCGGTTTGTGTCATCTACCAAGTTTTATCTCTCTTAAAAAACACTTATGTGCTATGTTTACTTGTTAACTACAGCAGTTTAAGA TTTTTTGTTAGTAATTCCCTTTCCAATTAAATACAATCTTATATTCTACTACATCACTTTGTGCCATTTCCCAATTTTTATCTCCATTGAAAAACACTAC TAACATTGGTATTTTTACTTGTTAACCCTAGCTCTTCATTATTTATTTTTAAATCATCCCTTTCAAATTAAATACAATTTTACATTCTGCCAACTTTTAA CTCCATTATAAAAAACACTACTAATGGTGGCATTTTAACTTGTTAACGCTAGTTTAAGATTTTTTTAAATCACTCCATTTCAAATTACATACAATTTTAT ATTTTAGACCGTTCAGTATTATCGGTTAGATACAATTTTACCATGATGTTATGTGGCCTATGCTATTATTAATATTTTTTAACCTTGTCTTTATTTATTG TATTTTTAATTAATTTCTGTCAACCACCATGGTGATTTACGCCATTAACCGCAACGCTATCTGCAATGCCTTGATGGCATAATTTTGGCAAACGCCATGG GCCGCCATTTGCCATTGAAAATCTGCTCTTGGTAGATATCTTTGAAATTACTATGTATGTTTTACAAAACATCCATCCTGCTTTGGCGTCCTTTGATTTG TATTTTGAAACTCATGTGCTGCTTGAAGGGTAATGCTAAATGCTACTTATTGTTGCTATCTGTTAATTACTTTTTGGATTAGTGTCATCTGAGAATCTGC TTGATTTCCTTCCTCACCCCCACAAAAGATATTGCCTTAAAAGCTTTCTTATTGTCTTAGTGCTTAATTTCTCAAAGAAATAAAGTAATGAACTTTTTGC TCAATTTTTGCAACTTGGCCTGAAATCAAATTGTTTGGGCATGTGTGGTGGAGATCGGTAGAAGCACTTGTAAGTAGAGTAGATCAAATGGAAGCTGGTC CAATTCCTGAAGAAAGAGGGAGACCTAGAAAAATTAAAGGGGAAATGAACAAGAAAAACTTAGAGTTCAATGTTTTTTCAATAAACATGATTTATGATAC AGTATTATGGCGTCATTCGATCCATGCAGCCGACCCCATCTGATGGGATAAAGGCTTGGTTGTTGTTCTTGTTAGACATATCTCCTCTCCCGAGCTGATA TTAGAATTGGTATCATATTGCTGGGGTCTAAATGAATAATACAAAGATATAAAACTCTGAAGGAAACTAGGTGAAAATGGATAACCCGGGCATTCAAGAG GCCTAGTTCTTTCATCATCAATTCCTTATCCGCGTCTTTCTCATTCCCCACTCCTCTCCCCCGTTTCTTTAAAAATGACTGTCAACAACACTCAAATGTG GAGGGTAGAAAAACAGAATTTATCATAAAAAGAGATACAAAAAGAAAAGAAAACTAAACTGAAATTTAAACATTCATGGGGGAAGGCACACAGCTGGGGA GTAACAAGGAGGCTGTGACTTCCAGAAAATAGCCAGCATGTGGCCCGAGATGGGTTGGGTATGCCACAAATGACTTCCATGTTCGGATGTAATAGCTGCG AGCCTGCGACAGCTGCTATTTCTGCTGCTATTGGTCTCAAAAGCTGCTATGGTTTCTGCTCCTGCCACCCATGACTCCCTAGGCAGGAGGGTTGTGCTGC TTCTCCCCTCTGCTATTCTGCTAACCACTATTGACTACCTAGATGTGGATTGACCTTTAAAAAATGGGACTTCTCAGTTGTTGAACTATCGAATCTCCAC TGATTGAGATGTCTGAGTGTATAATGCAGATAATATTTCTTTTTTTATCTATCTAAATTTACTAAGTGGCTTTATCTGTAGATTTTAATCCTTGAATATA TGTAGCATAAATAACCCATGACATGCCTGCCTTATCCACCATCTGTCTTATTCTTATGCTGATTTTATGATTGTGGGATAACAGGAGGTTGATAATACCT GTCAGGCTAATATTGCTGATGGCACACCTTATTTTGATCCAAATGAGATATTTGAGGGTTTGGGAGACCTTGACAACTTGGATGGATTTGGTGATGGACA TGGTTTTTCCTTTGGCAACAAAGATGAGTATAACACCAATGAAATGCTTTCTACATGTGATAACTTGGGGTTTGGCGAATCTCCAGGCTTCTTGGAGTTG ATGGACTTGGCGGTGCCACTGTTCTCGCAGCCTAAAACATGATTGATGGGTTGTTCCAGTCACAAGATGACTATGATTTGAAAACTGAGGAAGTATTTCA TAGAAAATTGATAGAAACATAGTTATAACTATTGTGGATCAGAAAAGCAATATATATTGTCTTCTCATTTTCCACTTAATCCTGGCATGGAATTTTATTT CATTGTCTAGAACAAGTTTTACATGACTATGCTTGGTAATGTTGAAAGATTGGTCCCGATTATTCTGTTAAGACTGGTTCGTGTGTTTCTTTTAGAACTT ACGAAAGTGTTTTATTCTTTGATTAACTTTGATCTGATTATGTTGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_156951; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_422080
Blastp | NAC domain-containing protein 82 from Arabidopsis with 53.36% of identity |
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Blastx | NAC domain-containing protein 82 from Arabidopsis with 53.36% of identity |
Eggnog | nac domain(ENOG410Y957) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G09330) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430181.1) |
Pfam | No apical meristem (NAM) protein (PF02365.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |