Ll_transcript_422088

Id TrinityTRINITY_DN47959_c1_g2_i16
Name TranscriptLl_transcript_422088
SequenceTTACAATTACTAATTTAATTGCAGCAAAAGAATCACAGGTATATAAATAATTTTTTCATTTATTTTTTGCTTTTCTATCTTCATTGTTTAGCACTGATTT GTGTTCATTATCCATCTTTTTATGCTTCTGGTTCTGGGTAATGGTAAGTAGTATTTTCCCATTATTTTAATTTAATAAATAATCACGGATCTGATTGTGT ATATGATAAAACATAAATCATCTCAATTGTATAAATAAATGGGTTTTCAGAATTCAAGCTAAACGCGTTTTGGTTTTGCCTATTTATCACTTATGATCAA TATCGATGAATGTTTTTATGTTAAGAAAAACAAATAAATAAATGGGTTTATAAGTGTTCGTTTAGTAGTGGAAGATCCGATCCCCAAATAGGCCAAAATG TCAAGAGTTCAATTCTCACGTTCCCCGAAAGGAGGGATTAGTCCTTATCCGTATGGTGAGAGGATATTATTGCTTTTATCAGAAAATGGGTTTATAAGAA TTCAAGCTAATCTCTTTGTTATTCTTCCTATTTATCACTTAAGATCAAAATTGATGAATACTTGTCAATCATAATGTGCCGTTTTATTGCATCGTTGTAT ATATGAAATGTTTGGTGTATATAATTGATTAACTATGCTGGAGGTTTTTTGGTATGGTGACTTTTGTTTGTCTTTTTTGTGACTACTTTTAATCTTAATC TGAGTTTGTGTCTCAATTTTTTGTCATGTCTGTCTTGCTTTGTCGAGTGTTCTAGTCATGCTTTGAATGAATGAGGACTAAAGATGCAAGTTTGTGTAAT TATGATGATAGTTCAGGTCTTTCAATTACTGCAGGTTTAGTAGGAGACGGTTGTTGTACCTTAGGTTGAAGCCTATACTGATTGCCAACTCGAGATATGA TGAACGGAACTCAATATAGTGGTGAAAGTTCCAGTTCAACTTCTCGTAATAGTCAGCAAGATATTGAGGATGATGGGATGATTGCTCTTGTTCTGTCTGA AGAGTATGCAAAATTGGATGGTGCAGTTGGTCGACGCCTTACGAATTTGGCACCTGTTCCTCATGTGCCCCGGATAAATTCTTTCATCCCCAACATGAGT GATGCTAGTATGGACCATCAACGTCTTCTTCAGAGGTTGAACATCTATGGTCTATGTGAAGTTAAAGTCTCTGGAGATGGAAACTGCCAGTTCCGTGCAC TTTCGGATCAGCTTTTTAGGTCATCTGAACACCATAAATATGTTAGAAAAGAGATTGGAAAACAGATCAAAGATCACAGGTCCTTGTATGAATGCTATGT ACCAATGAAGTATAAGCGATATTACAAGAAAATGGCAAAATCTGGAGAGTGGGGGGATCATGTTACCTTGCAGGCTGCTGCTGATAAGTTTGCAGCGAAG ATATGCCTGTTGACATCATTCAGAGACACTTGTTTCATTGAAATTATGCCATTATACCAAGCACCTAAGCGTGGTAAGATCACCTCAAACGCTCATGTAC ATGAACAGTTCATCGGCCTTTTAATGTTTAAAAAAATATGCACAGGCCGAGCTTACAGCGGTGATCTCGGCCTAAAAGGTTTTCTATAAGTTTTTTCTAA TATGTAGTCTTGACTCTTGAGGAAGGTTATGCATCAGAGGTATCATACATGGCCCTCCCTGAAATATTTTGAAATAGTTTGTGGTTCCGACAAAAGTTAT TTTTTTCCATAATGTGAGTCACAGAGCCAGTCTTCCAACCGAAAACCGGGTCACGACAGCTGCAAACTACAAGCCTGTTGTAATTAATTCCACAAGTTCA CGAGTTGGTGCTATCTTTTAAAGTCAAGGATGTAATAATTAAAATTCTACAGTCCAATGCCCATAAAAAACTTCATGAGGTGATAAAAGAGCAAAATCAA GAGAATTGCAGATATGCATATGAGCTTCAAATGGGATATAAAAAAGGGCCAGCATGTTTGAATTGTCTATTTTTGCATTTACTTTAGAACCTCTCCTATC TTTAATTTTGAAATTGTCAAAAGTATCCTCTTATTCCTTTCTTTCCCTTGACTTTCATGCAGAGTTGTGGTTAAGCTTCTGGTCTGAGGTTCATTACAAT TCACTATACGAAATTCGAGGTTTTTGACCATAAAACTTTATGCTTCCTTGATCATATATGAATTTGAAATACTTCAGTTATTGAACATGAATATAGCAGG TACTTATCTGTTTTCTTCTTTCTGTTGTAGATGCACCAATCCAACATAAACCAAGAAGGAAACACTGGTTATTCTAGGAAAGATAGAGTTTAAGCATGAA CCAGCACTGTTGTTTTACATGTAAGGAAAAAATTCACAAATCTCCCATTCAACATTGAGCTTTGCCAAATATACATCTCAGCTTTCAATTTTAGGAATTA ACTCATTTTTTATTTTCGATATATTTGCTCGAGGAGGGATCCGTTTACATCCAAATTAAGTTACACTAGTTGCACTCAATCTTATCCATTCATTTTTTCT AATTCAACGGACCAAAGGGATGAAACCTAAAAGCCACCTAAGATTCCTCTTTTTCCCTCTCATCACCTCTTTCACTCACCTATTTGGTCCGTTGGATGTA AAAAATAAATGGATAATATTGAGTATAACTAGTGTAACTTAATTTGGATGTAAACGGATTCTTCCTCATTTGGCTCTAGCTTGGTTTTGTGAACTTCAAC TAAAAAACACCCTTATGCTTGTATTTAACTATTATTTTGTAGTTAAATATATCCTTGCTACCACCTTCATGCTTGAAGACTCTAATCAGTGGTTCATCCA TTGATCTTTCAGCTATCAGCTCCATGCTTCCAAGC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_156951; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_422088

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_422088

BlastpOTU domain-containing protein DDB_G0284757 from Dictyostelium with 36.09% of identity
BlastxOTU domain-containing protein DDB_G0284757 from Dictyostelium with 36.09% of identity
EggnogOTU-like cysteine protease(ENOG4111GFM)
KeggLink to kegg annotations (DDB_G0284757)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019430191.1)
PfamOTU-like cysteine protease (PF02338.18)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;