Id Trinity | TRINITY_DN47959_c1_g2_i6 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_422075 |
Sequence | CAAATGAAAATGCAAGGAGGTAATTCAGTACAAAACACAAAACCTAAATATAGAAACCCCTCAGCCAAGAAAAAAGCACAAATATATAAATAAAACCCTT GGCTCTATTTCTCACTTCATAGCGACTCCAATATTCAACGATTCTGAGTGTGGAGTGAGTCCTCTGCTTCCTCCTTTTCCTTCCCTGGGTTCCACTGTGC CGATGACTTTTCTTCTCCCAAACACATCATCGTCATCATCATCATCATCAATTGCTGGCTTCCATTTCCATTTTAGCTTCATGAACCGGGGAAGGCTTTG GTGTTCTTGGAATTTCTTCTTCCGCCATTGGACTTGACTCGCTTCACTCTCAATTCGGGTTTATTTAATTTAATTTAGAATTTTTCTGTTTTTCGTTTTG TTTTTCGAATCGTTATTATTGTTATTGTTGCTTTCGTACGCTGCTGCACGAGGTTTCCATTCGAATCGAACATTGTTGTTGTTGTTGTTTTCACTACACT GCTAGTGAGGAAGGTTTCTTTGTTGGATTGGGGTTGTAGTTGAAGTTGCTGGATTATTTTTCCATGGAGAAAATGAATTTGGTTCCAGGGTTTCGGTTTC ATCCCACTGATGTTGAGCTAGTTAAGTATTTTCTCAAGAGGAAGGTCTTAGGGAAGAAATTCCCTTTCGACGTTATTGCTGAAGTGGAGATTTACAAGTA TGCTCCTTGGGATCTCCCAGGTAAGTCGTTGCTTAAAAATGGTGATTTAGAATGGTACTTCTTTTGCCCTCGAGGGAAGAAATATGCAAGTGGAGCAAGG ATGAATCGAGCAACAGAAGTTGGGTATTGGAAGACTACTGGGAAGGATAGATCGATTGAACATAGAAATGAAGTTGTTGGCTTGATTAAGACCTTGATAT TTCATACGGGTAGAGCACCTAAAGGAGACCGAACTGATTGGGTTATGCATGAATTCAGACTTGAAGATAAGGAACTATCTGACAAAGGCATTCGCCAGGA CTCCTATGTAATTTGTAAGGTATTTCAAAAGGGAGGTCTTGGTCCCAGAAATGGTGCACAATATGGAAGACCATTTAACGAAGAAGAATGGAATGATGAT GAGGAAATTGGTTGTGTAGAATCTCTCCCTGTTGCAGCTCTGTCTTCTGAAGGTCCCCTTCAGTTTACTACATGTCAAAGTTCCGTTGCAAAAGACATGC ATCTTTCTACAAGTGAATGCATTGGGTTGACCTCTGTGTCATGTCTATCCGAATTGGCACCTTCTTGCTTGGCACTTCCTCCAGCTCCTCCAAGTAGTAG TAATCAAGCTGAAGATGACATTTTATTAATGCTCGATTCTTTCAAAGACGATGACACACTGGCTCTAAACGAGATCAACACAATTAAGGTATGGAATCTA TTTCCTCTTACTTGTGCTGTTGTAACTTGTCTTGTGGGGAATTTTGTCATGATTGTTTTTCATTTGTGTTTTTGCCAGATGTTCCCAAACATAGCGTCTT TTATTTAATTTGTCAACAGTTTGTTTATTTCTCACCTTTTTTTTCATATAGCTCTATCATATTCAATTTGTTTTTACTATTTGATTGTGAGAACATTTTT ATTGACCTTATTCTTGGTACATATCTTTGAAATTGCTGCGCATGTTGTAAAAAAACATCCATCCTGCTTTGGTTTCCTTTAATTTGTATTTTCAGATTCA TGTGCAGCTTGAGTGTTTATACTTGTTTTATCCAACTTCTGAGGCTAGAAGGGTATACGATGCTAAAGAGTATTTTTTATTGCTATCTATTTAGTGATTT TTGGACTTGCTGTCATTTGAGAATCCGCTTGATTTCCTCACCTCACAAAAGATATTGTCTTTAAAGACTTTCTTATGGTCTTAGTGCTTAATGTTTCAAA GAAACAAACTAATAAACATATTGTGCAATTTCCCCTGATAGAAACTTGGCCTGAAATCACACACCAACACAGAAAATTGTCCTCTCTGAAGCTGATATTG AATTGATATCATGTTGCTGGGGTCAAAGCTGAATAATACAAAGATATAAAATTTTGCAGGAAATGAGATGAAAATGGATAACCCGGGTATTAAAGTGGCC TGGTTCTTTCCTCATCAATTCCTTATCCACTTCTTTCTCATCCCCCACTCTTCTCCCCTTTGTATTTCTTATATCTGCTGCACTGATCCTAACCGAATCA TTGTCAAATTGCTAGTTTGTAAGAAGAGATCATAATGTCTCGTTATGTCCCTTGTATCTGTAACCCTTGTCTAGGTGTGCCTCTGATTTGCCACAGTCCA TTTCCCCTTTTTCATGTAAACTTTAGTCACAGGAGCCTTGTGAAGATATACTCTCCTTTTTGTTCAAGGAGGGTGGGGCTTGAGTTTTATTACCTTTTTT TTGTCTTGTAGTTTGCCCTTGTTTTGCTAATTTTGTAGCTTGCTGATCTAGAGTGTATTCACCAACTTTCAAAGGTTGATTAGATTTTTGTCTAGTAGTT TGCCCTTTTTATTTTCCAAATTTTGTTGTGTTCTCTTATGCATAAAAGAGTATATTGACCTAATTAGCCAACCTCAGATAGTAGAGCAGAACAGAGCAAC CAACCCTACAACTGCAACAACGGTGTAACATTATAAAGGTGTTCCGAATTTATAAAATACACATTGAGATCATGTAATTGCAAAATTTAGGTATATATAT ACACACTATTATAAATAATTGTTATGCTGTCAAAAATAGTTACAATTATATAATTAATAAACAAATGTTTAAAATTACTTCGTAATTTTTAACAAGGGAT AAAAATGCAAAAGTTAAAAGAACACTGAAATTTAAACATGCCTGGAGGAAGACACAAAGCAGAGAGATACTCCTCTGTGCTGTGATTGCCAGAAAAGAGC TGGCCAGAAATGGGTTGGTACCTGCATAAATGGCTTCCCTGTTGGATGCTATTGACTAACTAGATTTGGGTTGACCTTTAAAAAACTTCAAAAGCTGGAT GGCCGAGTTGTCGTTGAACAATTGAATCCACTGATTGAGATGTTTGAGTGTATATGAGGTTGATAATACTGGGCAGGATAATATTGCTGATGGCACACCT TATTTTGATCCAAATGAGATATTTGAGGGTTTGGGAGACCTTGACAACTTGGGTAGGTTGGGTGATGGACATGGTTTTTCGCATGGCGACAAAGATGAGT ATAACACCAATGAAATGCTTTCTACAAGTGATATGTTGGGGTTTGGCGACCCTCCAGGATTCTTGGAGTTGATTGACTTAGAGGCGCCATTGTTCTGGCA GACTAAACATGATTGATGGGTAGTTCAAAGCCAAGATGAATAAGGTTTGAAAATTGTTAGAACCATAGTCATAATTATTGTGGATCAGAAAGGCAATAGG TTGTCTTTTCATTTTCCTTTTGAAGACTTTATCATGCCATGAAGTTTGTTTCTATTTCTTTCAACATTCATTTTCTAGAATAAGTTTTAACATGACGTTG ACGGGTAATGTGAAAGCTAGGTTTCTATTATTCTGTTAAGATTAATTCGTGGGTTTCTTGTAGAACTTGTAAAAACTTCATTGTTTGCTTACTTTTGAAC TGGTTAATCGGTTTTTAACCAACATTGGAGCCTACACCACCTAGTGGGATAAAATTTTGGTTGTTGTTGGTATTAAACTTCCGGCAACGGAATGTTCTTT GTTTCACATTGAATGAACTCAATTGAATAACCTTACCTTAGAGGAAGAGAGCTTCATTTGGCATATCATAGTAGGAAGGCAAGTTGGGCACTCATTCTAA GGCACAGGTCAACCATATATGAAAAATGTATCCAAGGGTGTTAACATTTAAATGGAGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_156951; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_422075
Blastp | NAC domain-containing protein 82 from Arabidopsis with 50.7% of identity |
---|---|
Blastx | NAC domain-containing protein 82 from Arabidopsis with 65% of identity |
Eggnog | nac domain(ENOG410Y957) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G09330) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437223.1) |
Pfam | No apical meristem (NAM) protein (PF02365.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |