Ll_transcript_421871

• Id Trinity: TRINITY_DN47963_c2_g5_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_421871
• Sequence: TGGAGAGTGAAAAATTGTCCTAAACCCTACTACGTGTTGCAATGCCTAACCATTGACATGGCTCATTCTTCTTCGCTTAATAATCCTCTGCCATGATCCT CTCTCTCCGTTATCATGCTCTCTCTGCGTCCCACTCGCACATTCCGCCACTTCTCCGCCGCAACCACCGCCCCTCCGCCGCCGCCACCCCCCGCTCTCCA CCTTCTCAAATCCGAAAGAGACCCCGATACACTCTTCCACCTCTTCAAATCCAATGCCACCAATCGCCTCATCGTCGAAAACCGCTTCATCTTCGACGAC ACCGTTTCTAGGTTAGCCGCTGCGAAACGTTTCGACTACATCGAGAATCTTCTCGAACAACAGAAGTCTCTTCCCCAAGGTCGCCGCGAGGGTTTCATGG TTAGGGTTATTACGTTGTATGGTAAAGCTGGTATGACTCATCATGCTGTTAGAACTTTCCGTGATTTGCATTTGTTTCGATGCCGTAGGACTGTTAAATC GTTCAATGCTGCGCTTAATGTTTTGTCGAAAACTCGAGATTTCGATTTGATTGTTCAGTTTTTAGGAGAGGCTCGAAGGTTTGATATTAGAATTGATGTG TGTTCTGCTAATATTGCTGTTAAGGCCTTTTGTGAATTGGGGAAATTGCAAGAGGCTTATTTGTTTATGTTAGAGAGTGAGAACAATGGGATTATACCGG ATGTGGTGACGTATACGACGCTCATTTCGGTGTTTTATAAGAATAGGAGGTGGGAGATTGGGAATGGGTTGTGGAACAGGATGGTTTTGAAGGGATGTAT GCCGAATCTGGCAACGTTTAATGTTAGGATTCAGTTTTTAGTTAGTGCGAGACGCGCATGGGATGCGAATACTTTGATGGATTTGATGCAGAGAGTGGGG GTTGCGCCGGATGAGATTACCTTTAATTTGGTGATGAAAGGTTTTTGCCAAGCGGGTTTTATTGACATGGCGAAGAGGGTTTATTCTGCATTACACGGGA GGGGGTATAAGCCTAATTTAAAGATTTACCAGACTATGATTCATTATTTATGCAAGAGCCGGGATTTTGGTTTTGCATACACTATGTGCAAAGATAGTAT GCAGAAGAGTTGGTTTCCGAATGTAGATACAATCTGTTTGCTGCTTGAAGGCCTAATGAGAAATGGGCAAATTCATAAAGCACGGATGATTGTTACATTG GCTGAGAAGAGAAATCCCCCCTTCTCTTCTGGTAATTTGGCTGCTATACAGTCCATATTGTCAAAGAGTTAATTAAATGCAATAGGGAAACCAGAAATCA TTTACCTTTTGCGAGACAGGAACAGTTCAAGAGGGTCTATTATTCTTTGTAATTCATTCATTTGTACATCTTGAAATTTTAACAAGTGAGGAAATTTGAT GGCATTACAGTTATACAAGCAATCAGGGCTAGTTATTTCCACTCACTTATTTCATTGTACCATTCTTAATAAATTATTTTTTTGACCAAGGTGAAATTTC AAGAGGCAAACACATCAAACTCTTGTAAGTTCGGACACGCTCCTCCTCTTGTGGCATTCTTTTGTGATTATCACATTCAGTAAATTTCTGGAAGGATTTT GATATGGAATCTGGGTTCTGTGTAGTAGAGAGCACAGATACCACTATGTACAGCGTGCATTCTTATTCAGGAATTGGGGCTTTTATCTATGGCATAATGC ATGTATGAGGGCATGAGGCTTTATGAGATACTCATGGAGGAAATACGCTGTTTATAGCGATGGGTTTCTGCTTTAGAACATGGATATTATCTTATCCCCG TGCTTTGTTTATCTGCTTTGGATCGTTGCCAGATTTCTTCCTTTTTGGGGTTCAGGTTTTGTGCTTCTATAATAGTTGAACGTTGACCGAGTTTTGAAGG CAGCTCATTCTTGTGATTTCAATTCATTTATCTGGGTAGCAAAGTTTGGGTGAAGTGTATAGGAGAAGTTGCATTAGCCTGGTTTTGTAAAAAATATCAA GAATGGTGAATGAGAGACAAACAAAGGAGAATGGATAGAGCATTATTGCAATTGAAGGTACAAAATCGACAGCGTCAATTTTCCGAGCATCCATCGACAC GAGACATACAGTACATGCCTGGTTGGAACATCTTGAGTCAGTTTAACAATTAACATGTATATGATGTGCTGACAGTGCTGTCCATTGTTAGGAGTCCCTG CCTTAGAGCATGAACACTTTGATTGTGATGTGTGCTCTTGCATCCCTTTATTGTCTTTATGAAATTGAAAATGCCTTGAGCCAGTTCTACGAAGACAAAG GTGGGAACTTCACTACCACTTGTTCAAAACCTATTCATATTAATAATTTAAGGACATCATTTAGAAATGTTGATCCCTTTTCGCCTGAGTGGTAATGGCA TCATTTAAATCATATTTTAATTATGATTTTTATCCAAACGATCTTATTTTTATCTACTGACTTAGATTTGTTGAAATTATTGAATTCACCATATTTTGAA GTTGTTCAGATAATGGAGAGACAATTTGTCAAGTTTTTGCACTGGATTTTTTGTAAGGTGGATTTTTGGATAGTTGAAATGCCACCTTGCAAGAAGATGC AAGAAAGAAGGCCGAGCACTCATAGGGAATGGGTTTGAGAGTTTAGATATTTTTTGAGCCTTAATTTCATAATAATTGATGGGTTTTTGTGGTGAGTTAG GGATTGTAACACCCCAACCTTGACATGTTATCCATCAAGAATTCATTGAGTGTACCACTTATTAAGCTTAAATACCTCCTGCAGTATTTTTATTCCCCGT AAAAGAGAGCCTTTCGAAAAGGAAGCACAAGAATGAGCTAAAGTCATAAGTCGTGGGAGGCTCCTTTAGGAGGAATAAAATACCGTATGAGGTATTTAAG CTTAATAGCTGGCAGACTCAGTGGATTAATGGTGGATAATATGTTAAGGCTGGGGTGTTACAGGGATCATCATCAGTTTGAGTGTTTGGTTAAGAAACAT AGTCTTGTTCATGTTTTGTTAATGTAACTTGATTGAGGTGGATGAATTCACGAGTTTATGTTGAGTTTAACAAAATTCAATTGTTTTCATAAAAGTTTAA GTTTGTACATGCTTTCACTCAATTCAACCACCTAAATTCTTAACCTGTAAGAGTATCACAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157002;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_421871

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 1.6
• PS1: 1
• PS2: 0.8
• PS3: 1.4
• PW1: 0.8
• PW2: 0.9
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_421871

• Blastp: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g80150, mitochondrial from Arabidopsis with 60.45% of identity
• Blastx: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g80150, mitochondrial from Arabidopsis with 59.7% of identity
• Eggnog: Pentatricopeptide repeat-containing protein(ENOG410Z7Z7)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G80150)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019448093.1)
• Pfam: Pentatricopeptide repeat domain (PF13812.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;