| Id Trinity | TRINITY_DN47964_c5_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_424163 |
| Sequence | CTAGGTGTTACACCTTTATAGAAACAATTTCTTGATAAATTAGTAATGGTATTACTAAAGTAAAAGAATAAATAAAAAAACATTATTCTGTTAAAGTCAT TGACCTATATATATTCCCGAAACTATTATATTGCATTAGTCTGAAGGCTTCTTCATCATTGTTTTGAGTAGAGAATCAATGGTGGATTTTCCGAAGTGAA AGAAAAAACTGAACTTCTTCATTTTCCTTATCACTTTGGGGCACCCCATTTCAAAGGGTAGTAGTTGTTTTAACTTTGGGACGGTGCCTCTGACTTTGTT GAACGTGATACTCATAACTCATTCGTGGGTAATAGTTTATATAGCAACAGAATTTTGATGGGTTTCCTGGTTTGGTTTCAGAATTTGTAAAATTGTTGTT TTTTATTATTAAGGATTGAGGATGTTAGGAGAATTCATAACTCGGTGTCTTATATTGCTTTTGGGGTATGCATACCCTGGATTTGAATGTTATAAAACTG TGGAGAGGAATAAAGTTGATTTTGAAGAACTTCGGTTTTGGTGCCAATACTGGATCATTGTGGCACTTTTCACAGTACTGGAAAAGTTTGCAGATGTAGT TATTGGATGGTTACCCTTGTATGGAGAGATGAAACTTGCCCTATTTATCTACTTATGGTATCCCAAAACTAAGGTAAGAAAATTAAAGATGGTTCTTTTG ATCCTTTAACATACTCTTTTTATTCTCTTAGACATAGTTTAAATATTTGTTGAGATACTCTTCTTATTGATTGTCAATTGGTTTTTTGAATAGAACTTTA ATATGATATCGGAATCAGAGTTTAACTCTTTAATTTCGAGATGAAATCTTAACCATTTAGGTATATAGAAATTGGGAGATCAATCCCTAAAGTATGTGTT TTAGTATATACTATTAGTATATGTACATGTACCCCTCTCTATTCCCATATAAATCACATCTATGGTGGAAAGTTAAATAGGTATTAATTGATAAATTTTA TGTATTCTTCATATAGTGCATTTGCCTTTCCTTCAAATTTTATAGGTTTGATAGTTGAAATGATTAAGTGCATAATGTGTGTGGTGATTTAAATTGTGGC TGCAACACAATATCGTGGTTGCGGTGGCCGCTGCAATCGTATCACATCACAATTGTTGTGTGATTCTGAATCACAATGATGCGGACATATCGGCCGCACT ATAACCATGTCAGATCGCGATGCAATCGCATCGGGCCGCAATCCAACCGCATCAGACCGCATTTGTACCACATCAAGCCACATCGAATTTAAAAATATTT TTTAATTACAAAATAATTTATAATGTATCGACCGCAATCCACATCACAACAGTCGCAATGACCACAATCACAGTAGCCACAACCATTACCGCAATGGCGG CTGCAACCACAACTTAAAACAATGAATATGTTCATTTGTTTTCTTGCATTAAAAGTAGCCATAACATTACTTTGATAGGATATATGATTTTTGTTGTTTT TCATTAAACTAAACTTTAAAGAATTATTAATAGTTTAAGTTATTCTGAATGCAGGGAACAGGATATGTTTATGAGAATGTGTTGAGGCCTTATGCATCAA AACATGAAAATGATATTGACATAAAGTTCCAAGAGTGGAGAACTAGAGCATGGGACTTGGCTATATTTTATTGGCAAAATTGCACAGAATTGGGCCAATC AGCAACTTTTCAGGTCCTAGATTTCTTGACTGCTCAGCATACAAAATTTTCAGGCAAAACCAAAAATACTAAGGTGAATTTCTCCTTTTAAATACCCATA TTCTAAATTTTGTACCGCTTTTAAATTGGATTTATTTGATTGTTGTTAGTAGTTAATAACCAAAGTTCCATATCAAAACTTAAAAAATGTTACCCATAGT CCTTTCCAGGGAATACATAGTAGCATGTGGATCATATCTTGTCCCAAAAAAAGTGTTGTAAAAACTGGTTTATGCCGGCCGATTCAACCGGTTATGGTAC AGTAATTAAACTGATTATGCATTAATGTTAATATATTTAAAATTATTTTTTAATAAAAATAGAAAAAATATTGGTTTTTTATTGATGCAACATTAATTTT ATTATATTATATATGTATATCTAATTTTATCAATATGCAGTTTAATTAGTGAATCACAAGTTGAACTGTTATACCAAAATCCTATCTGGTTTGATAACCA GTATGGTATTAATAACACTGCAAAAAGTGTTACTTCATGTGTCACTTAGTATGATTGGTATAAAAATATATTTAAGTTAAAAATTTAATAATTAATTTTT TTTCCAAACAATTACCGTAAGTAGCATATGGAGTGACATATTCTTGGGATATGTTGGTATCATTAGATAGTGATGTCATATTCATTGAAGGCATAATTGC AATATGGTTCTCCAATTCATAGTGAATCATACATTTGCACATAAGTAAATCAAACAAAATTGCTGAAATTAATTTGTACCTTGTCATTGTTTATATATTG TTTTATGATATTAATGAGAATGGTACTACATTGTAGAAAAAAGAGAAGGAGGATCCAATCACATTATATCCTCCAAGTGCCCCACCTTTACCTGACATAA GAGCATCTCTATTTCAAAATAGTGAACACAATTTCAAAGGCAAGAACAAGAAGTGGATTTGACATTCAAGTAGAAGATTAAATGATGGCTTTATATGTAC ATATTCACTTTAAGCCTAGGAAAAGAGAATGGGCCAATATGGTTGTAACTTATGTGCTGAAAATTGCTTTTATTTTTTGTTGACCAAAAATTGTTTTAAC CCTCTCTTTTGAAACAATTTTATTTGTAAATAATTTATTATTCTTTTATGCGTCTTCTACTTGTATTACATGACAACAATTTGAGCCAAAGCTTAAAAAG TGTAGGCAATTTCAATCATGTACTGAAAGCAAAGGACTAACATGAGTTATTAGATTCTGAATTGGAGTCAATTATCGAAATTATAAAATTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_157012; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_424163
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | HVA22-like protein j from Arabidopsis with 69.05% of identity |
| Eggnog | receptor accessory protein(COG5052) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G36020) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019456267.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |