Ll_transcript_423768

Id TrinityTRINITY_DN47975_c1_g2_i6
Name TranscriptLl_transcript_423768
SequenceCGCATAACACGCTTCATCGTGTCTCAATCTCACTCTCATCATCCACCATTCCCGAATCTCATTCACACCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTCACAT GGATCGGTTAAAATCATTCTCTAAAATGTAGCCACTGTTTCAAATAACACTTCAAGGTTTCTTCACCATGGGAAGGTTTATCCCTGCATTCGCATTGCCT ATCATTCTTCTTACAGCTTCTATACTTAACTGGAGTTTGATATCATTGGTTGAATTGTTAGCATTCCTTTTCATCCAGTACACTGCTCCTAGAAGGGGCT CTCGATTCAATCAACAATCTTTGATATCTTGGCTTGTCCTTATGTTGTCCTCCTTGACACTACTCGCACATGCCATATTTCATATTGTTCTGGCCATTGA GGGGGATCAGTGGAGTACTGTCGATGCTCAGTGGGCTCAGCTAATTGGACTTGTAAGAGTGCAGTCTTGGAGGACTTTGCCTATAGAGTACTTTTTGGTC ATGCAAGTATTGTCAACCTTTCTTTCTCTTGTTGAAATCTATGGAAATCGATTTGGTCCAGATGCATGGAGATATTTTCGCACTGGCCATTTTTGTCCTT CTCTTCTGATGATAGGATCTCATTTCAGGGGCTTGTGCTGCTTCTTGTTGCCTGCTATACAACTAATTGCTGGGATTAGTCATGCATCTTGGATTTCTTT GCCTTTTTTCATTTTTAGCAGCATCGGGCTAGTTGTTTGGTCATGGACGAGCAAATATCTAAGCATGTTTCGGTGGTGGAGATACCTTCTCTTTTATGCT GGCTTCAATATCATCTTGTTGTACATATATCAACTTCCTGTTGAGTTCCCAGAGACTTTAATGTCAATATTTGACCATATTGGGTTGTTCAAACTTTCTA CAAAGTCAGAATGGCCTGAAGTTTGCTCTGGTCTTTCACTTATAATTTTTTACATTATGCTATCCTGGATTAGAAGTGAACTAGCTGAAATGGAAATCAT CACACCAACAAGAGAAAGTGACTTGACCGAGCATCTTCTTCCCAAAAATCATTCTCATTTTGTTCACGAGTCCAGGTCTGGTGTGAACAATACCAATTTC TTATTGCGAGGAGCTGTTTCTCGGTCATTTAGTATTAATTTTTTAACATATGGTTTTCCGATTTCCTTGCTGGCTCTATCATTTTGGAGTTTCCACTTTG CAAGTCTGTGCTCATTTGGATTACTTGCTTATGTGGGATATATCTTGTTTGCCTTCCCTTCCATGTTTCGGTTACAACAATTGAATGGCATGCTTCTTGT TTTTATCCTCCTCTGGTCAGCTAGCACATATATCTTCAATGTGGCATTCACTGTTTCCAATAATAAATCACGGAAGGATATGGAGATATGGGAAACTATA GGCTTGTGGCATTACCCTGTCCCCGGATACTATTTGCTTGCTCAATTTGGTCTTGGTTTTCTTGTTGCTATGTGCAACGTTGTAAACAGTTCAGTGTTAT TGGGCATTACTGATCAAGGACAGTTAAGAACTGATGAATCTCTTGTGGAAGAGGGAGAAGAGACTACAGTATTAGTGGTGGCCATAATAGCATGGGGAAT TCGCAAGTGCTCACATGCTGCAGTACTGATATTAATATTTCTTATTGCAATAAGACCTGGTCTAATTCATACTGCATATATGATTTTATTTTTAATTTAT CTTCTGAGCCACACAATCACTTGTAAATTACGTCAAGCTATCATCCTTTTATGCGAGGCACAGTTTGCACTCCAGTTCATTCTTCAACTTGATCTGATCT CCAAGACTTTAGATCACAGGGGTTCATATGCTTTTCAAATTCTCTCACAATTAGGCATTCTTAATCATACTCATTCAGTGGATTTCTTCAAAATATCTGT TCTTGCATGCTTCTGTGCGATTCACAATCATGGGCTTCAAACACTCATTTTATTCTCTGCTATTGTACGTCACACATCTTGCCCTCCACTTGGATTTAGT ATCTTGAGAGCTGGCTTGATCAAACCTGTTCGTTTAGCTGGTTATAGTCCAAGATATAGTGAGAGACAGGGAGCTCATGAGAGGAAGATGATATCATTTT TGAATGTGATAAGATGGTATTTCCTTTCTGTTTATCGATCATGTGGCAAATACATTGCCTTCCTGACAATTCTCTTCAGTGTATACCTTTGCACACCAAA CTATGCTTCATTTGGCTACATATTCTTTCTTCTACTGTGGATAAGTGGAAGACAACTTGCGGAACAAACAAGAAAGCATCTTTGGTATCCTATGAAAGTG TATGCTGTAATGGTGTTTGTCTCCATTTACAGCATTGGCGTCTTTTCCAGCTCAAAAATGTGGTTAGCCCGGATCATTGATATTCAAACTGCATTTGGCT ATGACCCTGAAGCTTCCATGTTGCAAAACATTTGGGAATCCTTGGCTGTATTAGTAGTGATGCAGCTATATAGCTATGAAAGGAGGCAGAGCAAAAGTTC TGGATCGAGTGATTATGATGCACAAGAAGTAGGAGCTTGTTCTTTTGTCAGACGCCTTCTAGTTCGACACACTGAAAAATTATTATCCCTTGCCTTGTTT TATGCATCATTGTCACCTATAAGTGCATGTGGTTTCTTGTATCTTCTTGGTTTAATTAATTTTTCAAGATTATCAGAGTCTTCTCAGACACATGCAAAAG TATTTCTTGTTTATTCAGGACTCGTAGTAATGGCTGAATACCTTTTCCAGATATGGGGAGACCAGGCTGGGATGTTCCCTGGTCAAGAACACTCACAATT GTCCTTATTTATGGGATTACAATTGTATAAACCGGGTTTCAGAGGTTTAGAGTCAGGGTTAAGGGGAAAGGTTGTGGTTATTGTAGCATGTATGCTTCAA TACAATGTTTTTCGGTGGTTAGAACAGATGCCTCACTTTAATGGAAATGGAGGAAAGTGGAATCAGCATTGTCCTCTGTTCAACCTAGTAGAAGTTCCCA ATGAAACCACTACCTGTACCTTGGAAAGCAAACAATTGGAAAATTCCACTTCATCAGTAGTTAAGCGAGCTACAAGGAGTCATTCATGCCCGATATTAAA TTCTGCATCATCCCAAGGGCCAGATTCAGTGGTTGAAAGAGATAGTGCGAAAAAACCTCGACACTTTCACTTCTGGGATAGTTCCAAAGAGAGCTTTAAG TGGAACAAAAAGCGGATTCTTTTTTTGAGAAAAGAAAGGTTGGAGATGCAGAAGACAGTTTTGAAAGAATCTCTGAAGTTCTGGATAGAGAACATGTTCA ATTTATTTGGTCTTGAAATCAACATGATTGCTTTGCTTCTTGCTAGCTTTGCTTTGTTGAACGCCATCTCATTGCTCTATATAGCATCACTTGCTGCTTG TATTCTTCTCCATAGACTAGTTATTAAAAAATTATGGCCTATTTTTGTTTTTCTGTTTGCTTCCATTGTCACTGTTGAATACTTGGCTATATGGATGCGT CTTACTTTTATGAACCAACAAATCAAAGAACAAGTGCCATGCCATGACTGTTGGAGAGTGTCAGATACATATTTTAGCTACTGCAAAAAGTGTTGGCTAG GAATTATTGTTGATGATCCTCGTATGCTTATTAGCTATTATGGGGTTTTCATGCTTTCATGCTTCAAATTCCGTGCTGACCAGTCATCTCTCACGGGGTT AGAGATGTATCAAAAAGTACTCTCTCAGTGGAAGTCTGCATCGGTACTAAGTGATCTTTCATTTGAAACAAAAGGATACTGGACATTTCTCGACCACCTT AGGCTTTATGGTTACTGTCACTTGCTAGATTTTGTTCTGTCATTGATTTTGATAATTGGAACTCTTGAATATGACATTCTGCATCTTGGCTACCTTGGTT TTGCTCTTGTTTTCTTCCGAAAGAGGCTAAAAATACTAAAGCAGGGAAACATAATTTTTAGATTCTTAAGGATGTATAATTTTGTCCTTATAGTCTTGTC TCTTGCTTATCAATCCCCTTTTGTTGGTGGCTTTAGTGAGATCAAATATGGTTCAATAGAATGCATCAATGAATTGGTTGGATTTCACAAGTATGATTAT GGGTTTCGAATTACGTCAAGATCAGCATTTGTGGAAATCATCATATTCATGTTGGTATCACTACAGTCATACATGTTTTCATTTCAGGAGTTTGATTATG TTTCAAAGTATCTCGAGAAAGAGCAGATCGGTGCAATATTGCGCCAGCAGGAGAAGAAAGCTGCTTGGAAGACAGCTCAGTTGCGGCACATACGTAAAGC TGAGGAGCTGAAGCATCTCCGCAGCTTGCAGGTAGAAAAGATGAAATCAGAGATGCTAAACCTTCAAAATCAGCTTCATAATGTGAGCACTGATGCAAAC TGCAGTAATCCTTCACTTGAATGTGATGACCTAAGATATAGAGGAAACACTTCCCCAGATTTTCATAGGGAAAATGAACTCAGGAGGCAAGATCTTGATA TTAATACTGAGTCGATAGGACCTTTTGACATGAATGGACCTTTAATGAGTAACAAACCTGAAAGTCAATTGGTGCGAGAATACTGGATGCATCGAATGGA TTCTCCTCATGGAATTGTTGAGGTAAAGGATAGCAATGTTTTTTTGGATTCAGAAACAAGAAGTCGCTATAAAATTCCAGTCAGGAAAAATCCTTTATTT TCAGCTGTACGTCTCATAGGGAGTGGAGTATCTCAAGTGCAGTCTCTTGGAAACATGGCAGTTAACAATCTGATGCACTATCTGAAAATAGAGCATGAAG AACTAGAGTCAAATAAAGATTCTTCTGAGGATGAGGTATACTATGAAATAGAGAATCAGAATGTAGGAGTAGAACCTCTGGAGCCTACCTCCTCCACACA CTCTGTTCATGAGCATACCGCTCCTGATACTGCTTGTCTCAGAATTGGTATTATTTTGCGTTACATGTGGTCCCGAATGAGGTCGAATAATGATGTTGTT TGCTATTTCTGCTTTATTCTAATATATCTATGGTACTTCAGTTTACTTTCTGTGGTCTACCTAGCAGCACTCTTCTTATATGCTCTCTGTCAAAATACTG GCCCGAGTTACATATTCTGGGTTATTATTCTAATTTATACTGAGGTGTGCATTTTGCTTCAGTATTTATATCAAATCATTGTTCAGAACTGTGAGTTTGT TTTCCCTGTGAACTTACTTCAAGAATTAGGATTTCCTGTAAAAAAAATAACATCATCGTTTGTGACAAACAACTTACCTTTCTTTCTGGTATATATATTT ACTCTCTTGCAAATCTCCATAACTGTGAAAGATGGTGGTTGGACAACTGCTGCAGATCTCAGCTTTCTTAAGAGAAGAAATCAGAGCTACATAGAGGATG TAATGTGCTCCAACTGCCAAGAGAGATTACAGAGACTATTTTTACCTCTGAAAAATGTACTGAAAATGTTGATCAGAAACATCTGTCGGTACTGGAAATC ATTGACATGGGGTGCAGAAACTCCCCCTTACTTTGTGCAGCTTTCTATGGAAGTTAACTCGTGGCCTAAAGAGGGAATTCAGCCAACGAAAATTGAATCA AAAATAAATAAGTTGCTAAAGATCTTGCATGATAGAAGATGCAAAGAGGAAAACCTTTTTAATTTGCAATCAGCTAGTAAGGTTCACATACAGAGCATTG AAAAAAGTGAGGAGAATGAGAATTTGTGCTTTGTTGTTTTTGAGGTGCTATATGCCGCCCCTCCAATTGAATTTACTGCTGAAGAATGGTACAGCTCATT AACTCCAGCAGCAGATGTATCCAATGAGATTCGGAAAGCTCAGGACATCGGCATTTTTAAAGAAATTGGGTTCCCATATCGAATACTTTCCGTTATTGGT GGTGTTAAAAGGGAAATTGATCTGTATGCCTACATCTTTGGAGCTGATTTGGCTGTGTTCTTCCTAATTGCCATTTTTTATCAATTAATTATGAAAGCTA ATAGTGAATTTCTTGAAGTCTATCAACTTGAAGATCAGTTCCCAGAAGAATTTGTATCAGTTCTAATGGTTGTCTTTTTCTTGATCGTGCTTGATCGTAT TGTATACCTCTGGTCATTTGCAACAGGAAAAGTTATTTTCTATTTGTTCAACCTTGTTCTTTTCACATATTCAGTCACAAAATATGCCTGGGACATGGAT CCTCTTCACAGATATTCTGGAAGACTAGCACTGCGTGCCATTTATCTCACAAAAGCACTTTCTCTGGTTTTGCAAGCCATCCAAATTCATTTTGGGATTC CACACAAAAGCATGTTGTACAGGCAGTTTTTGACCAGTAATGTTTCACGAATTAACGTGTTGGGTTTTCGGCTATATCGTTCTATACCTTTCCTTCATGA ATTGAGATGTGTGTTAGACTGGTCTTGCACAACAACATCTTTGACTATGTATGACTGGCTGAAGTTGGAAGATATTCATGCAAGCTTGTATCTTGTCAAA TGCGACGTGGATTTGAATAGATCCAACCACGAACAAGGAGAAAAGCAAACAAAAATGACGAAGTTCTGCAATGGGATATGTTTATTCTTCGTGTTAATGT GTGTCATTTGGGCTCCGATGCTGATGTACAGCAGCGGTAACCCAACAAACATCGCGAATCCAATCAAAGATGCCAGTGCTCGGCTTGATATAAATACAGT AAGTGGAAGGTTAACATTGTTTGAGACAACTTTGTGTGAGAAGATACCTTGGGAAAAGCTTGTAGCACGAACAAGTCTAGATCCTGAGGGTTATCTCAAT GCATACAATGAGAAAGACATTCAATTGATTTGCTGCCAACCGGATGCAAGTACATCGTGGCTTGTGCCACCAGTTGTACAAGCCAGATTTATAAAGTCCC TTAGGCGGGACATGGAAATTACTTTCTCCTGGCAATTTACCAGAGATAGGCCTAAAGGAAAGGAATTAGTGAAATATGAATTAACCATAGAGGACCAGGA TCTTCCAGAATCTTCAGAAGTTATTGAAGTTTTTAATGGCACTTCCAATAGCTTCACAGTATTCAATATATACCCTAGATATTTTCGGGTCACGGGCTCT GGTGATGTGCGGTCTCTTGAACAGTCGGTGGAGCTGGTTAATGGGGATCTTGTTCTCAACCGTGGAAATCCAGAGTGGTGGTCATTTTATGATACTGATA CCTCGGACGCACATGGATGTGGAGAGTTCCCAGGACCAATGGCTATAATCGTATCTGAAGAAACTCCTCAGGGCATTATTGGTGAAACTCTCAGCAAGTT CAGCATCTGGGGACTGTATATTACCTTTGTTCTTGCTGTTGGACGCTTTATCAGATTGCAATGTTCCGACTTGCGAATGAGAATTCCTTACGAGAATCTT CCTTCTTGTGACAGGTGCCCACCAATAAATCCATTTGCAGTAATATTGATGGCAATATGTGAAGATATATATGCTGCAAGAGCAGAAGGTGAGCTTGAAG TTGAAGAGGTTCTATTTTGGACACTTGTCAAGATTTACCGATCTCCGCATATGCTGTTAGAGTATACTCAGCCTGATTAAATTCTTTGAAGATTTGGAAA ATATTCAATCTCCTGTTACTGTCTCATCTTGCATGATTATGATGTTTTCCATCGAAGACCAAATGTAAAGGTTGCTCAACTGTATGAATCTCAAGTTCTA TCTTTTACTTGGTTTTGATTCTGAGACTTTGTATGTTATTCCAAAAAAAGGAGATTTGTCTCGTTAACATCAAAATTGGGAAAGTATATGGTGTTTAATG TAAACTTTATAATGGTTAAACCCTATATTCTCTCACTAATTTATACACTAGTTCTTAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_157132; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_423768

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_423768
BlastpPiezo-type mechanosensitive ion channel homolog from Arabidopsis with 56.59% of identity
BlastxPiezo-type mechanosensitive ion channel homolog from Arabidopsis with 56.11% of identity
EggnogPiezo-type mechanosensitive ion channel component(ENOG410YVF6)
KeggLink to kegg annotations (AT2G48060)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019423156.1)
PfamPiezo non-specific cation channel, R-Ras-binding domain (PF12166.7)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;