Id Trinity | TRINITY_DN47975_c1_g2_i8 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_423771 |
Sequence | CGCATAACACGCTTCATCGTGTCTCAATCTCACTCTCATCATCCACCATTCCCGAATCTCATTCACACCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTTCACAT GGATCGGTTAAAATCATTCTCTAAAATGTAGCCACTGTTTCAAATAACACTTCAAGGTTTCTTCACCATGGGAAGGTTTATCCCTGCATTCGCATTGCCT ATCATTCTTCTTACAGCTTCTATACTTAACTGGAGTTTGATATCATTGGTTGAATTGTTAGCATTCCTTTTCATCCAGTACACTGCTCCTAGAAGGGGCT CTCGATTCAATCAACAATCTTTGATATCTTGGCTTGTCCTTATGTTGTCCTCCTTGACACTACTCGCACATGCCATATTTCATATTGTTCTGGCCATTGA GGGGGATCAGTGGAGTACTGTCGATGCTCAGTGGGCTCAGCTAATTGGACTTGTAAGGATCTCATTTCAGGGGCTTGTGCTGCTTCTTGTTGCCTGCTAT ACAACTAATTGCTGGGATTAGTCATGCATCTTGGATTTCTTTGCCTTTTTTCATTTTTAGCAGCATCGGGCTAGTTGTTTGGTCATGGACGAGCAAATAT CTAAGCATGTTTCGGTGGTGGAGATACCTTCTCTTTTATGCTGGCTTCAATATCATCTTGTTGTACATATATCAACTTCCTGTTGAGTTCCCAGAGACTT TAATGTCAATATTTGACCATATTGGGTTGTTCAAACTTTCTACAAAGTCAGAATGGCCTGAAGTTTGCTCTGGTCTTTCACTTATAATTTTTTACATTAT GCTATCCTGGATTAGAAGTGAACTAGCTGAAATGGAAATCATCACACCAACAAGAGAAAGTGACTTGACCGAGCATCTTCTTCCCAAAAATCATTCTCAT TTTGTTCACGAGTCCAGGTCTGGTGTGAACAATACCAATTTCTTATTGCGAGGAGCTGTTTCTCGGTCATTTAGTATTAATTTTTTAACATATGGTTTTC CGATTTCCTTGCTGGCTCTATCATTTTGGAGTTTCCACTTTGCAAGTCTGTGCTCATTTGGATTACTTGCTTATGTGGGATATATCTTGTTTGCCTTCCC TTCCATGTTTCGGTTACAACAATTGAATGGCATGCTTCTTGTTTTTATCCTCCTCTGGTCAGCTAGCACATATATCTTCAATGTGGCATTCACTGTTTCC AATAATAAATCACGGAAGGATATGGAGATATGGGAAACTATAGGCTTGTGGCATTACCCTGTCCCCGGATACTATTTGCTTGCTCAATTTGGTCTTGGTT TTCTTGTTGCTATGTGCAACGTTGTAAACAGTTCAGTGTTATTGGGCATTACTGATCAAGGACAGTTAAGAACTGATGAATCTCTTGTGGAAGAGGGAGA AGAGACTACAGTATTAGTGGTGGCCATAATAGCATGGGGAATTCGCAAGTGCTCACATGCTGCAGTACTGATATTAATATTTCTTATTGCAATAAGACCT GGTCTAATTCATACTGCATATATGATTTTATTTTTAATTTATCTTCTGAGCCACACAATCACTTGTAAATTACGTCAAGCTATCATCCTTTTATGCGAGG CACAGTTTGCACTCCAGTTCATTCTTCAACTTGATCTGATCTCCAAGACTTTAGATCACAGGGGTTCATATGCTTTTCAAATTCTCTCACAATTAGGCAT TCTTAATCATACTCATTCAGTGGATTTCTTCAAAATATCTGTTCTTGCATGCTTCTGTGCGATTCACAATCATGGGCTTCAAACACTCATTTTATTCTCT GCTATTGTACGTCACACATCTTGCCCTCCACTTGGATTTAGTATCTTGAGAGCTGGCTTGATCAAACCTGTTCGTTTAGCTGGTTATAGTCCAAGATATA GTGAGAGACAGGGAGCTCATGAGAGGAAGATGATATCATTTTTGAATGTGATAAGATGGTATTTCCTTTCTGTTTATCGATCATGTGGCAAATACATTGC CTTCCTGACAATTCTCTTCAGTGTATACCTTTGCACACCAAACTATGCTTCATTTGGCTACATATTCTTTCTTCTACTGTGGATAAGTGGAAGACAACTT GCGGAACAAACAAGAAAGCATCTTTGGTATCCTATGAAAGTGTATGCTGTAATGGTGTTTGTCTCCATTTACAGCATTGGCGTCTTTTCCAGCTCAAAAA TGTGGTTAGCCCGGATCATTGATATTCAAACTGCATTTGGCTATGACCCTGAAGCTTCCATGTTGCAAAACATTTGGGAATCCTTGGCTGTATTAGTAGT GATGCAGCTATATAGCTATGAAAGGAGGCAGAGCAAAAGTTCTGGATCGAGTGATTATGATGCACAAGAAGTAGGAGCTTGTTCTTTTGTCAGACGCCTT CTAGTTCGACACACTGAAAAATTATTATCCCTTGCCTTGTTTTATGCATCATTGTCACCTATAAGTGCATGTGGTTTCTTGTATCTTCTTGGTTTAATTA ATTTTTCAAGATTATCAGAGTCTTCTCAGACACATGCAAAAGTATTTCTTGTTTATTCAGGACTCGTAGTAATGGCTGAATACCTTTTCCAGATATGGGG AGACCAGGCTGGGATGTTCCCTGGTCAAGAACACTCACAATTGTCCTTATTTATGGGATTACAATTGTATAAACCGGGTTTCAGAGGTTTAGAGTCAGGG TTAAGGGGAAAGGTTGTGGTTATTGTAGCATGTATGCTTCAATACAATGTTTTTCGGTGGTTAGAACAGATGCCTCACTTTAATGGAAATGGAGGAAAGT GGAATCAGCATTGTCCTCTGTTCAACCTAGTAGAAGTTCCCAATGAAACCACTACCTGTACCTTGGAAAGCAAACAATTGGAAAATTCCACTTCATCAGT AGTTAAGCGAGCTACAAGGAGTCATTCATGCCCGATATTAAATTCTGCATCATCCCAAGGGCCAGATTCAGTGGTTGAAAGAGATAGTGCGAAAAAACCT CGACACTTTCACTTCTGGGATAGTTCCAAAGAGAGCTTTAAGTGGAACAAAAAGCGGATTCTTTTTTTGAGAAAAGAAAGGTTGGAGATGCAGAAGACAG TTTTGAAAGAATCTCTGAAGTTCTGGATAGAGAACATGTTCAATTTATTTGGTCTTGAAATCAACATGATTGCTTTGCTTCTTGCTAGCTTTGCTTTGTT GAACGCCATCTCATTGCTCTATATAGCATCACTTGCTGCTTGTATTCTTCTCCATAGACTAGTTATTAAAAAATTATGGCCTATTTTTGTTTTTCTGTTT GCTTCCATTGTCACTGTTGAATACTTGGCTATATGGATGCGTCTTACTTTTATGAACCAACAAATCAAAGAACAAGTGCCATGCCATGACTGTTGGAGAG TGTCAGATACATATTTTAGCTACTGCAAAAAGTGTTGGCTAGGAATTATTGTTGATGATCCTCGTATGCTTATTAGCTATTATGGGGTTTTCATGCTTTC ATGCTTCAAATTCCGTGCTGACCAGTCATCTCTCACGGGGTTAGAGATGTATCAAAAAGTACTCTCTCAGTGGAAGTCTGCATCGGTACTAAGTGATCTT TCATTTGAAACAAAAGGATACTGGACATTTCTCGACCACCTTAGGCTTTATGGTTACTGTCACTTGCTAGATTTTGTTCTGTCATTGATTTTGATAATTG GAACTCTTGAATATGACATTCTGCATCTTGGCTACCTTGGTTTTGCTCTTGTTTTCTTCCGAAAGAGGCTAAAAATACTAAAGCAGGGAAACATAATTTT TAGATTCTTAAGGATGTATAATTTTGTCCTTATAGTCTTGTCTCTTGCTTATCAATCCCCTTTTGTTGGTGGCTTTAGTGAGATCAAATATGGTTCAATA GAATGCATCAATGAATTGGTTGGATTTCACAAGTATGATTATGGGTTTCGAATTACGTCAAGATCAGCATTTGTGGAAATCATCATATTCATGTTGGTAT CACTACAGTCATACATGTTTTCATTTCAGGAGTTTGATTATGTTTCAAAGTATCTCGAGAAAGAGCAGATCGGTGCAATATTGCGCCAGCAGGAGAAGAA AGCTGCTTGGAAGACAGCTCAGTTGCGGCACATACGTAAAGCTGAGGAGCTGAAGCATCTCCGCAGCTTGCAGGTAGAAAAGATGAAATCAGAGATGCTA AACCTTCAAAATCAGCTTCATAATGTGAGCACTGATGCAAACTGCAGTAATCCTTCACTTGAATGTGATGACCTAAGATATAGAGGAAACACTTCCCCAG ATTTTCATAGGGAAAATGAACTCAGGAGGCAAGATCTTGATATTAATACTGAGTCGATAGGACCTTTTGACATGAATGGACCTTTAATGAGTAACAAACC TGAAAGTCAATTGGTGCGAGAATACTGGATGCATCGAATGGATTCTCCTCATGGAATTGTTGAGGTAAAGGATAGCAATGTTTTTTTGGATTCAGAAACA AGAAGTCGCTATAAAATTCCAGTCAGGAAAAATCCTTTATTTTCAGCTGTACGTCTCATAGGGAGTGGAGTATCTCAAGTGCAGTCTCTTGGAAACATGG CAGTTAACAATCTGATGCACTATCTGAAAATAGAGCATGAAGAACTAGAGTCAAATAAAGATTCTTCTGAGGATGAGGTATACTATGAAATAGAGAATCA GAATGTAGGAGTAGAACCTCTGGAGCCTACCTCCTCCACACACTCTGTTCATGAGCATACCGCTCCTGATACTGCTTGTCTCAGAATTGGTATTATTTTG CGTTACATGTGGTCCCGAATGAGGTCGAATAATGATGTTGTTTGCTATTTCTGCTTTATTCTAATATATCTATGGTACTTCAGTTTACTTTCTGTGGTCT ACCTAGCAGCACTCTTCTTATATGCTCTCTGTCAAAATACTGGCCCGAGTTACATATTCTGGGTTATTATTCTAATTTATACTGAGGTGTGCATTTTGCT TCAGTATTTATATCAAATCATTGTTCAGAACTGTGAGTTTGTTTTCCCTGTGAACTTACTTCAAGAATTAGGATTTCCTGTAAAAAAAATAACATCATCG TTTGTGACAAACAACTTACCTTTCTTTCTGGTATATATATTTACTCTCTTGCAAATCTCCATAACTGTGAAAGATGGTGGTTGGACAACTGCTGCAGATC TCAGCTTTCTTAAGAGAAGAAATCAGAGCTACATAGAGGATGTAATGTGCTCCAACTGCCAAGAGAGATTACAGAGACTATTTTTACCTCTGAAAAATGT ACTGAAAATGTTGATCAGAAACATCTGTCGGTACTGGAAATCATTGACATGGGGTGCAGAAACTCCCCCTTACTTTGTGCAGCTTTCTATGGAAGTTAAC TCGTGGCCTAAAGAGGGAATTCAGCCAACGAAAATTGAATCAAAAATAAATAAGTTGCTAAAGATCTTGCATGATAGAAGATGCAAAGAGGAAAACCTTT TTAATTTGCAATCAGCTAGTAAGGTTCACATACAGAGCATTGAAAAAAGTGAGGAGAATGAGAATTTGTGCTTTGTTGTTTTTGAGGTGCTATATGCCGC CCCTCCAATTGAATTTACTGCTGAAGAATGGTACAGCTCATTAACTCCAGCAGCAGATGTATCCAATGAGATTCGGAAAGCTCAGGACATCGGCATTTTT AAAGAAATTGGGTTCCCATATCGAATACTTTCCGTTATTGGTGGTGTTAAAAGGGAAATTGATCTGTATGCCTACATCTTTGGAGCTGATTTGGCTGTGT TCTTCCTAATTGCCATTTTTTATCAATTAATTATGAAAGCTAATAGTGAATTTCTTGAAGTCTATCAACTTGAAGATCAGTTCCCAGAAGAATTTGTATC AGTTCTAATGGTTGTCTTTTTCTTGATCGTGCTTGATCGTATTGTATACCTCTGGTCATTTGCAACAGGAAAAGTTATTTTCTATTTGTTCAACCTTGTT CTTTTCACATATTCAGTCACAAAATATGCCTGGGACATGGATCCTCTTCACAGATATTCTGGAAGACTAGCACTGCGTGCCATTTATCTCACAAAAGCAC TTTCTCTGGTTTTGCAAGCCATCCAAATTCATTTTGGGATTCCACACAAAAGCATGTTGTACAGGCAGTTTTTGACCAGTAATGTTTCACGAATTAACGT GTTGGGTTTTCGGCTATATCGTTCTATACCTTTCCTTCATGAATTGAGATGTGTGTTAGACTGGTCTTGCACAACAACATCTTTGACTATGTATGACTGG CTGAAGTTGGAAGATATTCATGCAAGCTTGTATCTTGTCAAATGCGACGTGGATTTGAATAGATCCAACCACGAACAAGGAGAAAAGCAAACAAAAATGA CGAAGTTCTGCAATGGGATATGTTTATTCTTCGTGTTAATGTGTGTCATTTGGGCTCCGATGCTGATGTACAGCAGCGGTAACCCAACAAACATCGCGAA TCCAATCAAAGATGCCAGTGCTCGGCTTGATATAAATACAGTAAGTGGAAGGTTAACATTGTTTGAGACAACTTTGTGTGAGAAGATACCTTGGGAAAAG CTTGTAGCACGAACAAGTCTAGATCCTGAGGGTTATCTCAATGCATACAATGAGAAAGACATTCAATTGATTTGCTGCCAACCGGATGCAAGTACATCGT GGCTTGTGCCACCAGTTGTACAAGCCAGATTTATAAAGTCCCTTAGGCGGGACATGGAAATTACTTTCTCCTGGCAATTTACCAGAGATAGGCCTAAAGG AAAGGAATTAGTGAAATATGAATTAACCATAGAGGACCAGGATCTTCCAGAATCTTCAGAAGTTATTGAAGTTTTTAATGGCACTTCCAATAGCTTCACA GTATTCAATATATACCCTAGATATTTTCGGGTCACGGGCTCTGGTGATGTGCGGTCTCTTGAACAGTCGGTGGAGCTGGTTAATGGGGATCTTGTTCTCA ACCGTGGAAATCCAGAGTGGTGGTCATTTTATGATACTGATACCTCGGACGCACATGGATGTGGAGAGTTCCCAGGACCAATGGCTATAATCGTATCTGA AGAAACTCCTCAGGGCATTATTGGTGAAACTCTCAGCAAGTTCAGCATCTGGGGACTGTATATTACCTTTGTTCTTGCTGTTGGACGCTTTATCAGATTG CAATGTTCCGACTTGCGAATGAGAATTCCTTACGAGAATCTTCCTTCTTGTGACAGATTGATGGCAATATGTGAAGATATATATGCTGCAAGAGCAGAAG GTGAGCTTGAAGTTGAAGAGGTTCTATTTTGGACACTTGTCAAGATTTACCGATCTCCGCATATGCTGTTAGAGTATACTCAGCCTGATTAAATTCTTTG AAGATTTGGAAAATATTCAATCTCCTGTTACTGTCTCATCTTGCATGATTATGATGTTTTCCATCGAAGACCAAATGTAAAGGTTGCTCAACTGTATGAA TCTCAAGTTCTATCTTTTACTTGGTTTTGATTCTGAGACTTTGTATGTTATTCCAAAAAAAGGAGATTTGTCTCGTTAACATCAAAATTGGGAAAGTATA TGGTGTTTAATGTAAACTTTATAATGGTTAAACCCTATATTCTCTCACTAATTTATACACTAGTTCTTAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_157132; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_423771
Blastp | Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog from Arabidopsis with 58.17% of identity |
---|---|
Blastx | Piezo-type mechanosensitive ion channel homolog from Arabidopsis with 57.62% of identity |
Eggnog | Piezo-type mechanosensitive ion channel component(ENOG410YVF6) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G48060) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423156.1) |
Pfam | Piezo non-specific cation channel, R-Ras-binding domain (PF12166.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |