Id Trinity | TRINITY_DN48051_c1_g4_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_326637 |
Sequence | ATGAAATGATAAAATGATGCAATCTTTTTTCTCTTTAACTATCATTCTCAATTTGTCATGTTATTTATATCTTTGTTACTTTTTACCTTACCCATAATTT TCCAGCCACGGTTCCGGTCATCCATATTTGTAAATACCAATGATTCATCCACGTGAACGTGATGCATTTAATCTAAGTTATACAAACATGGACAGTCAAA GGGGAAAAATCTAGGAACATTTTATTCAGCAGCGAAAGCAACGCACCGTCATTGTTGACACTTCATGTCCAAAAGAAGAAAAAGTAATTGCTGTCTTCAA CTCAACTGTGTAAGCCTTATAGGTAAATCCTCACCAGTTCTCATATCCTGGTTTCCAGCTTCCAATTTAATCCTGGTCTTATCATGAGGTAGTACTACTT TTTATACTTAATTTGCAAATTTGTAGCTTCGGTAGCTCTCTTTGTAAATTATTGTTTTTGTTTCGAATCTATACCGGTCCAAAAATAAAATTGAAAACCG GTCAAACCGACAGCGAAAGGCGCTAGTACCAATTGTTTTGGATTAGTTGTGGTGGGCTTGGATGCTGCTGCAATTGATCCACTAATGGGATTCCAGTTCA TATTGTTTCTCTTTTTGGCTTCTCTTCGAGTTGGAGTGACTTTAAATCAAGATGTTGCACATGGTTCTCTTCAAGTACATGGAACTGAAGCAAAAGCTGA AACTGGTGATAATTTTATTTGTGCTACTATTGATTGGTGGCCACATGATAAGTGCGACTATAGCCATTGCCCCTGGGGATATTCATCTGTTGTAAATTTG GACTTGACTCATCCTTTCCTTGCCAAGGCAATCCAAGCTCTGAAGCCTTTGAGGATAAGACTTGGAGGTTCTTTGCAAGACCAGGTGATATATGATGTAG GAAGTTTGGGGTCTCCTTGTCATCCATTTCAAAAGATGAAAGACGGTTTGTTTGGATTTTCAAAGGGATGTTTACACATGAAAAGGTGGGATGAGCTGCA TCATTTTTTCAATGAGACAGGGTGAGAATTTTAACATCGAGATTCTTTATTATCTTCTCCGCCTCCTTTCCCCCACTTCCTTCAGGCCAAAGCAAAAGTG AGAAAAATAAAATTAGGTAAATGTATATAACAAAGTGGTTTATGCTGCGGGGAATGCCTCTTTCTATCTAAATGTTTATCATAGTGATGCATACAATTTG AGTAGAAGGTTCACTACTTTCATTATGAGTTATTTCCTCACCTTTGGTTGGGAATGACCCTTCGGAATATGTTACTTATTCTAATAATATGCAGTTATAC ATCACTTCCTTTGTTGTTTATTATTTATGGTTGTCTCTCTTGTGTTATTGGTTAATACTAGTGATAGGTTTTGTTAAAGTGAATGTTAATATATTGGTCC AAGCTTGACTGACCCTATACACTCGCAAACCTTACTTTGTGTATATATATATAAACAGAATTTAAATATCAGCGAATGCTTGTTGGTAGTTTAATTGACA TCCAATTTCTCTATGTGTTACGATATGCATATTCATGTTCAAGGGAGAGCAGAAAGGGGTGGATAGGGATGATTACTGGTGGTATAGTTAAATTAGATTT ACACACTTGCAGGGCCATTGTGACATTTGGACTCAACGCACTTCGTGGGAAGCATCAGAGTAGTCTTCATGTTTGGGATGGACAATGGGATCCTAGGAAT GCTTATGATTTTATAAAGTACACTATCTCAAAGGGATACAAGATTGATTCATGGGAACTTGGTAGGACAGTGGGCTGTATTATTTTTATATGTTCATTTT GTTTCATTTAACCGTAATCTTCCATATGCTGCTGTAGGTAATGAGTTGAGTGGTAAGGGCATTGGAGCATCTGTTGGTGTTGCACAGTACGGGAAAGACT TGATTAAACTTAAACAAATTCTTGATACATTATACGAGAACTCCAACTTCAAACCTTCACTTGTAGCACCTGGGGGATTTTATGAAAAGGAGTGGTATGA CAAGCTTCTTCAGGTTTCGGGTTCAGGCATAATTAATGTTCTGACACATCACTTATATAACTTAGGCCCAGGTTTGCTTGTCACTTATTTAGTTCTTTCT ACTATAGTCATTCTTACAGATATTTAATACTCTGAAATATGTTTGGTGTAATTCTGCTTTTTCGTCTGTTCTGATTTCTTGTAACTGTAAGTAGTATTAC ACTGTCATTGGTTACTATCAGTTGAGGGAATAAGACACATGTTTCATTGGTTCACTATTGTTTATTTCATAAACAAGAGGGTTGCTGCTTCTTCTCATTT ATATATTATATTCGTTAAAGCAACAATGCTTCCTCTTCTGAAAAACCAAATAAACGCAAGATAATATAGAATGTGAAATTTTGACTAAAGTAATATTAAC CAAAGAGCTATTATACATTGATGTTTGGCTATGCCAATTTTTGTAGTGATACCTCTTAGCCTCCCCTCTGTACTTCCCCACCTCTTTGGTTATCTTAGCT ACCGAAAGTCGTTTACACCAATATGAATGTCGACATGGTAGCGTTCCATGCCAACAGGCAAAACTACCCCATGTCTACTTAAATGCACTGTGCTTTTGTG CTTAACTTTCCATCTTTTTATGCTTAATTTTCTCATAAATGCTATTTGTCCTATACATTGAGAGACATGCACAAGCAGCTGATATATTTAATTGAATATG AACTTGTATCGGGGATATTGATTTTGTTTACTTGCTGGGAAATTTCTATTTGCTAATCAGTTTATAAGTTAATTCTATCTTTTAGGTAGTGATGCACATC TTGAACAGAAGATTCTAGATCCCGTGCGCTTGAGCAAGATAGAATCTATTTTTAGCAATCTTACGGAAACCATTCAAAAACATGGTCCTTGGTCTTCTGC ATGGGTAGGAGAAGCTGGTGGGGCGTACAACAGTGGTGGTCGTTATGTTTCTAACACATTTGTCAACAGCTTTTGGTATTTAGATCAACTTGGAATGGCA TCCAGGTACAGTACTCAAGTTTATTGCAGACAGACTTTAATTGGAGGGAACTATGGTCTTCTCAATACCACCACTTTCACTCCTAATCCAGACTTCTACA GTGCACTTTTGTGGCATCGGCTAATGGGAAAGACGGTACTTGAAGTTTCTACTGATGTTTCTTCACCCTTTTTACGCACTTATGCTCATTGTTCAAAAGA CAGAGTAAGTGAGCTACTTTAGTTCAATGTGTATAGAAGGATATGACATGAGTTTGGGGTTCATTCTTCTATATGTGATGTTTGATTACCATTATCTAAG CTGATATGACAACTTTGAAGATTAAATAGCATTTGATATTTAAATTTGATTTTGAGAATCAAGAAAATGTCACATGTATTTATATGCACTAAAGTTTATG ACAGATTGAATTTTAGTTCAGTTATTGGCAGAATCAATGTGATAGCAACAGATATTATCTTGTTTCCGAAACTGCACACCACTATGCCACTTTAAGTGGC TTATATTAAAGTGCTATTTGTTGTCAATACATTGCATTGCTGCATTGGTATTAATTTTTTTTACCTCCTCATACAATGCTGAAATACACTTTGCACAAAC AAATGTGGAACCAGATTGCTTCCCATTATGTCTAACATAAGCTGTTGAGTCAACAAATGAAATTTGATTACAATTGTTAGTTTGAATAAATCATTTTTGT TTCCATTTAATACTTACATATTTTGCATATTAGATTTTAGATATTTAGAATACCTTTAATTTTGTCCCCACAATTGAATCGTTTTTTTGATTTATATGAT TTTTAAGATTATATTCATTTAAGAGGGTGAGTCTCAACATTTAAATTTTGGAAACAGTCTTTTTGTTTGCGAGTATAAGGCTACATACATCTACTTCACC TACCCCACTTGTGAAATATTAGAGTGAGATATTAGGACTTAGTATATGCTAGGCATCCAAAGGATCTGTTAGCTCATAATATTACTTTTTGCATTCCTGA AATTTGTGAATTCATTCTACAGGAGGGTGTAACGTTACTACTGATTAACTTAAGCAATCAGACTCATTTCGTAGTCACTGTTCAAAGCCATGTGATTGAA GGAAATGAAGTGACCAAAAACATCCATAAAGAAAATTCATTCTTTGAAAATCTCAAGAATGTGTTTTCCTGGGTTGGAACAAAAGGATCAGAAGTCACAT TCAGAGAGGAGTACCATTTAACTCCGAAAGACGATTATCTTCGGAGCCAAACCATGGTCCTGAACGGTATTCCACTACAATTAACTAATGAAGGAGATAT TCCAACACTTGATCCAGTACTCAGTAATGTACATTCCCCGGTATACATAGCACCCTTATCCTTTGCATTTATTGTATACCCCAACTTTGATGCTCCAGCT TGTGCTAGGCACCGAAAACTTTAGTCTAAAGATCTATATTTTTGCACTAGTACTACGAAATTGAAAACTCATGATAATTGTGATTAGTGACCTATCTCTC TTCACAGGAAGTTTGTTTTACTTTTAAGTTTATGCAAAGCATTTCAGTTTTCTTTAGCAGACAGTTATTACAATAAATTTGGTCTAGTTATTCATGTGCC AAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_157779; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_326637
Blastp | Heparanase-like protein 1 from Arabidopsis with 61.74% of identity |
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Blastx | Heparanase-like protein 1 from Arabidopsis with 66.43% of identity |
Eggnog | Heparanase(ENOG410YDJW) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G07830) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000518) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019417534.1) |
Pfam | Glycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain (PF03662.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |