| Id Trinity | TRINITY_DN48059_c1_g4_i13 |
|---|---|
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AAAGGCGTAATTAATGAAGTTTTAGAGGGACTCACTGGTCTTCTCCAGTCACCTATAAGAGGAGCAGAGAGGCATGGTCTTCCTGGTGTCCTCTCGGGAG TTGCTTTAGGGATTACAGGACTTGTGGCAAAACCAGCAGCAAGTATACTTGAAGTTACTGGCAAAACTGCACTCAGTATTAGAAACCGCAGTAAACCCAA TCAGTTAAGATCGCAATGCTATCGGGTCCGGCTTCCAAGGCCACTAAGCCGTGAACTTCCGCTAAGACCTTATTCATGGGAAGAAGCAGTTGGAGCATCC GTCCTTATGGAGACTGATGATGGCTTAAGGTTCAAAGATGACAAGTTTATTGCTTGCAAAGCCCTTAAAGAAGCTGGTAAGTTTGTTGTCGTAACAGAAA GATTTGTATTGAGCGTATTCAGTCCCAGTTTGGTAAAATTGGGAAAGCCAGAATTTTGTGGCATCCCTGCTGATTTGGAGTGGATAATTGAATGGGAGAT TGGATTGGAGAACATAATACACGCTGACACTGATCAAGGGGTTGTACACATAATTGGTACTAGACCAGATTCATTATTGCGGCAAAATCAGTTTTCTCCG AAGAGAAGTAGTGGTGGCAGAACCAGATCTAGGAGCTGGAGCCATTATCCTATTCATCTTCCACTTCCTCAGACAAACTTGGAACTAGCATTTGAGGAAG ATGCCTCCAACTTGCTGCAAATTTTGTTGTCTGCTATAGAACAAGGGCAGGGTAAAGGCTGGGACTGTGGGCGTATCCTACATCGAGCTAATCGCGTCTC AATTCCTAGAATCTTTGAATAATTTCTGCAGTGTGATGTGAATCAGAGTTGATCATTAATTGGAATTACCAAGCCTTCTAGGGTTGGGGTAGGGAGAAAG GAAAATTAAAGAACAACAGCATCATTTATCATACATCTGAAAGTTGAAATATGAAAGGGCTTGTGCATCATTTGGATAACTTGTGGTAAGGGTTCTTGGT CTTCTTTTTCAGCACATGAAAGAGGGGAACAATTTTTGAGGTAGCAATTCAACAATCTTGAAGGAAGAAGTTACACAAATTTCTACTTGTAATTAAGCTT GTAGCATGTACGTTACTTAAACTTCCCTGATCTCATTTTGTTGGGGAAAGTAAATATTAGCAATGCTTGTCAAAACGGAGTAATAAAGTATGAAATTTTT ATCATATATCATTTTGGTTCTATGTCATAGGAATCGGAAAGTCCTTTTTTGTTTATGTTTGGTCATGTTTAAATAACACTATAATTTATACAATTTATTC TTTCGTTAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_157864; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_326582
| Blastp | Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13E from Dictyostelium with 26.38% of identity |
|---|---|
| Blastx | Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13E from Dictyostelium with 25.71% of identity |
| Eggnog | Vacuolar Protein(COG5043) |
| Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0268886) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412966.1) |
| Pfam | Repeating coiled region of VPS13 (PF16910.4) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |