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CTGGTAGCAGGGAACTCATCCTTTCTGTTCCCTTTATTTTGTATAACTGCATGGGTTTTCCCCTGTATATAACTGAAACCACTGGTGAAACCAATGAAAG GGGATTTGTCCTTCCTTCTTATTATAGTGTACGTGAAAAGGAAACATATTCTTCAGGAAGGGATGGTCTTTCTCTGCTGTCATTCAGCCAAGATTTACAT GTTGAAGTTCCTAATAACCAAAGTAGTCATCTGAAGAATTATATCATCTCATCCAGAGAAGGTAGACCAAACTCTCCAGGTTTTTTACGGAACTCCTTGT TTTCCGGTAATTACCATGAAATTTTGGGAAGGCAACGAAGCAAAAGTGACTCTAGTCAAAGTTCTTTAGGAAAATTGAAGAGAACAATGAGCTCAAGCAT CCAGTCAAATTTGGGTTCTGATAATCTTGAGCATGAAAAAGTTCGACCACACATGTTTTCTCCAAGCCCTAATTCCCCTGGAAATGATGTTGTTGTTAAA TTAAGTAGATATTCTTGTGAAGATGTTAAGGAACAGTTGCAACATTCTTTGTGGTCAAGCCCATTTTCTCTGCTACCATCAAGTGGTTCGAGTACTGTAC TTGTCCCTCAGTTGTCTTCAAATTCTGCATTCATTCTAGCTGTGACGTCTAACTCACTTGTTGAACAATATGATGGGAGGACAAATGCAATTTCTTTACA GCCTAGATATGTGATCAGCAATGCATGCAGCAAGGAAATATCTTATAAGCAGAAGGGAACTGATGTCATGTTTTATTTAGGAATAGGAGAGCATGCTCAT CTTCACTGGACAGATACCACCAGGGAGTTGCTTGTTTCAGTTTGTTATAATGAATCTGGATGGCAGTGGTCTGGCAGCTTCTTACCAGATCATCTTGGTG 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TATCTTCAGATAGTAAAGGCGTAATTAATGAAGTTTTAGAGGGACTCACTGGTCTTCTCCAGTCACCTATAAGAGGAGCAGAGAGGCATGGTCTTCCTGG TGTCCTCTCGGGAGTTGCTTTAGGGATTACAGGACTTGTGGCAAAACCAGCAGCAAGTATACTTGAAGTTACTGGCAAAACTGCACTCAGTATTAGAAAC CGCAGTAAACCCAATCAGTTAAGATCGCAATGCTATCGGGTCCGGCTTCCAAGGCCACTAAGCCGTGAACTTCCGCTAAGACCTTATTCATGGGAAGAAG CAGTTGGAGCATCCGTCCTTATGGAGACTGATGATGGCTTAAGGTTCAAAGATGACAAGTTTATTGCTTGCAAAGCCCTTAAAGAAGCTGGTAAGTTTGT TGTCGTAACAGAAAGATTTGTATTGAGCGTATTCAGTCCCAGTTTGGTAAAATTGGGAAAGCCAGAATTTTGTGGCATCCCTGCTGATTTGGAGTGGATA ATTGAATGGGAGATTGGATTGGAGAACATAATACACGCTGACACTGATCAAGGGGTTGTACACATAATTGGTACTAGACCAGATTCATTATTGCGGCAAA ATCAGTTTTCTCCGAAGAGAAGTAGTGGTGGCAGAACCAGATCTAGGAGCTGGAGCCATTATCCTATTCATCTTCCACTTCCTCAGACAAACTTGGAACT AGCATTTGAGGAAGATGCCTCCAACTTGCTGCAAATTTTGTTGTCTGCTATAGAACAAGGGCAGGGTAAAGGCTGGGACTGTGGGCGTATCCTACATCGA GCTAATCGCGTCTCAATTCCTAGAATCTTTGAATAATTTCTGCAGTGTGATGTGAATCAGAGTTGATCATTAATTGGAATTACCAAGCCTTCTAGGGTTG GGGTAGGGAGAAAGGAAAATTAAAGAACAACAGCATCATTTATCATACATCTGAAAGTTGAAATATGAAAGGGCTTGTGCATCATTTGGATAACTTGTGG TAAGGGTTCTTGGTCTTCTTTTTCAGCACATGAAAGAGGGGAACAATTTTTGAGGTAGCAATTCAACAATCTTGAAGGAAGAAGTTACACAAATTTCTAC TTGTAATTAAGCTTGTAGCATGTACGTTACTTAAACTTCCCTGATCTCATTTTGTTGGGGAAAGTAAATATTAGCAATGCTTGTCAAAACGGAGTAATAA AGTATGAAATTTTTATCATATATCATTTTGGTTCTATGTCATAGGAATCGGAAAGTCCTTTTTTGTTTATGTTTGGTCATGTTTAAATAACACTATAATT TATACAATTTATTCTTTCGTTAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_157864; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_326571
Blastp | Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13E from Dictyostelium with 26.38% of identity |
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Blastx | Putative vacuolar protein sorting-associated protein 13E from Dictyostelium with 25.71% of identity |
Eggnog | Vacuolar Protein(COG5043) |
Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0268886) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412966.1) |
Pfam | N-terminal region of Chorein or VPS13 (PF12624.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |