Ll_transcript_325676

• Id Trinity: TRINITY_DN48062_c0_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_325676
• Sequence: ATCTGCATATAGGGCATGGCTAAGGAGAGAAAGGTCAACTTCTGGCCGATTAAATGAACTATGCAGGGAGCTGCAAACTGCTTTAGGTACTGCAAAGTGG CAGTTGGAAGAATTTGAAAAGGCGGTCAGGCTAAGCTACCGACATCGTGGTGATGACAATACAAGCTCTAGGCACAGACAGTTTATTTCTGCTATTGAAA GGCAAATTTCCCAGGTCGAAGAAGCTCTAAGGGAATCTTTTAGTAAAGAAGGTAAGCAACCCCTTCGGTGGGTAAATCTCAATGAAGAAGAGAGAGATGA TTTGGCCGCATTTCTATCCGGAACATGTCAGACGATGCAAAGCTCTAAGGATGAATGTATAGAGGTTATTCCTTCCTTGAAAAGATCAGTCCAGGAGAAA CTAGTCAACAAAGAAGAGAAAAAAGCTAATCCTTCCTGCAACCGGGATATCCCGACTAATGAAAAGGTTTCTAAGGATTTCATATCTGTTAACAAGGATA AAGACCTTGCGATAGAAATAAAAGCAGATTCTGTTTCTAGAAATAGTGATGACATAGTTTCTCAAACGGATAGGACAACTACCACAAGGAAGACATGGAG TCCTCCAAATTATAGTGCTTTAAAAATTGTAATTGCTGATGAAAATGAGCAGGGAAACATACCTACAAGGACTACTGATTCCAATCCTAAAGAAAAAGGA TTCAGACCTCTCTTCTGGAAACAAAAATGTGAAGAATATCCTCAGCCCTTGCCAGCAGTTCGGAATTCCAATCAGCGTTTTGGCCGCGTCGGTTTATTCA ATAGACAATTTCAAAGTCCTTTACACTTGCGATATGGTTGTTCTGTTCAAGTTACACTTGCCCTAATGTTGACCATTTTTCTCTTTGGTAAGACTTTCAA TTTCTAGCTCCTCAAGGATATTTGGCCACTGGCAATTCCGTCTGTATCAAATTTGTATCTAATTTAAGTTTTTTCAGCTTTATTCTGATGTCCTGATAAA AAAAATCAAATGTTGGTTCCATTATTATATCTTAACAATGAATAGTTGAAATTCTTATAAGATGCCTATTTCTCTGTAAGTTAATAGATTTGTATTGTAG GTGTTGGAGGAAATGGGGTGAGACTTGAGAGTACAGATAGAAAGCATATCATTAAAAAGGGTGGCCTAGTGCACAAGGCTCCCTCTTTGTCGGGGAGGGT ATATATACACAACCTTACCCCTGCAAGCGGAAAGGTTGTTTCCTGGATTTGAACCATTGGCCTCATTCTCACTAAATAACAGCCTTTCCGTTGCGTCAAA TTCACTCTCTTATAAGTTCACTGCCCTCCCCCCTTACATGTCATAGAAAGTTGGTCTAAGGAAAATTTAAACAAGCCAAAATAATAAGTTTACTATCTCC CCCCTTAAAAATATGGTGAGGCACTTTCTTGTGTAAGTATTTTTCAAGCATAATATCCAAATTACCACTTGGTGTTTGGGTGCCATAAACTGCCAATAGT TTGTGACACATCCCCACCACCCGCAGACACACATTTTTTTGTCCTGGTCGATTTATTTGAAAGAATACTTTCAGCATGCTAGATTTTTCTACTACTATCT CATGCTTTTGCTCTTAGGTTCTGTATCAAAACCTTGCTAATTATGGATATTTTCTTTTCCTACTCTGTAGTCCCCTTTGTACTTTACTCAAGTTAAATGG TTGGCTGCTTTTCTCAACCAGTTTGAAGGTATATTACAACCTCACAACTTATGGCTTTTGTTTTTTGTAATGATAATATTATAAGAACAAAATCTGAAAA TATGCATGTATGCTTGTGGTGTAAGTTAATAGATATCAGGTGAAGTGGGTTAGAAACAATGAAAGATTGCGTTTCCTTTTTCCTCAAATGGTTACAGTTT AGTTTTGAAGGAAGTTATTATTCTTATTTTATTGACAATTTGGATTTGTCCACTACGCAACGCATGCAGACAGTTTTCATGTTCCTTTCACCTATCCAAA TATATTATTTTCATTTCAATGCAAATTTTGACTTTTGAAGCTTCAAGTTGGTGACGTCCAAAACAAATTGATTACGTTCTATTAGTCAATATAAGTATAT AACTACTAAATATTTTTTCAAGACCTTGGCTTTTATTTGAAATCATTATATCAATTTATTTGTTCTTTTCTTCTTCTTTTTAATTGGTGTGTGGCATTTT ATCAATGAATCTTGGACTTTTGCAGGGTTTTACATTGTCTTCATGAATAGACACAAATGGGGTCACTTTTAGTTTGAGATCTGTGCCTGTATTGGTGGGT CAAGTCAGCATAAGGGACATTACAGACAACAAGTGTTGGCTTCTAAACTGTGGTTGTTGAGATTATTAGGATAACCAGCCTAGATGTTTGTAAGGATTGG TGTCTATTTTAGTATCATGGTGCTGTCAAATGTATATACATTCATATAATATTTAATGCAAGTTCCACTCTATCGCTGTATAGCTATTTGGGTTCCTTGT AATTTAATGACGCTGTAGAATTCACATCTGGAAAATTTATGAACAACTCTTTGGTGATTTTGTGGTATGGTAAAAAATAAGCTAGTAATCTTGTTTGGTT AGAGAGGGTTGTTGGCTTTTTATGGTAAATAGTTGCATGAAGGTAATAGAAATGCCCCTGAAAAATTAGCTATATTTTGTTAGAAAATTAAAATTCCATA AACAGAGTGTAAGTTAGGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157876;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_325676

FPKM

• PAB: 2.7
• PNAB: 0.9
• PS1: 0
• PS2: 1
• PS3: 0.8
• PW1: 2.2
• PW2: 1.1
• PW3: 1.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_325676

• Blastp: -
• Blastx: -
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454289.1)
• Pfam: Syntaxin 6, N-terminal (PF09177.10)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;