Ll_transcript_325923

• Id Trinity: TRINITY_DN48068_c5_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_325923
• Sequence: GATGACGTGGTCCAATTATCTCGTCTCTCATTTTTAATAACTTCTTTATCTCTCATTGAACCCTCACATCAAGCCCATTTCTCCCTCCGCCGTGTCCATT TCCGACCAACCACCTCTATAACCACTGCGGCTTCCACATCACCCACCGCAAATTTCTCTCTCCGCCGCGCAAACCTCCGTGACTAAATCCCTTTCGCACT ATCTCTCTCCTCGTTTTCGTCCTGCTTCAGTTCCTATTCTCTCACCAGGTTTCTTTTTCTTTAGCCACCTTTTTAACTCAGGTAACTTCCTATTCCAGTT TCTAAGTATTTTTCTTTTTAAAGCTTTGTTTGGGGTTTCCGGAAACTGTCAGGTAAGACTGCATATATTTATCTTCCCAGACTTCACTGGGTCGAAGTCT CGTAAACCGGGCGGCCCAATTATTGGTTGGGGTTTAAGCACTTGTTGTTAAATTCGAAAAGAGGCTTGTTGAAATTTTTGGTGCTATGTTTCAATTGATG GCTAGGGTTTGGTTATTGTATGCATAATGGGATTAACTTATTGGACTGCTTGAGAGTTTTTAATGGATTGAAATAAATTGAATTGCCACACTCTTGAAAG TCCATTATCTTCGAATAGAAAATGGATTAAAATTGGTTGAACTGCTTGTTTGGATATTTAGTGGGTTTTGTACTGTGTAAGAGGTTTTGAACATTACTGC TTGGTGGGCTTAGTTTTGTGAAGTGGTGTTAGATGCAATGTTGTTTGTTAAAAATCATTTTGGGTAACCTTGCTTCAGTCGGTTTTGCTTAGGTTATAAG TATCATTCGTTCCCTTAATGTTTGAGAGAGTGACATTTCCTTATGTAATTGTTGCTTGTGCTGTGTGTGGGTTTATAACCATAATTAAATTGGGTTAGAT CTACCATGTTTCATTGGCTATGGTGACTCTAGTACCTTGAAGCATTTAGTTATGCCTTGATCATTACCTCTTTGTTTTGCGCATAAGTGGGCATTTTCTG AATGTGGTGTATTTTTTGTTTGAATTGAGGTGTGATTGTTGAAAAGTATTGATGAACTTGCTCACGACTTGTTATGATTGAGCATCAATGCATGCTTCAA ATGTTCCTGCTTTATTGTGAAAATGATTTGACGATTTGATTAAGGATGCACTCGTGCTAAGTTTGGATGATATGTTGAAGATGGATAATATTGTTCATTT ATGTTGTTTATGCTCTTGCACTGTGATTCTTCATGAATTCCACAACCACATTACCATGCATGGATTTAAGAATAAAGATTATAAAACAACATTGCATGCA ACAGCATGTGAAATTAATCAGAGGTATGCAACAGAAGAAAAAGAGTACTAACATATATTTAACATTAATACTTAAGGTTGAGTTTTCGTTATTTTGTTTA TGTAAAGTTCATGAGAAAACCAGTACAGTTGGCATTTTGCATAGAGAACAAAAGCTGGGTAAAAATTATATTTTTAATGTTTAATTTTTTGGTTTGATAT TTGCTAATATTCAGGTTTCCTTGTACTGTCTCTGTCTTGGGTGCTTGCCCATTTATGGCCTACTCTGATTTCTTGAATTTGTTGTTCGCTATTGGGGTTT GGTGTACTGCTTACATTATTGTTGCATCTATTGCCACTTTTCGAGCCATCACTTTTCTTTGCACTTTCTGAACTTCAGAGGTAAACTTCTTGGAATTTGA TAAGGCTATCATGGGTTATGCTCAACTTGTTATAGGCCCAGCCGGTAGTGGCAAGTCTACCTACTGCTCAAGTTTGTACGAACACTGTGTGGCTACTCGG CGAACGATACATATTGTGAACCTAGACCCTGCTGCTGAAAATTTTGACTATCCTGTCGCGATGGATATAAGGGAACTCATTTCGCTGGATGATGTTATGG AGGAACTTGGATTAGGTCCTAATGGTGGTCTTGTATACTGCATGGAACACCTTGAAGATAACCTGGATGATTGGTTCAATGATGAACTGGACAATTATTT AGATGATGATTACTTGGTTTTTGACTGCCCTGGCCAGATAGAACTTTATTCACATGTGCCAGTGCTTCGGAATTTTGTGGAACATTTGAAACGTAAAAAT TTCAATGTTTGTGCCGTGTACTTGCTTGATTCACAGTTCATGACAGATGTGACCAAATTTATAAGTGGATGCATGGCATGCCTTTCTGCAATGGTTCAAC TTGAACTTCCTCATGTTAACATCCTTTCAAAAATGGACCTTGTGACTAACAAAAAGGATGTTGAAGAATTCTTGGATCCTGAGCCCACCTTTTTACTGTC TGAATTAAATCAACGGATGGCTCCTCAGTTTGCAAAGCTGAATAAATCTTTGATTGAACTGGTGAATAATTATAGTATGGTGAGTTTTATACCACTGGAT CTGAGGAAGGAGAGAAGTATACAATATGTATTGGCCCAAATTGACAACTGCATTCAGTATGGAGAAGATGCAGATGTGAAAGTTAAGGATTTTGACCAGG ATGATGATGATGAGTAGTTTTATATACTTTTACAGTACTGCTTGGTATGATTGAAAGCTTAGTCTATCTTTGACAAAATCTTGTATCAAAGTCATTGGTA ACAATAATATCTTGTGTTTTATTATATTGTTCTAGTGTGAATTGTCATGGTGCAATTTGCCAAAATGCCTTAAACCATGGGTGGTAAGAGTTTGGACAGA TAATTTTTACAAATTAACCTCAATGTGGTACTTGGTCAATCAATTGTGATCATTGAAGTTAAACATGAAAATTTTATATTGCTGCATTAGATGAAATTGA ACGTTTATGGGCACCACTACTTTAAATCAACTAATCTTTTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_157933;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_325923

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 1.1
• PS1: 0.6
• PS2: 1.8
• PS3: 1.1
• PW1: 0.3
• PW2: 1.1
• PW3: 1.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_325923

• Blastp: GPN-loop GTPase 3 from Danio with 54.23% of identity
• Blastx: GPN-loop GTPase 3 from Danio with 53.73% of identity
• Eggnog: GPN-loop GTPase 3(ENOG410XPBZ)
• Kegg: Link to kegg annotations (100000326)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449856.1)
• Pfam: Conserved hypothetical ATP binding protein (PF03029.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;