Id Trinity | TRINITY_DN48085_c6_g3_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_327708 |
Sequence | TAGGTGATGGAATGGAGCATGCTGGTATACTTAGTTTATATTGTATTGTAGCCAACAGGGTTGAAAATAGAATATAAAATAGGAAGAGTGGTTAGTGCTT CATATCTCTATATATATATATGGAACAAACATAGGTTACATAACAGTATAAGAGAGCAGAAGGCGCAGCCACAAAGCAAAGCATAGATCTTGTTTTGATA AAAAGAAGAATGGGGGAATCATGGAAACTGGTGGATCATCCAAAGGTAGGAAAGGGGAAGACAATAGCAGTGATAGTGTTGGATGGATGGGGAGAGTCCA ATCCAAATCAGTATAACTGCATCCATGTAGCTCATACTCCAACCATGGACTCCCTTAAGAATGGAGCCCCTCATCATTGGAGATTGATTAAGGCTCATGG TAAGGCTGTAGGTCTTCCTACAGATGATGACATGGGCAATAGTGAAGTTGGTCACAATGCTCTTGGTGCTGGTAGAATCTATGCCCAAGGAGCACAGCTT GTTGACCTTGCTCTTGCCTCTGGAAAGATTTATCAAGGACAAGGCTTCAGCTACATTAAGGAATCTTTTCAAACTGGCACATTGCATCTCATTGGGTTAC TTAGCGATGGTGGAGTCCACTCCCGACTCGATCAAGTGCAGTTGTTGCTTAAAGGGGTTAGCGAGAGAGGTGCTCAAAGGATCCGTCTCCATATTCTTAC TGATGGTCGTGATGTTTTGGATGGTTCCAGTATTGAGTTTGTCCAAACCCTTGAAAATGATCTTGCACAGTTGCGTCAAAATGGTATTGATGCAAAGATA GCGTCAGGCGGAGGTCGCATGAATGTCACAATGGATCGTTATGAGAATGATTGGAGTGTTGTGAAACGAGGATGGGATGCTCAAGTTCTCGGTGAAGCCC CTTATAAGTTTACAAGTGCTCTTGAAGCTATCAAGAAACTGAGAGCAGAACCAAAAGCCAATGACCAATACTTGCCTCCTTTTGTTATTGTTGATGAAAC TGGGAAGCCTGTTGGTCCCATAGTTGATGGTGATGCTGTTGTTACATTCAACTTCCGGGCAGATCGTATGACTATGCTTGCTAAGGCTCTTGAATATCAA AATTTTGACAAATTTGACAGAGTTCGTCACCCTAAAATCAACTACGCTGGAATGCTTGAATACGATGGTGAATTGAAGCTTCCAAATCATTACCTTGTTT CTCCACCAGAGATTGAAAGGACTTCTGGTGAATATCTAGTGCATAATGGTGTTCGTACTTTTGCTTGCAGCGAGACGGTTAAATTTGGTCATGTCACATT CTTCTGGAATGGAAACCGCTCTGGGTATTTTAATCCAGAAATGGAGGAATATGTGGAAATTCCCAGTGACTCTGGGATTACATTCAATGAGCAACCAAAA ATGAAGGCACTGCAGATTGCTGAAAGGACAAGGGATGCTATTCTTAGTGGGAAATTTGATCAGGTACGCGTCAACCTACCAAATGGTGACATGGTGGGGC ATACAGGTGACATTGATGCAACAGTTGTGGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTCAAGATTATTCTTGATGCAATAGAGCAAGTTGGTGGAATTTATGT TGTGACTGCTGACCATGGAAATGCAGAGGACATGGTGAAGAGGGATAAAACTGGAAAACCTCAATTAGACAAGAATGGAAATATCCAGATTCTAACTTCC CATACTCTTGAGCCTGTGCCAATTGCCATTGGAGGTCCGGGATTGTCAGCTGGTGTGAGGTTTCGAAATGATGTTCCGAACGGTGGGCTGGCGAATGTTG CTTCAACTGTGATGAATCTTCATGGGTTCGAGGCTCCCAGCGACTACGAACCAACTCTGATTGAAGTAGTTGATAATTAACAGGTGTATTATAATTTGCA CTTATGCATGCAGGGAGAGAAGAATAATCAAATCCTACTTGCCCATAAAAAAAAGAATAATGAAAACTTGTGATCCCTCCACATGTTGTATGGTGGATGG GGTTTTGTTGTATTATTTTTGGTACATTTGTGCCATTCAAGTTTCAACCGATGACCACATGCAAACTACCATATATGATTATTTGGTGGTGGGGTTTGTT CTTTTCATCACGCTGTGGTTTACATGACTGAATAACTAATTAATGCAAATTTGATTTTTAAGTGAATTTGATTTATAACTTAATTTGATTGAGCTGAATA ATAGGTGAATGAGATTATTTGTGAATTGTGATTGGGCTTGTAATCTCCGAATCATGTTTATGAAGTATGATGTGAAGTTGGAATATCTACCCTAAGTCGT ATTAAAGTGGTTGCTTCCCTCATAAGACAATTTAATTACGGTCACAGAGTGAGTCTTGATGAAAGATAAAAGCACAGTTAGTCTTGGATGAAAGAATTCT CGTGGGTATTGCTTGTGATTCAATTTATCTGGATATGTCACGCTTCTCTTTTGTAGTCATCTTTGGATTAAATAAAGAAGCTCTTTAGCGGGTTCAGTGT GCCAAGTGTCCTTAGTTGATGGAAGAAAGATCATTTATCCTTAAAAAAAATCATTATCTGTCCAGGATAATAAAATTGTGTCATGCCATTTTCTCAAATT CTCAACATTTTTGACCGAAGCAACATCGTTGGAGGAGTACCCAAGTATGGTAAGAAGGGTGCATTGGCTAAGTTTATGATTTCATTTTTAAATTATTTTC TTATTGCTTCCAATATAATACTATGATAACTTATACCAACATTATTCACATTTAATAAATGAATCAATTGACACAAAAAGACAATTTGAGTCTTTGAGGT TGTTTGTTTGTATGGTTGTAGCACCTATATTTTTTATCCTTTCTCCCGGACCTACCTCCTAGAATGACCAGATGCATATTTTTAGTAATATCTGATATAA ATAAATTGGTGGTGTATGATGTGGATTTTGTTTTGTGTGTAACTACCGGTCTTGGTTTTCTATAACTCATCATCTTTGACGAATGGTTAATTAGACTTAG ATTTAGATTTAGATTTAGAGTCATTGTCATTGATCGTTGGTTGTTGATGTGAAGTGAACCCTGTTTTTGGGAGAAGTCTTAATCTGTATTCATAAGGTTA ATATTTGATGATTATGTGTTACTGAAATTGGTTAAAAGATATTAAATATAGTTAATTAAAATAAGTATTATTATAAGTTAGTGAAGATGTATCCTTATAA TAATAGTTAAGTAGTGAAGAAAAGAAAATAGGTAGATAGATAGAGAAAGAAGTGTCGGTTGAGGGATGGGGTATAGTAATAATTAGAGTAGATTTGGCAG GAATGGTATCAGTTGTCTCAAAGTATGTCCCAATCATGTACCAAGTCAATCAGAGTAAAGGAAAAATAAATAAAATATGAATGTTTAATTTTTTTGACTG ATGTGGCATGTTGTTATTGGTTTGGTACAGGCTTTGGGACAGGATATGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_158077; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_327708
Blastp | 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase from Cryophytum with 86.98% of identity |
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Blastx | 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase from Cryophytum with 86.98% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459738.1) |
Pfam | Metalloenzyme superfamily (PF01676.17) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |