| Id Trinity | TRINITY_DN48087_c1_g1_i11 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_328095 |
| Sequence | CTTATAAATTGATGAGCCACCCCATATGATATCATACCACACCTCTTAATATTGATCATTTCCATTACCAAATTCAATCCAAAAATATTTCTACTATTGT CATGTATCAACAAACCTCAGATCATGCATACCCACCACACAATCAACCCACTGCCACCGGGTACCCGGTGAGTTACAGCGGCAACCACCCCTCGATTCCG CCGACATCAGCACCACCACCCCAGTTTAAAGCTATATCTGACTGGTCTACAGGCCTCTTTGGTTGTTTTTCGGACTGCCATAGTTGTAAGCCCCTCATTT ATGTTTATCTAATGTATATGTTGTTTAAACATTGATATAGACTATTGTATATATGATGAAAGATTCAGATCATTTTACTCAATCAATAAAATAATAATCG ATTATAGTTAGAGTGTGAATTTCACATTAGAGCTTTGCCCCCTCATCACATACATCTCTTTGCTTTCATAAAATGATCATTACGTGGGATAAAGTCTCGT GTTTCATGAATATGTGCTGTAACATTTGATTAGTAATTTTTTGTATACAATTACTTATTTAAAATATATATAATTCTGTAATACACGTTATGGGACAATG GAAATACAAATTTTTATATTGGGTAAGGAAATACAAAATTTTAATTAACTATGTGCTGTTTAGATAAAGGGATAATTAATTACTAGTAAGTTAATCAAAT ATTAAAAAAATGCACAGTATTAACTTGACTAGCTAGCTAACAAATTTGGCTTACTTGATTACCATAGTTGCTAAGCTATGTATATGTTATATGTTGCTAG GCTATATATACCTGAAGTGATTTTTTTTAACTTGCTCTTGTAATAAGTAGATGGCTTCTGATAAATTAATGTTTAATTTTTGTTTCAGGTTGTTTAACGC TATGGTGTCCATGTGTCACATTTGGTAGAATTGCAGAGATAGTTGATAAAGGATCAACTTGTAAGAAACTGGTCCTTTGAACCTTTACTAGTTCAATTCA ATTATTTTATACATATATGAACGTAACAACTAGTGAAATTCACATTATGGGTTTTTTATTTTTTTGTATATGATGGATCATGTTAATTATTGTTTAATTT GTGAATAATTGCAGCATGTGGTGCTAGTGGGGCACTATATACATTGATTACATATTTGACCGGTTCTGGTTGTTTATATTCTTGCTTCTATCGAACCAAG ATGAGAAAGCAATACATGTTGAAAGAGAGTCCTTGTTGTGATTGTTGTGTTCATTGTTTTTGTGAGACATGTGCCTTATGTCAAGAATATCGGGAGCTTA AAAGTCGTGGATTTGACATGGTCGCTGGTATGAACTATTATTATTTACTATTATCGCTTTTTCTCTATGGTATTGCCTCCTATTTTTGTTTTTTACATGA GAATTGATTTTTGATTCTAGGTGGAAATGTCTTATGTATTATCTTTAAATATATTGTCTTAACTATAATATGATTTTATTGTTACATGTCACCATTTGTT TTTTATTAATATATTATCTATACATTAGTTAGTGTAAAGATTTATATATAGTTAATATCACATTTATCATTCATTTGTATTTTTTTAAACATTCAATTAT GGTTGAAAATAAATAATAAATGATATGTATAAAGATTTTTGTCCTTCTTTATATTGGGCTCTATGGTGAGTAATTCTTCAATAAATAACGTGCATAACCA GTCTTGTTTACTTAATCGCTTTACTGCTCTATTACATATTTTGTCACCTAAGAACTCCATTAACATTTATCTTAAAATCTTTGAGATAAAGATGTATTTA TTGGTATATGAGTTTTTTATATAGTTATATCATTCATATTTAATTATTATTAATTCTTTAAAAAAGTAAAAAAAAAATAATACAAATGCTTTCGAACTTT TATCATAATTATATATAAATTTTTTACTGACAATGCATAGATATTACACTAAATATTTTTCAGCTGCATCTCCCATAAAAAGAATTCTTTACATATAAAT TTATTTTATCTCTCTTCCTAGTTCCTACAATTAAATCTCCCAGAAATGCTTTCGAACTTTTATCAATAAGAGAGGGTGAACTCTTGAACATGTTCTAAAT TTCTAATTAATTATCATAATACTCATTTAACCTTTAAAATTCCCAGCAAAGTGAGTAGTCAAAATAGTGAAAAGGTTAAAGCTAATAAGTATAGAGATAA ACTTTCTTACAAATCATTATGAGTTTAACAATAATATTTTTAGAGCAATATAATATCTATCATTCATTTATATTAATTTTTATTTAAGAGTCAATAATAA TCAATACATGAATAAGAAGACAAAAGACTATTAAAATATGGGGAGAAATCAAGTTACTACAACAGTAAGTTTAAAAGACTTATTCCTCATTTTATACCAT TAATTATAGGTGAATCCAATGGTTTGAATTAATTATAAATTTAAACTATCGAACTTCCGATAAATTGATAGCTTTCAATTGTTTATTTTACTTGAATATA ATTTCTTTGACTTTTTTTTAGGGTGGAACGCAAATGTTGAATTGAACCAGGGAGTATCCATGGCTCCAACATATGAACACATGACCCGTTGAAGTGAGAA TCCATGTGCATAACACAACACACGAATTAGATTTTGATGATCAATACTATTATTATATATGGGCTATTGCTATTTTGTTTATTTATATAGACTATAGTTG GTGTAATTAATGTTACATGTTCTGAAATAAATAAAAATATTGCGACGTTTCTTCACGCGCTATTACAATGTGACTGGATGTGATGCAAGTTTTACCTTCG TTTTGTATATTTATATGATTACATTTTAGTGCCACCTTGATGATTCAAATATTACTTTCTATTCATACTACTC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_158087; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_328095
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Cell number regulator 10 from Zea with 59.46% of identity |
| Eggnog | Protein PLANT CADMIUM RESISTANCE(ENOG410XUTP) |
| Kegg | Link to kegg annotations (100284761) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000550) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_017406922.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |