Id Trinity | TRINITY_DN48087_c1_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_328083 |
Sequence | CAACCATATATATTATCTCATAAATTTCATGTGGTACTTCATGTAATTTAATTATGTATCCACAAGTCTCACACCAAGCAAAGCCACCACCGTACAATGA GGCTGCTGACACCAACATTCCGATGAGCTATAGCAGTACTACAACACCTTACTTCTCTGCCGATTCAAACTACCAACCACCACCACCACCACCACCTATA CCTCCGGTCGAATGGTCCACCGGTCTCTGTCATTGCTTCTCCGACTTACAAAATTGTTGCTTAACGTTATGGTGTCCATGTGTCACATTTGGTAGAATTG CAGAGATAGTTGATAAAGGATCAACTTGTAAGAAACTGGTCCTTTGAACCTTTACTAGTTCAATTCAATTATTTTATACATATATGAACGTAACAACTAG TGAAATTCACATTATGGGTTTTTTATTTTTTTGTATATGATGGATCATGTTAATTATTGTTTAATTTGTGAATAATTGCAGCATGTGGTGCTAGTGGGGC ACTATATACATTGATTACATATTTGACCGGTTCTGGTTGTTTATATTCTTGCTTCTATCGAACCAAGATGAGAAAGCAATACATGTTGAAAGAGAGTCCT TGTTGTGATTGTTGTGTTCATTGTTTTTGTGAGACATGTGCCTTATGTCAAGAATATCGGGAGCTTAAAAGTCGTGGATTTGACATGGTCGCTGGTATGA ACTATTATTATTTACTATTATCGCTTTTTCTCTATGGTATTGCCTCCTATTTTTGTTTTTTACATGAGAATTGATTTTTGATTCTAGGTGGAAATGTCTT ATGTATTATCTTTAAATATATTGTCTTAACTATAATATGATTTTATTGTTACATGTCACCATTTGTTTTTTATTAATATATTATCTATACATTAGTTAGT GTAAAGATTTATATATAGTTAATATCACATTTATCATTCATTTGTATTTTTTTAAACATTCAATTATGGTTGAAAATAAATAATAAATGATATGTATAAA GATTTTTGTCCTTCTTTATATTGGGCTCTATGGTGAGTAATTCTTCAATAAATAACGTGCATAACCAGTCTTGTTTACTTAATCGCTTTACTGCTCTATT ACATATTTTGTCACCTAAGAACTCCATTAACATTTATCTTAAAATCTTTGAGATAAAGATGTATTTATTGGTATATGAGTTTTTTATATAGTTATATCAT TCATATTTAATTATTATTAATTCTTTAAAAAAGTAAAAAAAAAATAATACAAATGCTTTCGAACTTTTATCATAATTATATATAAATTTTTTACTGACAA TGCATAGATATTACACTAAATATTTTTCAGCTGCATCTCCCATAAAAAGAATTCTTTACATATAAATTTATTTTATCTCTCTTCCTAGTTCCTACAATTA AATCTCCCAGAAATGCTTTCGAACTTTTATCAATAAGAGAGGGTGAACTCTTGAACATGTTCTAAATTTCTAATTAATTATCATAATACTCATTTAACCT TTAAAATTCCCAGCAAAGTGAGTAGTCAAAATAGTGAAAAGGTTAAAGCTAATAAGTATAGAGATAAACTTTCTTACAAATCATTATGAGTTTAACAATA ATATTTTTAGAGCAATATAATATCTATCATTCATTTATATTAATTTTTATTTAAGAGTCAATAATAATCAATACATGAATAAGAAGACAAAAGACTATTA AAATATGGGGAGAAATCAAGTTACTACAACAGTAAGTTTAAAAGACTTATTCCTCATTTTATACCATTAATTATAGGTGAATCCAATGGTTTGAATTAAT TATAAATTTAAACTATCGAACTTCCGATAAATTGATAGCTTTCAATTGTTTATTTTACTTGAATATAATTTCTTTGACTTTTTTTTAGGGTGGAACGCAA ATGTTGAATTGAACCAGGGAGTATCCATGGCTCCAACATATGAACACATGACCCGTTGAAGTGAGAATCCATGTGCATAACACAACACACGAATTAGATT TTGATGATCAATACTATTATTATATATGGGCTATTGCTATTTTGTTTATTTATATAGACTATAGTTGGTGTAATTAATGTTACATGTTCTGAAATAAATA AAAATATTGCGACGTTTCTTCACGCGCTATTACAATGTGACTGGATGTGATGCAAGTTTTACCTTCGTTTTGTATATTTATATGATTACATTTTAGTGCC ACCTTGATGATTCAAATATTACTTTCTATTCATACTACTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_158087; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_328083
Blastp | - |
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Blastx | Cell number regulator 10 from Zea with 59.46% of identity |
Eggnog | Protein PLANT CADMIUM RESISTANCE(ENOG410XUTP) |
Kegg | Link to kegg annotations (100284761) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000550) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_017406922.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |