Ll_transcript_326461

• Id Trinity: TRINITY_DN48095_c4_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_326461
• Sequence: ATACATTCATTCATGATCTGGTGGGTTTGATACACTGCAAAGATATGAAAACAACTACCACTGCTACTGTTGAATTGACAGAAAAACTTGGTTTGAGGTG AGACTTAGAGGAAAAGTAGTTGATTATTTGTTTTTGGAAACCCTGTGATCTGCGGTTGCCATGGATGCTCCCATTCCACCAGGTATGCTACTTATAACAT CACCATTTTCATCTGTCCCCTGCTTCTCCTGCATCTCAACACAAATCATCTATTTTCTACACACCTACTATAATACATAGTATATAAGCAGAATCATAAA ATGTACGTACTTACTGGTGGAACATTTGATTGTGTACTGTTATCATAATCTTGGTTGGCAGAAAGACGAGGATTCAGATCTGCATGACCGCTTTTGTTAC TTATGAAATCAAAGTCCTCGGTTGGTGCAACTTCAGGAGCTTTCACTGAGGCAGGAAGATCATCATCCACCGTCGATCTATACGGATCGTCATCATCGTC GTCGTCATCATCATCATCTTTCACAAAATGCCCCAACACCTGTTTCAATATATAACATATGACATGATATGTAGAGATGATATAATTAGAAACAAGGAAA TATAATGAATGACCTCTCCACCAAGGGTCTGAGTGAGAACACGTTTCCCTCCTACACATTTGTCCTCATAAATGGAAGTGCCATCATTTCTAGCAATGTT AGTAGATGCCTTATGGCCAACAACACCAGCTCTCTCATTCTTTGCAGCTGCTGATTCCATAAGTGATGCAGGACCACCCTTTTGAGTATGTCCACCCATT ATTTGAGATTCCACTGATTGCACCGTCGCTGCATCTCTTGGTGTGATGGGTTTTGATGCTAACTCTCCACCCACTTCGAACACATCACCATACCTGATAC CTCCTTCTTTATTATTACCTCTCTTGGGCTGTTCCTGGCTCATCATGCTACTATCACTTTATTAGTTTCTATAGTGAATCCAAGTACCACCTTAAGGGGT TATATATATATATATATGGGTGAATAGGATGGATATATCAAAATCAAAAAGGCATTGTTATCCAAAATAGATGTATAAAGTAGATGGAAGCGGTGATGGA CAGTGTTATTTCATATTTGAGACATGTGGCCATTACTTGGCAACTTCTCACAATCCTTACTCACCTTCTATGCCACAACAATTTCTAATTCTGAATTACC AATTTCTCTGCTACACACTACATAACATAACATAACATTTCACGCAACTTTGATGAACCAAAATCAAATACAACAACATAGTAGTGCATACTATTAATGG AAAAATGGACTACTGTTGTACTTTGGACTCACCCAAATACACCATATTACAATATTACTTGGGCCATTATACAACCAATTTTTTTAATCCTATTTGGGTT TCATTTTATAACTCCACGTCTCCACCATTATTACGTTCAATGGCCCAACCTAGAATTAGGAATAGTTGCGCCACGTTACAGATCATGTCTCACATCAATG CTACCAAAAGTTGCGCCCAAGTAAGCAATCATAACTTAGAAGCTTGTATGAAAAAAGAAACTTAGAAGGTTGTATTAATGCGACCGTTACAAACACAAAC ACTTCGCATTATTATATTTCACTCTCTTCCCATAAACATACAAACACTACTTTCACTTTCAGATCCCTTCAATCAAACTCCATTCCTTTCCCATACAACC GGTAAATTTTTGTTCTTCACACAAAAATCCTGATACCCATTATTGCACCTTCTCATTTTTTCTTCACGTTAATCCTATTTTATTAAATTCCCTTTCCCTT TCATGCCTTATTAATTTGTTTTCTTTGCTTTTATTTATGTTTTTTTCAGTGTCCGAGGAAATTTTGTTTTGTCCTGGGTGGTGGTTTAATCACATTGTTC AGTTTGGAAGAAGATTTGTGTTTCTAACTATTACAACAACGTTTTACATTGCTGGTTTTCTAGGACATTATCTGATACATTGTGCTAGGTTGTGGTGGTG AGATCTAGTAGAATAAACAACCTTAAAATCATTTTATACTGTTATTGTTACAATGGAAACACTTATTGTTATGTCACAACATCAGCATAGGAACCAATAC TACAGCAGCACTAGGTCTAAGCTACAAGGGTCTTATTGTTCTTCACCTTCCAAAGACTTTAGGGTCATAAATTGCAAAACTTTTCAAAGAGGAAATGGTA TTCTACCAACCCCATTTAAGTCTTATGCTTATTCTTCACCTGTAACCAAAAGAGCATCTTCATCAAAAACACCATCAGATAACAAAACCCTTTTCAAAAC TAGTACTCCGAACAGCACCCCTGTTCCTATCAATGCCAAAGCTTGTAAAAAGGACACAACTTTGGTTGAGGGTCTCTCAGATAGCAAAACCCTTTGCAAA ACTAGAACTCCACAAAGCACCCCTATTCTTATCAATGGTAATGCTTGTAAAATGGACACAGCTTTCTGTGATAGAAGCTTGTTGTTTTCAGAACTATGGG CTGGACCGACTTACATGAATTCACCACCACCTAGTTCTTTGCCTATACCGAAATTTTCTGTTACACCTGCCAGGACTGTGTCTCTTGATCTATCTGGTTC CTCACCTGAGATTGAAATGCACTATCCGGTTGCCAAGTCCGTGCTGTCCTCCCCTTGCAGGGAGTGTTCCTCTTGTATGGTACACTTGTTTGTTAATGAT GATTCTGCGACAAAGATGCTCTGTCGCATTCTCAATCTTAACTTGAATGACGAATGAGATGAAGGGGGGGCATATTGAGTAAATAAGCCTTTTTTATGTA TGCTGTTGGATTAGAGTTTTAGGTGTATATACAGTGATCAAATAAAAGTGTGAGTTTGTGTTACTTTCACTAATGGGGGTTGTGGGGAGCCCTTCACTAT GATGATTGATGGCTATGGTGGGTTGTCATTGTTGTAAATTGGATAGCTTAGACATGTGGAGAGAGTAAATGGTCCTTTCTTTAAGGCTGTTTTGGGAGAA GGGTTTGATTGTGATGTGTATAGAGCCTGCTATGAAAATAGTTGGGAAGCAGAATGGTGGTGATAATGGTGAGGAGGAATGTTGAGAATGGCCTGAATCA CGAGTTCATAATATGTAGTTCATACTTCACATTATCCTTCCCATAGCGTGCTTTACTTTTAATCCAACAAATGATTTAGGTCTCTTATTTTTAGTACATA CTGTAGATTGTAGAACTCTTCACTTATAACTCTTTAGAGCTCAATACTTGTGTCCTTGTTTTTCCTTTCAATTCTTTCTTTTACCTTTGTCCTTAATCAT TCTGTTCTAATATGTTTACACATTCTAATTAGTGATCTTCTGCGTACCTGTTAGTAGTTACTACTTACAACCTTGCCTACTGATCCTCTATCTTTCTTTC CCAAAGTTAACTCCCATTTCTTAGCTTCCCTGGTTTGTCCCTTCACTACCTTTTCTATTTTTATCAAACGAAAAGGTTGAAGGGCTTTAGTTATAACTTA TAAACTTTTATGGTGTCTGCTTAGTTTTTGGGCTAATTCTTATCACAGTACTTGTTAGTAAGCCCTTGATATTTTCCATTTTCGGTATTTGTTAATGCTT CTTTCCTCATTCTTTCACCTGCCTTACCTTCCAGTTCCATTGAGAGTGTTGACAATACCATACCAATACCATAATTAAGGTTGGCTAAACTGTGCTGAAG CTGTTTTGTTCAAGAGACGTGATGATGGTCTTGTGAGTTATTAGCTCCATTGCAAGCTTGTTTTTCTTCATGAAGTCCCTTATGGCTCATAAGCTTTTCT GTGCATTTGGTTAAGTAAAATTTCATTGACTATTATCTACGGACCACGTTATTGTTATACATGAATGGAGCACTATATTCTCTTCACTAATTTTAACTTA TGTGGTGTTACTTTAAACTATGACGACTCTTGACTAAATTATGTTGAAGGAATTGTATTTTCATATCTCTTGTTGATATGATTGCTTGTTGATCTTAATA AACTTAATTTGTCTCAGCATTGATTGGAATATGGAATATAAAACTTCTTCATTAATGATTCTTGTACATAATGTTTTTCCCATGAGTTGTGATATTTGTA ATCTCTCTAGGACTTTAACTCACTCATTTCTCTCATTCTCTGTTCTGGATCTCATCTTAGATGATTATGTGTTCATACTTCTCATACTATCATGGATATA AGATGGTTGCATGGCCCTTTCTCTTCAAAAACTCAAATAGTTGTTGGATATTCCAAGTATGAAGAAGAATTCTCATATTGTGTAGAAGTTTGATGAGTTA GAGAGCATATAAGTGAATGAACGCATAGGCCTAATGCCTTAAGGGTGAAGACATGTATCAAGCCCACATATATGAACAAAATATCCTATTAGTGCATACA AGGACAAGAGAAAGTATATTTTCCAGGGAGTAATATATTTTTGGTAGCTTTATATTTCCAATGGTATATGTTCCACCTAAAATGAATGTACTTGCTCTGA GAATTGTCCCATACAGCCTTGCCTAGAAAACTTTATGTGATGAAGACCTTTACAATCAGTTGCATTCTTATGATAATTGAATAATTGCAGCTGTTTTGGT TGAGTCTCAACAGATTCATGCACATAAAATTTCATAACAGCAATATAAAATGTGAAGGCTAGAGGCAGTTCATTTCTTGTAACAAAGAGAAGTGTGATAG ATGAAAGTGATTGTCTCTGCTAATTTGATTAAGGGGCGTTTCAAAGTTTTGTCAAATGTGAGATGCCTTATTTCATTTTTGGGCAATACATTACTTATAC ATTTCATATTTATGTACTTGTATTTTGGTGATAGTACACATTGCAAACATAATGCCAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_158168;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_326461

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 0.7
• PS1: 0.7
• PS2: 0.4
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.3
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_326461

• Blastp: -
• Blastx: Late embryogenesis abundant protein D-34 from Gossypium with 47.86% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019456884.1)
• Pfam: Proline-rich nuclear receptor coactivator motif (PF15365.5)
• Rfam: -
• GO: -