| Id Trinity | TRINITY_DN48121_c5_g4_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_509718 |
| Sequence | AGACAAAAAAACATTATTATGTGGGTGTTTTCCTTGTCTAAATATTGAACATGTGTGTCTAGGAGCCACATATTTAACAAAAAACAATTTTATTTATTGG TAAGGAAAAAGTTTGAATGTACTTTTGATTTATAGTAGCAGTTGGCTTTGTCATTGGTAGTTGAAGGAAACTAAGTGAGAGTGATGGAGAAAAACTGCAA GGTTTGTGTCACAGGAAGCACTGGTTATATTGGTTCCTACCTTGTGAAGAAGCTCTTGGACAAGGGTTATACTGTTCATGCAACTCTTAGAGACTTGAGT ACTCTCTTTCTCACTCTTTCTGCAATTTCTCTATTAGGTTTTGAATCTAAGTATACAAACATGTCAAACAAGCAAAATCAAGAGGATAGAAACAAAGAAT TTGATTGAGATTTTGCAAACTAATTAATGGTTTGGAATTGCAGAGAATGAGTCCAAGGTGCGTCTTTTAAAGGGTCTTCCACATTCAGAAGGGAAATTGT TGTTGTTTGAAGCAGATATTTACAACCCAATTGATTTTGAGCCAGCAATTCAAGGTTGTCAATTTGTTTTTCATGTTGCTACTCCCTTAGCCCATGAAGC TGGCTCTCAGTACAAGGATAGTAGTGAAGCATCACTGGCTGGGATAAAAAGCATTATGATGGCTTGTGAAAGAGCTGGAACAGTGAGGCGTCTAATCTAC ACTGCCTCTGTGGTTTCTGCTTCTCCATTCAAAGATCATCAAAGTGGTTTCAATGATTTTATGGATGAAACTTCTTGGACCCCTCTAAATGACTCATTCG CATATTTGTTCCTCGATCATTATCATAAGGTTAGTTTGCTGTTTTGATTATTAATCGCTTGAAAATTTCGTGTGTACTAATTTAGTTTCGAAATTTTTGA AAAACTCAAAATAAAACACAAAAATATCGAATATGGATCATAATTGTTTTTTAGATTTTTTGTGTGACTCCTGATAGAGACTATTTTGACTCATAGTGAT AATATTTTAAGTATTAGTTTAAGATAACAAATTGGATAAACTAGACGAAAATTTGAGCGACATAAGTGAGACGAACAGGGTAAGACGAAAACGGCGATTC ACAAGCGGCGTTTTCTCTCCGCTAGGGTTCTTTAGTGCTTCCAGCTCTGTAAATGTCTTCAACTCTTTCTCTTTGCTTCCTTCAATCATGCCTTCCCATG AACCTCTAATCCCATGGGGTTTCCTCGGTGATTGGGGGTATTCGCAAAAACCCTTTTCCCTGGTCCCCTGCGAAAACATTATTTGCACAGACACTAAAAA ATTCATGTGATATCTTCATATAACAGTTACCGCAACCTTACATCAAAGGTGATGCCATTACGATTAATATACCTGAAGATGAGTATGAAGCAGGGTTACA AAGGTGTAAAAATCACCTTCATGGCATGATCATTCTTTCCAAGGGTGATAGAACCCTGAAATTTATGGAGCTTAAAGAGAAACTCAACTCTTTGTGGTAT ATGATTGGAAAATGATATATGATATCTTTGGGGAAAGGGTACTATGATTTTGCTTTCTCAACTATTGAAGATATGAGAAGTGTCTGTGTTGTGGGTTCAT GGAGTCTCAAGCCTGTATTTTTAAGGATGTCGCTCTGAACTCCTGATTTAATCAGAACGTGCAAAAGTTGTCTTATGCTCAAGTTTGGGTAAGGATTCTG AATTTGCCTAAAGAGTATTGGAGCCCCAGGATTATTTCCTCAATCGAAAGGGACATTGGAACTCCGACATCATTACACGATACTACCTCAAGTAGATCTT TTGGTTATTTTGCAAAGGTTCTGGTGGAACTAAATCTTAAAGATGAGCTGCCAAGTCAAATCCTTGTTGAAAGAGATGGGTTTGCTTTTTTCGTCCCCAT TGAATATGAAAGTCTACCTGATTTCTGTTCTGATTGTCTCTCTATTGGGCATCAGCTTTCGGCTTGCAGGAAAGCAAAGAAGAAGGTAGCATACGAGGAG GCACCAAAGAGGGCAACAATGGAACCAAAAAGAACCACGGTTGAACCTATAGTCCCTGCAACTATGGTGAGTGATCTTTTTATCAACTTGGAAATTGAGG AAAATGTCAACACAGAGGGATTGGTGAAAGTTTATTGCTTGCCATTGAGAGGTTGCAACTCTCAAATTCCTATTAAGGTGGAACAAAATGGGGAAGATAT GGCAGTTGAAAATGTTCTATTAGATGTCATTCAAGGAAGATGAATATATAACTAATCCTGTGGTAGTCAGCGATATGCGACTAATAGGAAGGTTATGGGA TGATGATGACCTTGCTGAAGAGGTGGAAGATGAGGATAGCTTCACCCCAGTTTTGAGCAAATCACAAAAGAAAAAGCTGAGGAAAAAAGCTAGTAATGAC AGAACCTACTATACTCGGAGGGGTGGTCTTGTTAATCCTGATAAATGAAGATTCTCTATTGGAATTGCCGGGGATTTGGAAACCTTAGAACAAGGTTAGT GTTTAAGAATTTTTGTTTAGCCAATAAACCAGATTTGGTTATTCTCTCTAAGCCCAAAATCTACTTTAACTCAATCCATTCTAATTTTTGGGAAGTTGTC AATTTAAAATTGTTTGCTAGCAATGACTGTGGTAATAGGGTGCAGGGTTGTGCATTAACAACTTAAATCCTTTTGTTCTTGGTTTCTCTGAGCAGTTTAT TGCTTTCTCTATACCAGCTACATCATTCGTAGAGTGCTTTGGAGTGACATACAATCTCTTATGATAGCTCATCAGGGTGCTTGATCTCTAATGAGTGCAG AGGTATGAGAAGCCCTACTAATTGCCTTCAGATGAGTTTAAAGATTTCTCCGATGACACTAATCTCATTCACTTACCTACCACTGGTGCTCTTTTCACTT GGACCAAAAAAAGAAGGGGTAATGCCCTCATTGAGAAAAGACTTGATAGAGTTCTTTGCAATGAAAACTGGATTTCTGAGTGGCAATAGGTTGCTTGTTG CACTTTGCCTAGAATCAACTCTGATCATCACCCCTTATTGTTTTGTTCCAACACTTATGATGTTTCAAGACCTAGACAGTCCAGGTTTAAAAAAATGTGG GTTTCTCATAGTGACTACAGAAGATTAATCAGGGGTATTTGGATCTCGGAGGTTATAATCTACCCAATGTATGTCCTAACACAAAAGCTCAAGACTCTTA AGAGTTAATTGAAGAATTGGAATAAGAATATGTTTGGAGATCTGCATCAAAGAGTATCCCTGGCAAGGGCTAGTGTTGAGGCAATTCAAACTTGTATTCA GGAAACTAAGCCTAATCAGAACTTACAAGATCAAGAGGACTTAGCTCAGCCTGAGTTGATGCAGGCTTTGATGTTGGAAGGAAAAATCTAGAATTAATTG GCACTCCTTTAGAGACAGGAACACTATTTTTTTTTCACAAAGTTGCCAAGATTAAATCAGTGGCAAATTCAATTTCTTTCTTAAAGCATGGGGATAGATT TCTTGAGTCTCAAGTTGACATTGCTGGTCATGTGCTCAACCACTTCACTGAGTTGTTTGGTACTATGGATAACACAATTTCTAATGGTTTAATAAATGAA GTTGTTCCTCATCTAGTCACTAGAGAGGATAACTTGATGATGATTGTTATTCCTTCTAAGGATGATTGTTATCTTTTGTAAGGGTTCTAAAAAGAACTAC AATGTTTAAAAACTTTGGTGATGAACTATGCTCAAGCCTCTGGGAAGCAAATTAGCACCAACAAATGTAAGTTCTACACAGCTAATGGCTCGTCTAGATA CAGGAAAAGAATCAGCAATTTGTTGGGTTTTGCAGTAGGTAATTTGCCTTTCTACTACTTAGGTGTGCCTCTATCTAAAGGCAGACCTAAGAATTGTCAT ATGCAGCCTATTGCTGATAGCATCCTGCGGAAAATGACTTCTTGGAAAGTCTCATCTCTTTCAATTATGGGAAGGGTTGAACTTATTAAATCAATTATTC AAAGTATGCTGCTTTATAGTTTCCATATCTATAAGTGGCCAAGTCAGCTTTTGAAGACTTTGGATTCTAAAATCAAAAACTTCATTTGGTCTGGCAATAC GGAAACTAGGAAATTGCTAACTATGGCTTGGAGTACAGTGTGCACAAACCAAAATGAAGGGGTCTTGACATCAGATCTATAAGTGGCATAAACAAAGATG CTCTTTTGAAGTTAACCTGGGATATGATTACTTCCAACCAAGATTGAGTAAAGTTCTACAAGGAGAGATTTGGCTGCTCTAAAGTTGATTCCTCTAGATA TTTCTTGTTTTCTTTATGGACTAGAATAAAAGATAATTAGAACTTTGTTGTTCAGAACTCTTTTTGGTTAGTGGATGATGGTAAAAATATAAACTTTTGG CATGGCAATTGGATGGGTGAAGCTTTAGTGGACTACTTAGAAATCCCTGCTGAAATTCATGACCGAGTCTATGCAAAGGTTTCCGACTTCATTGTTGGCA ACAATTGGTCCATTCCTAGGCAACTAACGATTTCTTTCCCTGAGCTTAGTAGTAAAATAGCTAGCTTCCTAGTCTACAACTTCAAAGATAACCTAGTTTG GTAAAAAAAAAACAGATGACGATTTGCTTGATTTGAAAAGTGATTTTTCTAGCCTTCAGTTTGGGCATTCTAGTAATAGCTGGTGCAGAAAATTATGGAA TGCTTTCATTCCTCCCTCAAACTTGATGAAGAGAGGTTGCAACATGCTTTCATTCCACAATAAGCTGCCCAGTGATGAAAACTTGATGAAGAGAGGTTGC AACATGGTTTCTCGCTGCAACCTTTGTGGCAACAACTTCGAAATAAGAGAACATTTGCTTTTGTCCTACACTTTTGCAATATACCTATGGAATTGGTTAG CTAATTTGCTATCTATCAAAATCAACCTGAGTTCTTTTCAAAATATTTTCCTGGTCTGCAGAAATGATGACATATCGCAATGGAATGATGTTACTTTGGC TGTCATAATCCACACCATCAATTTTATATGGTTCTGACGAAATCAGCGTAGGTTCAATGATAAAAAAATCTCTCTACAACAAGCCACTTCTCAGATCAGC AGAGACATTGCTCTATCTGGTAATGGATCCAAGTCTTCTGTTAAGTCATCCATCAGGGAGTTTGTGACTTTGAAAAAGTTGCAAATTAATCCAAACCTGA ACAAGGCGCCTAGGATGGTTGAGGTTATCTGGAAGGCTCCAAGTGTGGACTGGATCAAGGTGAGCACAGATGGTGCAACGCATGGTTCTCTCGGTCATGC AGGGAGTGAGGGATTTTTAGAAATTGTCATGGCGAGTTCATTGCTTCCTTCTTTGCCTATCTTCATATCTAATCGTCCCTTTTTGCTGAGATTCATGCCG CCATTTATGTGGTTGAGATTGCTTTTCATAAAGGTTGGTTTAATCTGTGGCTCGAATGCGATTCTACAACGGTTGTGGCGATTTTCAATGGGAACCATGT GGTGTCATGGAAGCTTTAGAATAGATGGGTTATTTGCAAATGAAAATTGGCTTCAATGAACTTTAAAATTTCTCATATATTCAGAGAGGGTAACATTTGT GCGGATAAGCTAGCTAACTATAGTGTAGCTACTAGAACAGACAAATGGTGGAATGTTTTCCGTGACTTTATTAGAGAGGAGTTACATAGAAATGCTATGG AACTTCCTAACTATAGGTTTAGGAACTTGTAATTGGTCCTTTTGTTTTCATTAATAGAGTGGTGTTGTAGCACCTTCATTTTAAAAAAAAGATAACAAAT TATATTGATGAAAATTTATAAAATAATAAATATTAGCTCATTTTCCATCCATTTATCCTTTACCTAATTACTTTAGAGTATTCATACCCATTTATTATAA TGGGCTTATATTTTAATATACTGAAATGTTTGATTTTATTGTAATTGTGTTAATTTGTGAAGGACTACGTTTATTCAAAGACATTGGCAGAGAAATATAT TTTGAGTTATAGGAAGAATGAAAATGGTGAAGGATTAGAGGTAGTAACCCTACCTTGTGGGCTTGTGGGAGGGGATACCCTTCAATCTTTCACACCAGGA AGTGTTGGAGTTCTTATCTCACAGGTCACACACAATGAAAATGCATTCAAATCACTCCAATTCTTAGAGAACTTGTTAGGGAAAATTCCACTTGTACATG TTGATGATGTGTGTGAAGCTCATATCTTCTGCATAGAAAATGACTCAATCAGTGGAAGATATTTGTGTGCATCTTCTTTTATTTCATCAAAAGATATTGA AGATTATTATGCTCTACATTATCCAGAATTCAATGTCAAACAAGGCAATGTAGATGTGGTGAAGAAGGATATAAAGTGGACCTCAACCAAGCTGTGTGAT AAAGGATTTGTATACAAATATGATACCAAGATGATATTAGACGATTCTATCAAATGTGCAAGAAGGGTGGGTGATATCTAGTTGCTATTTATGGCCTTAT CAATTTTGCTTGTAGACTAGGGATGACGAGCAAACACTGATAGTACTTTTATGTTCCCATATTTACATCTATTTGTAGGTACCTATACATATTAAGTTTT CGATGATAATTGATAAAGGCCCAATAATTAATTAAGTTTTATGATTCCTTCTTTTCATTTTTAATACACTGTTAAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_158355; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_509718
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Anthocyanidin reductase ((2S)-flavan-3-ol-forming) from Vitis with 33.54% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418611.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |