Ll_transcript_510075

Id TrinityTRINITY_DN48158_c1_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_510075
SequenceCAAATATCATTTTATACGAATAGCATTTCCGTAGATTTGTATTGTAATGATTTACATTTGAGTTGTAACAGCATGAAGATATTACTTTCAATATATTGTA ATTTTTGTCCTTAGGGCAAAGAGTGTGGGCAAGATAATAGATCTTGTATTTGTTTTGTCGATGTGGCCGCAATTGTGGTCGCGATGCAGTTTTAGAGACC ACTAAAATCATAACATTGCGGCTTCTGTTGCGGTCACAGAGCCAGAATTACAAACCTTTGTCTCAACTGCTTGTGAAACTACTAGTTTACATTTATGTAT TTGATGATATTTTTAAAAGATGTTCATTAAGATGAGGATGATAAAGAATTACAAAGACCGAGGAGGATCAAAAGAATGGATAAAAAACAAAAATGGAAAA AGAAAAAATTAGTGTAACAAAGCTTCCTCAACATACCAGTTAGTGAAACCCTATAAAAGAACCACAAGCTTTGCATTGAGTAGATTCTTGCCACATGCCT ACATAACCTTATCCCAAATCAAGTGATGAGCTGAAGAAACTTCTTTGAAAACACAACAGTTCCACTGAGTACAGGGTTTGCCAAATTGTAGTATAAATTA CACGTCGGCATAGGATCCACGATGTTTTTCTCATGCAATGTTCCTGTTGAGTATTTGTTATAGGATAGTAAAAGGTGTATAGTAGGCGCGACCGGAAGAT CTTCGAAGTTGACAGTTTTTGGGGTTACCTTTTGAGTCCGTACTACTTTTTTTTATAATTATTCATTCTCTCTCTCTTTAACTTTGTGGTAAAGCTTAGA ATTTGGTTTTTTCTATATTAGTCATGTGAAATCATTTATGGTTGTAGATATCTCACTGTAATATTGCTTTAGTTTAATTTTATTTAAACATCAAACTTAG GAGGTTCTTAATATTCCAAACATGGGTTTTGTCTCTGCTTGTTATGCACTTATGCTCCTAGTAATGATAATTTTTGTGATCCTATTAATCTTTTCACTTG GTTTCCTTGTTTCTTTTTTGGAATGCTGGTTGTGATCTTTGAGATGCTGTAGTTGGGTTTTTTTAAAAGATCTTCCAGAGTGATTTTGTCTTTGCTTGGC CGAAGCCCAATTTCAAATTTTCTGATATCAGGTGGCCTGTCTGTTGTTTGGCAGAGAATTCCTTATTTGTGATGTGTTACTTAAGTTCTTCTGTAAAAAC TTTATAATTGGGAATGGCTTTGTGGCAAGAAGATTGTGCTGACAATCAGACAAAGTTAATATTGTAAAATACCATTTGGAGTATAGGCTTGATTCTGTGG TTGATGAACAGAGATGTGTGATATGACATTTTTCAGTTAAGTTATAGTGTTATACAAATTACAAAGTTCTTCTGCATGAAGATTCGTTTTTTCATGTCCT AATGAAGAAACTTCGTCTTGTCAATCCATTGGCCTTGGTCTCCTTCATGTTGAAGTAGTCAAATCTATTATGTCTCAGTGGTAATTTCTAGTGGAGTATT CGAGTAACTTCTTGTGCTTGGCATTCCTGCTTTTCCTCTGGTTCTTGGTCACTTGTCTGATATGTGTTTGCTTCTGATTTGTTGTGCTTTTGAGGAAAAG GTAAAACATTCTTAAAGGCTGCTATCTTGGTGATGCATTATCAATTTATTTTGTCCCTCGATATGGTACTAAATGCTACTTCCGTTGCGGCTGATTTTTA GTTATAGAGGTAGCAATAACAGGCGTGCCGTCTTATGAACTTCCTTTCAAACAGTAAGTTGCCATTTCTAGTAGTGCCAGAATTTGGAAAGGTTCTATAG CATTGTCCATACTGCAGCATCTGAGAAAGGAATTAGTCTCACATGCATTTGATGGAATCAAGAATTCCGTGCTAATTAGTGTGACCACAGATGAAAGTCT GAGACCCTTGTTGTTCAAAGTGCCAAGTGGTTGCTGATGTTGTGTACATGAACTTTATTAGTATGATGTTCCTTTCAGATTTATTAAGGTGGTTTGTTCG GTCAGTTGATGAATTATAATATATTTGATTTTAGTTGAGCGATCCAATCTCAGATCATATGTGTCAATATAGGATATTTCCTCAGTGTAACCCAAAGCAC AATTAGGCAGACATTTTGTGTTTGTTGGATAGTTCTTCTAATTGATACTCATATCTGCATCATAACAGCCCCATGTGAACTGTGCTGGATTGCTCAGATT GTTCAAATATGAGTCGCGTGTGTCTTGTTTCTTCATGGCAAGGTGCTGAGTCTGACCAGATTGTATGCATACTATGACTTGAAATGTTGAAGGTTGGACA TCACCTTTGTTTTTAGGCATTACTTTAACTATTGGAATAGAGTTGATTGGTTTAACAGGTTCTCTGGTATTTTTACTGGTTTTTCATTGGTCAGTGTACT TCTAGACAAAGTTATCCATCTCCTTCCTGTCATAATGCTATGTGACAGAAAATTGGATTTTAAAACTGGATTAATATGGCAACTCCAGAAGTGAAAGCGA AACTTGGACTATCTTGAAAGTATTACATTTCTGGGTATATTTGTAAATTTAGTTATTCTGAGTATGAAAGTTGTAGTACCCGATCTACTGAAAACAAGGT TGTTCAATGAGTGATGAACCAGTATGGAAGATGCTGAAGTTCTAGCCTACATTGTGTTAGTAGTTACATGAAAATAGTAAATAGAACATGGGCTTCGAAA GCATTATAAGCACCATAGTGAGTTTTAGGGTGGTCAAACTTAAAACAAATATTAAAGCTTAAGGGTTGATATTTGACTGTGATGATTCTGAAGATAGAAG AATTGGGTCTGTTCAGTAATTAGATAGAAAAGGGAACTTGAGTGACTAGAGAAGAACTAGAAAACGATGGACTGATTGAAGACCAAATAAAAGGGAGTGT TCCATAAACGGACACTAAAACCAAGCTATACCTGTTCACTAAAATAGCACGGAATACAGAGAGTGAAGGAGCAAGGACAACAGAGCACAAGGAGCAAGGA CTACAGAGTGAAAGAGAAAGGCTGAAACTGGTTGATGATCTGACGAAGGGAAGGAACAAGGCTAACAGAGCATAGCTGAGGAAGGGTTGACAGCCAACAG AGCACAACAAAGCAAGGTTGAACTGCTGAAGCTCTAGAGTTAGTTTTGACAGTGCCAGTTGCATATAATGCTATCTGCTATGCTGATTAAAGCAATTTAA AAGAGATATCTGATACCTAAAGTTGGTTTGCTGGTAACAATGGACATAAAAGTACCCACTGGTGCAGCCCCTTGGATGATGCTGGGTTTTAGTGAGGTTG TAGTATGGAATTTGTCTCCCTGTAGAATAGTGGTCACTATGGCCAGTTACATATCTGACATGTATGGGCTTTGGATTCTTCTGACCTGGCCAAGCTATAT ATGAAAAACATTGTGCAGCTTTAGAATAGTAGCACAGAAAGTAAGTTGTCTGGTTATAAACTACAGTTTTCGTTCAATGTTGTTTGCATGTGTTAAATGT GTTGCCTATTGTTAAGTTGATGAGATATATTTTTTTAATAAAATACTGAAAGTATTGATGCAGAGAAATGAAATGTATATATTTGCCCAAAAAATAGTTA TGCAAGAGAAACTAAAATAATTAAAGAACCTACTGCTATCTGATTTTCTCCGGGTATGTATAATGCCTGACTTAGTGTCAAGAGGATGAGCCTTGGTGCA ACGGTAATGTTGCTGCTTAGTGGCCAAGAGGTCATGGGTTCAAATCCTGATAACAATCTCTCTGCTTGCGACGGTAAGGTTGCACACTCCCCAGACCCCC ACTAAGTAGGAGCCTCATGCAATGGGCTGCCCTTTTATGTATAATGCCTTACTTCATTTTAAACTTAATGTCAGCTTGGAATATTTTAGAAGTGCCTTTC TTTGAATTCATTATGTGGCAATTACACGAGTTCTTTCATGTTCTTGTACTTGGGTACTTATTCCTCCACTGATTAAACTTGTTCTATAAGTTGTGCTCAA CCATTATCTTGAATTCTTCCAATAGTTTCTGTTGGTCACATGCATCAATAGCATCGGTGTGTATACCATAAAAAGTGCTGTTAAATTAATGCTAAAAACC TTCCTTTTTAGCAATTATTGTTATTGCTTGGTATGAGATTCTTTAGTGGTTCTCCTGTAGATAATGGTTGAAAGAGATACAGGCCGTCCACGTGGATTTG GGTTTATTACATTTGCTGACCGTAGGGGAATGGAGGATGCAATGAAGGAAATGCATGGACGGGAGCTCGGTGATCGTGCCATCTCTGTCAATAAGGCCCA GCCAAAAATGGGATCTGATGATGCTGACCATGGTTACAGAAGTAGCTATTCATCTGGTGGCAGGGGAAGCTATAGGGTGGGAGACAGGACAGGACAGGAT GACTGCTTCAAATGTGGGCGTCCCGGGCACTGGGCTCGAGACTGCCCTATGTCAGGTGGTGGCCGGGGTGGTGGCGGCTTATTTTCTTCACGTCCTAGGT TTGGAGCTTCCGGTGGCCTTGGGGATCACCTAAGCAATGAACGTGATCGCTATGCTGATGATCGTTATGATGGAAGACGTTACGGAGATGGGGATCGTTA TGATGATCGTTATGGCAGCCATGACCGCCATACCAGTGACAGGTATCCAACAAATGGTGATCGTTTTGGAAGTGGTAGAAATGGCGGTTCTGATCGTTAC CCGCAAAATGGTCAAGGCAAAGATAGAAGCTACGACCGGCTAGGTGGTCCACGTGGAGGTGCTGCCGATAGATATGGCGGTGGAATGCCAGCAAGAGATG AAAGAAGGACCTACAGGAGCAGCAGGCCAGGTCCATATGACCGCCCCAGTCGGGGTGCTCGCCCATCTTCATTTGATCGGTACTGATTTGTTCCCTTTAT TGAATTTTATGGGATATCCAGATGCAGAAGGCCCACTATGGACCTAAATTCCTTTTTGGATGATATATGGACCTAGTTTTCTCTACGTAGGGCATGGAAG TTTCATTGAACAAGTAGATATTAGTTTCATAGATTATGGATTGGTTTGTTTATGTCTTTAATCTGAGCTTGCAAATCTCTGTTGAGTTAATTTCTATTTG GATTGATGGAGAGAATTTATTAATGTTATTGATGTTCCTCTGGGTAGCTTAAATTACCTCCCTAATATGCAGTGCAAAAAGTTAATTGCTTTTTTAAAAA TAATGATGTTAAAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_158629; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_510075

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_510075
BlastpGlycine-rich RNA-binding protein RZ1C from Arabidopsis with 49.82% of identity
BlastxGlycine-rich RNA-binding protein RZ1C from Arabidopsis with 43.96% of identity
EggnogRna-binding protein(COG0724)
KeggLink to kegg annotations (AT5G04280)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019461493.1)
PfamRNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (PF00076.21)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;