| Id Trinity | TRINITY_DN48171_c1_g2_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_508507 |
| Sequence | GAATGATGCAGAGAGATTTGGTTTTTTTTGTCATGCTGCTCTTGAATTTCTACTCCAAAATGGATTTCACCCTGTAAGACATCATTTAGCTGTTCTTATT CTTTTATTTGATGCTGTTAGTTTTCTACATTTTAAGAAAAGCTTCCTTTCCTGATGTAAAAGTGGGACTGAATTGTCAATTGATTTCAAGCTAAATCAAC ATTTTCTCTCATTCCATTGGACCCAAAAACATGATATGCATGAAATTGTTAGTTTGAGAGAGAATAGTCAGAAGTTATAACTTATAACAGTGTCATGAAG TTTTTGCTACTATTTTGACACATTTGCTACATAGATTTTGTTGAGTCCTACATTGTTAATTTATGCATGCATATGCATGATTGTAACCAAACATCCTATA CATAATATGACCAAAAACATTACATGAAAAACAGCTGCTTTCAGAATGTCATTCTAAATATGCAAGTATCAGAAACCACCTTCCCAAGCGATCAACTTTT ATACTGTTATCAGGGGTGTTTTTCTTTCGGATATAATTAACATACCTTTTCCATAACTTTACATGTGACCTCAGGTTTAATTAATTGTCTCCTAGGATGT AATATAATTTAATTAGTTGTTTTAGTGACCATGAGGTCACGGGTTTAAATCTTGGAAACAACCTCTCCTCTTGCGAGGGTAAGACTATGTATATCTACCC TACTCAGACCCCATTAAGTGTAAGCCTCGTGCACATAGTTGCCATTTTTTCCTCATAGGATGTATTTATTGTAATTGGCTATTAACAATGGTCAGGATAT CATCCACTGCCATGATTGGTCGAGTGCTCCAGTTGCATGGCTATTTAAAGAAAACTATGTTCATTATGGTCTTAGCAAAGCACAAGTTGTTTTCACAATT CACAACCTTGACTTTGGAGCCAACTTCATTGCAAAAGCTATGCAACACTCGGACAAGGCTACTACTGTCTCCCCCACTTATTCAAGGGAGGTTGCAGGAC ATCCTGCAGTAGCTCCTCATCTTCACAAGTTCCATGGTATAATAAATGGAATTGACCCAGATATATGGGACCCGTATAATGATAATTGCATTCCTGTAAG TAGACATTTACAAAGATCTTTCTTTCTCCTTTCTTATATATTTGCAAGAGGATGAGCCTCGGTGGAATGGTAAGGGAGCTTGCCCCGTGACCTGGAGGTC ATGGGTTCAATTCTTGGAAACAGCCTATCCCTTTATAAGGGTAAGGTTGCATACATTAAGTCCCAGTGCCGTGACTGCTTCATAACCTATGCGTACATAT TAAAGTTGGCCACCTCGGGTGGGAACAGTGCTCAGTGACTGGCTCCATTCTATATTAGTTCTTGTGCATTCCTTAAAATTAGTGCAACTAGTGAAGAAAA TTTGCTTCATCTTTAATTTGCTTCAACCTTACTATTCCAATATCGCATTATCTTAGGTACCGTACACATCAGACAATGTTGTTGAAGGAAAAAGAGCTTC CAAGGAAGCCTTGCAACTAAGGCTTGGTTTGGAAAAGGCTAATCTTCCTTTGGTAGGAATTATTACTCGATTGACTCATCAAAAAGGAATTCATCTCATC AAGCATGCCATATGGCGCACCCTAGAACGTGGTGGACAGATTGTATTACTGGGTTCAGCTCCAGATCCTAGAATCCAAAATGATTTTGTGAGTTTGGCCA ATCAACTGCATTCTACTCATAACGCTCGTGCTAGACTTTGCCTTTCATATGATGAGCCTCTTTCACACTTGATATATGCTGGTGCTGATTTCATTCTAGT TCCTTCTATTTTTGAGCCATGTGGACTCACTCAACTCACAGCAATGAGATATGGTTCAATACCTGTTGTTCGAAAAACAGGAGGACTTTACGACACGGTA TTTGATGTCGATCATGATAAGGATAGAGCACAAGCAGAAGGTCTTGCGCCAAATGGATTTGGTTTTGATGGAGCTGATGCTGGAGGTGTTGACTATGCTC TCAATAGGTGAGTTATGTACTATATAATAAGCAGGTAGTTATGTCTGAACATGAAGAAAAAAACCAATTTGCCAACAGCAAAACTGCGGAATTACGTAAC AGCCGGCACAAGTATATAGAAGTTAAACCAATATTTAGTATTGGTATGGTGGATTTTAAAGTTTCTCTAGCCTTAGCTTTTAAGTCAAAAACTCCTTTCA CAATTATATATATATCAAGACTCGGCCAATTAGAGGTCATAATCCTCAAGAGTGCTAGTGGCATGTCCTTGATCTATTGCACTTATATGATTGATATTTG GCACTTTTCTCTCTCTTTATTATCATATTTTGGTAAAATTGTTTTACGGAGTGACCGAACATATTGTATATTTGGAATACATGGTCCCAAAAACAATCAT CGTTTGTTGGAAATCTACCTTGAAATTTTCATGACGAAAGAAAGAAGGGTCGGAAGTGGACAAGTGGTTATGGCATGGCCATAGGAAACCGGAAGCATCA TGCATGTCTAAAACTTTTGACACAAAACTATTGCATTGTCTCGCTTGCTCGTGTTAACACATTGCCTCACACTCCCGCACTCGCACCCTAGGCCTGTCAG TGTTTGTTATTATTGAAGTGTTTCATTTTTTCAGGGCAATATCGGCATGGTACGAAGGCCGCGATTGGTTTAACAGTTTATGCAAGAAGGTGATGGAGCA AGATTGGTCTTGGAACCGTCCTGCACTAGACTATTTGGAACTATACCATGCAGCACGCAAATCACTATGAGATTGCAATGCAAAATTAAGATTCATTCCA TGTTTGCACAGCAGTAGTCTAAAAATATATAAAGTTGCATATATAGTGAAAAACAATACACATCAGTTTGTAGAAACTAGACTCAATTGGGTCATTATTT TGTTGCTGCTTAGTAAATAATAGTATAAGGGTACATGTTTAGTATATGCTAAGATATGTTTTCTTGAAATAGCTGAACTTGTGAAATGCATATATTGCAG AATTGATGACATAAATGTGTAATGCAAATTCTTCATTTGCTTTACACAAATTATCATGGCCTATTTCTTTTTTTAACCATGAAAAATGTGTAAATTGTTA CACCTTTAATTCATAAATTGAATTTTCTTTTAGAATTATCCTTAAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_158718; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_508507
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Soluble starch synthase 3, chloroplastic/amyloplastic from Solanum with 87.5% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439824.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |