Ll_transcript_508536

Id TrinityTRINITY_DN48171_c1_g2_i10
Name TranscriptLl_transcript_508536
SequenceGAATGATGCAGAGAGATTTGGTTTTTTTTGTCATGCTGCTCTTGAATTTCTACTCCAAAATGGATTTCACCCTGTAAGACATCATTTAGCTGTTCTTATT CTTTTATTTGATGCTGTTAGTTTTCTACATTTTAAGAAAAGCTTCCTTTCCTGATGTAAAAGTGGGACTGAATTGTCAATTGATTTCAAGCTAAATCAAC ATTTTCTCTCATTCCATTGGACCCAAAAACATGATATGCATGAAATTGTTAGTTTGAGAGAGAATAGTCAGAAGTTATAACTTATAACAGTGTCATGAAG TTTTTGCTACTATTTTGACACATTTGCTACATAGATTTTGTTGAGTCCTACATTGTTAATTTATGCATGCATATGCATGATTGTAACCAAACATCCTATA CATAATATGACCAAAAACATTACATGAAAAACAGCTGCTTTCAGAATGTCATTCTAAATATGCAAGTATCAGAAACCACCTTCCCAAGCGATCAACTTTT ATACTGTTATCAGGGGTGTTTTTCTTTCGGATATAATTAACATACCTTTTCCATAACTTTACATGTGACCTCAGGTTTAATTAATTGTCTCCTAGGATGT AATATAATTTAATTAGTTGTTTTAGTGACCATGAGGTCACGGGTTTAAATCTTGGAAACAACCTCTCCTCTTGCGAGGGTAAGACTATGTATATCTACCC TACTCAGACCCCATTAAGTGTAAGCCTCGTGCACATAGTTGCCATTTTTTCCTCATAGGATGTATTTATTGTAATTGGCTATTAACAATGGTCAGGATAT CATCCACTGCCATGATTGGTCGAGTGCTCCAGTTGCATGGCTATTTAAAGAAAACTATGTTCATTATGGTCTTAGCAAAGCACAAGTTGTTTTCACAATT CACAACCTTGACTTTGGAGCCAACTTCATTGCAAAAGCTATGCAACACTCGGACAAGGCTACTACTGTCTCCCCCACTTATTCAAGGGAGGTTGCAGGAC ATCCTGCAGTAGCTCCTCATCTTCACAAGTTCCATGGTATAATAAATGGAATTGACCCAGATATATGGGACCCGTATAATGATAATTGCATTCCTGTACC GTACACATCAGACAATGTTGTTGAAGGAAAAAGAGCTTCCAAGGAAGCCTTGCAACTAAGGCTTGGTTTGGAAAAGGCTAATCTTCCTTTGGTAGGAATT ATTACTCGATTGACTCATCAAAAAGGAATTCATCTCATCAAGCATGCCATATGGCGCACCCTAGAACGTGGTGGACAGATTGTATTACTGGGTTCAGCTC CAGATCCTAGAATCCAAAATGATTTTGTGAGTTTGGCCAATCAACTGCATTCTACTCATAACGCTCGTGCTAGACTTTGCCTTTCATATGATGAGCCTCT TTCACACTTGATATATGCTGGTGCTGATTTCATTCTAGTTCCTTCTATTTTTGAGCCATGTGGACTCACTCAACTCACAGCAATGAGATATGGTTCAATA CCTGTTGTTCGAAAAACAGGAGGACTTTACGACACGGTATTTGATGTCGATCATGATAAGGATAGAGCACAAGCAGAAGGTCTTGCGCCAAATGGATTTG GTTTTGATGGAGCTGATGCTGGAGGTGTTGACTATGCTCTCAATAGGTGAGTTATGTACTATATAATAAGCAGGTAGTTATGTCTGAACATGAAGAAAAA AACCAATTTGCCAACAGCAAAACTGCGGAATTACGTAACAGCCGGCACAAGTATATAGAAGTTAAACCAATATTTAGTATTGGTATGGTGGATTTTAAAG TTTCTCTAGCCTTAGCTTTTAAGTCAAAAACTCCTTTCACAATTATATATATATCAAGACTCGGCCAATTAGAGGTCATAATCCTCAAGAGTGCTAGTGG CATGTCCTTGATCTATTGCACTTATATGATTGATATTTGGCACTTTTCTCTCTCTTTATTATCATATTTTGGTAAAATTGTTTTACGGAGTGACCGAACA TATTGTATATTTGGAATACATGGTCCCAAAAACAATCATCGTTTGTTGGAAATCTACCTTGAAATTTTCATGACGAAAGAAAGAAGGGTCGGAAGTGGAC AAGTGGTTATGGCATGGCCATAGGAAACCGGAAGCATCATGCATGTCTAAAACTTTTGACACAAAACTATTGCATTGTCTCGCTTGCTCGTGTTAACACA TTGCCTCACACTCCCGCACTCGCACCCTAGGCCTGTCAGTGTTTGTTATTATTGAAGTGTTTCATTTTTTCAGGGCAATATCGGCATGGTACGAAGGCCG CGATTGGTTTAACAGTTTATGCAAGAAGGTGATGGAGCAAGATTGGTCTTGGAACCGTCCTGCACTAGACTATTTGGAACTATACCATGCAGCACGCAAA TCACTATGAGATTGCAATGCAAAATTAAGATTCATTCCATGTTTGCACAGCAGTAGTCTAAAAATATATAAAGTTGCATATATAGTGAAAAACAATACAC ATCAGTTTGTAGAAACTAGACTCAATTGGGTCATTATTTTGTTGCTGCTTAGTAAATAATAGTATAAGGGTACATGTTTAGTATATGCTAAGATATGTTT TCTTGAAATAGCTGAACTTGTGAAATGCATATATTGCAGAATTGATGACATAAATGTGTAATGCAAATTCTTCATTTGCTTTACACAAATTATCATGGCC TATTTCTTTTTTTAACCATGAAAAATGTGTAAATTGTTACACCTTTAATTCATAAATTGAATTTTCTTTTAGAATTATCCTTAAAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_158718; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_508536

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_508536
BlastpSoluble starch synthase 3, chloroplastic/amyloplastic from Solanum with 85.17% of identity
BlastxSoluble starch synthase 3, chloroplastic/amyloplastic from Solanum with 80.73% of identity
Eggnog-
Kegg-
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019439824.1)
PfamGlycosyl transferases group 1 (PF00534.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;