| Id Trinity | TRINITY_DN48191_c0_g4_i5 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_508053 |
| Sequence | TTTGGAGCTTGGGGTTGACATAGGATCATCAAGTGTTGCAAGAGGTGTTGTGAGTCTTGTCCTTGGGTATCTCAGCCATCTGGTTATTGAGATGGCATTT TTAGTTCAGGGAAACACACGTGAAGAGCTTCCTGAGTTTCTTCTTGGAACCTGTCGCCTTAACCATTTGGATGCTTCCAAATCAGTTTTGCTGAAGCCAT GATTTTCAATCAGACTTGTCACAAGTGGGTTTCTCAAGTTTCAAATGTATAGATTTAATTGAAATTCTATATCCTTGTCTCAATAAAATAACTTGCACTA GTAATTACTTTATTCAATTCATTTGAATCTTGCAGCTGTTTATTATGTGCTGTGGGCATTGTTAGGATGGATGATGGTATGTTCACACTACTCTTTGTAA AAATGAAAACTTTATTTCTTCATTAGAAACCACTTATGGGTCTTTTCAAGCTCCATCACATTATAAGTGAATTTCTTAATATAATAAATAGAAGTGTTAC TCACCATACAAAAGAATTAAAAAATTACATTATTAAACTATGTATTAGGATGAAGGATGAGAATCTCTCCAAAATAAAATACTAACATATTAAAATATGC TTATAAAAAAATTTATACCATTTTTTAGTATAATATGGGTATCTCAGAAAATCTAATAGAAAATCAACATTCTCTTTATTCTCTGTCCCTCAAAGCAGTA TTAACCTCAAACAAACTTGTCACCCAAATCTTTATTTTTAGATTTACTATCTTCGTTAATGTCAGTGATAACTCAACGAATTAAGTCTCTCTTACAGGAA AAATAATATATGTTGTAATAGTATATGAGTTTTATATATTGTAGTATATTATTTATTACTCATATTTAATTATCAGCAATTCTTTAAAAAAAAGTAATCT AAGTAAATGATATAGTGACTATGTATAATTTTGACGTTTACCGAATATAAATATTACTCTCTTTAAATAATTAAATAATATAAATATCTCATTGCTCAAT CACCAAATAACCATTATACTTATACCATTGACCAACTATTTTTCTTATTTTCTTTGTTCTTTCTCCTTTCTTTCCCCAGTTTTATTGGCTTGTTAATGTT TACTATTATTTATGCCTCGTGGTGGTGATATGAGAAAAAAAAAGTTGAGAATGGTTTCATATCACAATTTATATTTTTTGAAAAGCAAAGAATTTTATTC AAGAGAAGTATCAGAAGTACTACGGTCTCAATACAGTATATAATCACAAATTATGGTCATATCATCATAATTTATTTCGAATATAACATAAATTAAAGAA AACTCTTGTCAAAGTATAACATCATAAGTGAGTCAAAATTTGACATACAAATGCTGAAATTTTATAAATCATAAAAGTAATTATCAGATCAACTCTCCTA AATATTATGATACACTGTTTAAAACTTTAAATCAATTTGCAACCTTAATATTATGACAAATTATAAGAGTTAAGTTTTGTCATATTATGAAAAATAAAAT ATAAAATAATTACTTACTACTTTGGTGAAAGGTTAGAATTAACTGACCAAGAGTTAAATTACTATATTATAAGACATATATCACATTCTCATGTCTTTTG GAGAATGCATGGGTTATTTCATTTTTCATATGTAACACATGGGATTCACAAAATCTCACTGCTCAACTAGGAAAGTAGTTAATAGTTATCCAACTTATAA CAGAAACAACTCTAACTTACTTTATCTGTCTGAAACTGATTTATTGTAACATTTTTTGCAATAAAATTTATCATTTATTTATTTAACTCCTGATCCAGGA TACCCAGAAGAGTGAAAGGAAAAAAGGAATCTCATTTTTGCTTTGATCCTTGTACTTTGTCTTTATGTTTTGTCACTTCAATCCTCACACTTTATCTCTC TCTGTTTACACTGTAATGTGTTTGTGTTTTATTCCTTCACTTAAACAAACTCATCATGTCTAAGGTACCTTCCTTCAATCACTTTCACCTTTTTTTAATG TATTTTTCTCTGTTTTAGCATTAGATGTTGCATGATTTTTCCTTTATGATATCTGGGTATCTTTATTATAAAATGGGTTTTGGAAGAAATTGTTAAAGTT TGAGGCTTTTTAGTTGGATAGTGCTCTTATACAAATTTTCACTATGCTCAATCCCATTGTTACTCATGTTGATATGGACTTTACTTACTTGATCTGGGTG TTTTTTATTTTTATTTTCCAAAATGGAGAAATATGTGAAAAAAATGAGGTTTTTTTAGATGAAATTTACTTGAACTGCTTTTTGCTTTTTGTGTAAAAAT ACAATGTGCATGATCTCATTGTTATATATGATGATCCAAATTGAGCCAAAAATATAATTTCTCCTTAAATATTTGTCATGTTTATAGCATGAATGTATGT TTTGATTTTATTTTATTTTACTCACTGTAATATTTTGAATCAGGGTGTTGCTGATATGAAGGACTTTGGGTTTTTCGGCAAGAATTTTAATGGTCTCCCT GATGAGGTTTTTAATGATATCGTCAACTTTTTCGATTTCCCTTTGGAAGATGTAGAAATTAATGTGGATGAAGACTGGGATGCTCAGTTTAAACGGCTCG AAGAGCCATGTTTTGATGTTTTTCCTGTTGCATCATCTGGGATGTGTGGCAGAACTGAGAATAATCCACAGCTTGGGATAAGTTTCTCAACTTCTGTGAG TATTCTTCCATGATCATTGTCTGCAGAATGCAAATTAGTTTAGTTATGTACTTAACTTCTTTTCTGGCATATTTCCTCTCCCTGGTAGTTGAATGCAATC GGAAACTCGTGATTTTACTTCAGTGCAGTGCATTTATATTTGATGAATTAACTATGCATGATTTTATCATGTGAAGCTGAAATAACATGATTTTGTCTGT AAATGTTGGAAGAAATTACCAAGATTCCCATTTATCTTATTTGATACATCTGATTTGATACATTTGGCATTGCAGTATAATGGCGTGTCTCAAATAAAGC AGCAGCTTGCACAAACTGCTGGACCTACATATGGAAAAACCATTTCCGACCCGAACGACTCCATCGGAAAACATTTGCATCGATTCCAAACCACTAGTCC AGTTTCAGTTTTTGATAGTAGTAACAGTTCTTCCTCAGCTGAGAATTCCAATGTTGAACAACCTACCATTTGTGTCAAGCGCTCTCGAAGTAAACGCCAG CGTCCTTCAAGCTCCAGTTCTGTTTTCGCAATTTCTTTCATCCCTACTTCACATGCTTTGCAAGAATATCCAGAGACTGATACAAGTCTTATGAAGTTGA GAAACAAAGTTGAGAAACAAAATGAAAAGGATCTCTTCCTTGTATCAGATCAAGTTAAGATGAAGAGATACTCATCAAAGGACTCAGTTGTCACTAGGAA ATGTATGCATTGTGAAGCGAAGAAGACGCCACAATGGCGCGAGGGACCTATGGGTCCAAAGACATTATGCAATGCGTGTGGAGTTCGATACAGGTCTGGC CGCCTCTATCCTGAATATCGGCCTGCAGTTAGCCCCACCTTCGTGCCATCATTGCATTCAAACAATCACAAGAAGGTCGTAGAGATGAGAAGCAAAGCTA TGCAAGAGGCCGTTAGGGGATCGATGTTGTCGTCGTCAAGCTTTTCTAGAAATTCTGTTATAAATGTTTAAATATATGAAAAGATTTTGTTAATCGAGTT TAAGTTAAGGTAAGCCTTACACCCCTGCTTTGTAATTGGATGTAGTCTCTCCGTATATGGTCTAAGGCTGATAGAAAATTTACCGTTATGAGATTATGTC TAGCGGGAGCCTCGTATATTGGACTTACGTATATAAATATTTTGTGTGCTTATGAGAGAATCCTTGATATTGCTTGTTCCATGTTAAGGCAAGGACAATG ATATGATATCATGCCATATAATATATGGAACAATAGATGATTGATGATAGATTAGAAAGAATAGTTTTTATTGCAACAAGTATGGGATAATAGATGATAG ATTATAGAGAATAGTTTTTATTGCAACAAGTATGGGATAATAGATGATAGATTATAGAGAATAGTTTTTATTGCAACAAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_158900; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_508053
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | GATA transcription factor 8 from Arabidopsis with 77.78% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002691) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019436280.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |