Ll_transcript_303967

• Id Trinity: TRINITY_DN48254_c3_g3_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_303967
• Sequence: GTGAATGGGTACTAACTCTGAGATAAAGTCACCAGAAGGAGCCTTATATGGGACACCACAAGAGGGTTGTTCAATGATGAACAGAAAGAAGCTTGGGATT TACTTTAAAGAGTCAGAAGATAGAAGAATGGCCTTTGGTAGAGGGTACACAGCAGGATCTACACCAGTTAATATCCATGGCAACTCCATTCTTGATCTTT CCAAAACTGGTGGTTGGCTTGCTGCTTTCTTTATATTTGGTAAACTCTCTATCTATATTCACTATCATTTGTGTCATATTACAACAAAGGTTAAACATTG ATGTTAAAGAATAATAACATAATTAGTTTTATATAGGGTTGGAAATGAGTTAAACTATCATTGAGCTCCATAAGTATTTGTTCCATTCAAAACTTCATTC GATTTTGAAATGAACTATTTATGTTTCCAACTAGAGTTTGACATGATTGAAGCTTTGGAGTTGTTTGATTCTACTTCCGAGTAGGAATGGCAACGGAAGT AGAATCAATTATAGTTTGATTCCATTCCTTCTCAATTATAGTTTTATATATCAATTCAGTATTGATACAACTAAAATTGTCACCCCTAATATACTAGCTC ACAATTCCACCCTCAACCTCAAAAATATGAGATAGGGCAATGCTCATCAAGGACTAAATCATACGAGTACTTGAGAATTCAGAACTAGATTTTGAAGTAA AAATGAGTTGCATGAGTTATAAATATTTATATATTTAAAAATAATTTAAAATCTATATCATTAAATGTTTTTAAATGACATGTTTCACAATCTTCATTCA GTACTAACTCCTCTAGTACCATAGAGAATCTGAAATCTCATCTTAACTCATATCAACCTACTACTATGTCTATATGTATATCTCATTTCAGGTGTTGAAA TTTGTTCTGTAACTTTTCTTCAAGAAGAACACACTATCATATGTAATAGTTAGCACTCAAAATAACTAGTTGGACAGTTTCTTTATTATCACATCAACTT GTGATGCTCTTAATCACAATTTTATACTCTCTTACAAAATTTCTACAAATCCTCTTATCTAATTAGAAGATGAGAAAATTGAAAGAAAAAAAAACAAAAG ATTTGGAACACAATCTGTAGGAAATCTAAGACATGATAAAAACTTTGAGGATAAGTTTGTATATATAATGTATGCAGGGAATGAAATGGCAGAAAGAATG GCTTATTTTGGGCTATCAGTTAACATGGTAGCCTTCATGTTCTATGTGATGCATAGACCATTTTCAAGTTCATCCAATACAGTCAACAATTTCTTAGGGA TATCTCAAGCTTCTTCTGTACTTGGTGGTTTTCTAGCTGATGCATTTCTTGGTCGCTATTGGACTATAGCTATCTTCACTACAATTTATCTTGTGGTATG TATGTGGAGAAACATTTGTTTCTATAATAGGAAATAGTGCAACAATTATTTGTGAAGAAAATGGTATAAATGTTTCTTTGTTGGGTATGATAAATAAGCT TATATAATTATAATAAACAGGGTTTAACAGGAATAACGTTAATAGCTACAATCAGCAGTTTTGTACCAAACCAAAATGAGTGTGACCAAATATCACTTCT TCTGGGAAACTGTGAGCAAGCAAAACCGTGGCAAATGACTTACCTCTACACTGTCCTTTACATTACAGCATTTGGAGCAGCAGGTATAACAATTCCCTTA TTTATTATTAATCAAATTATGATCTTGATAGTTGAAATGAAGTGGATCATTTTGTGATATATGTTTTATTTGGATCAAAAGTAGTCATGTTTACCGACGT GTGTTGGTTCAAGTAGTACATGTTTGATTGCTCTTAAGCAAGGTCTTGGGTTCGAGTCTTGTGGATGGAAAAAATACCCGCTGGGAGAGTTAGTCCCATA TACCTGTGGATGTTCTCGGTTCTGACAGGATTACCTCTGGTTTAAGGATACATGTGGGAAACCAAAAAAAGTGATGTATTTCATTATAATGTAAAGTAGC TTTTTTTCCCCATTAATCATAGGACATGGGAAGCTTCAACAAACATAAAGGAGCACCAATAAAGGATTTTTATAGTATTGATTACTCCTACCAGCCTTAA CCCCACATTTTCTATCTAAGTCCTTTTCCTTTTAATAATGTATACCTTTCTGACATTGCCTACTTAACTATTCCTAATGGTCTATTTTACGATGTTTAGT GCTCAGTCTTAATTTAATTATTGCTATCGCTTTCTTCGGATTTTAGTTATGCTTCATGTTAATTGTTTGTTCTTTGAAGAAATCTGATGTGTCAATTTGA TTGTTATTGTATAGTTTATATTAGAGTATAATATGATACTTCAATTTTTACTGATATTTTTTGGGGATGAATTTGGAAGGCAAGGAGGGCACTGAGAGCA CTTAAAGCATTAGTGAAGTTGCAAGCATTGGTGAGGGGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_159459;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_303967

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.7
• PS1: 0.7
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.3
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_303967

• Blastp: -
• Blastx: Protein NRT1/ PTR FAMILY 6.1 from Arabidopsis with 94.52% of identity
• Eggnog: transporter(COG3104)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G13400)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_003552744.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;