Ll_transcript_304277

• Id Trinity: TRINITY_DN48263_c2_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_304277
• Sequence: TCCTTCTGTGCTCATAGCAGATCTCTATAGCAGCAAAAGAGGGTCCAAAGCTGGAGGGTCAGTGCCACCTTCTTGTCAAGTGGATAGTTGCAAAACTGAT CTAAGTGATGCTAAAAATTATCACAGGAGGCACAAGGTTTGTGAGTACCATGCCAAAGCTCCTTCTGTGCTCATAGCAGATCAGCAGCAAAGGTTTTGCC AGCAATGTAGCAGGTTAAGAAACCCTAATCTATTTTTCAGTAATGAGTTCTTGTGTGTCAATTAGTTATTGAGATTATTGGCATTTTTTTTTATTGAAGT TTAGCATTTTAAACTGAGAATAAAATATCTCCCGGAGATAAGTTATCTCCTCCAGTCGGTGAAATCATAGCATACGTTATATTTTATTATTTTCTATAAA AAATTAATAAAACTAAACAAAATTCATACATTTATTAACTTGAGAAGATAAATTATCTCAGCTGGTACATTATTCACTTTTTAAAATGTGGTGGATAAAT ATATTTGAGGTGGTAGTTTTATAAATTTGGTTGTCTCCAGTTACAATGGGAATTATAGTTGCACGATCCATAATTGCAAATGGATTCGCCTTGTTATAAT TTTGATTATCGAGTTATATTCGTATTACAATCATGATTATGACCGTATTTTTTTTAGTTATGGTAAACAAAATTAATCTAATTGCAATGGTAATTACAGT TTAAAATCTAAGTGAAATTTAATTTTCAATGTAGATCGAATAGCTTAGGGAAGATGTCTTCTGATTAGGATTTTGCTAATTGTATGTGCTTGCCTTTTTC AATCAGCCCTAGGGTGTAATATTACAATCCAGAAACTGAATGTCGTTTACCAAAATGCCATTTACAGTGATCACATCCCTTGGTCCTGGAGTAATGATTT TAAGAATTTTTTTAATTTTAATATCAAAATTTAGACATTATATATTATAAGTTGTATATTTATATCTAATTTTACTTACTTTTATTTTATTTTTCACATA TTTCAATATAAAAAATAGGACAGCTTTATGGTTTTCTTGTTTTATAGTAAAAAAAACATTACTCTGATTTACATGAAGTTGACAACACAAAATGTTTTTA TTAGACAATCTCCATGGAGATGGCAAATCAGGAGTGAATTTCAAACAATCCTCTCTCATCAAGTATGATGGATGATTTAGGACAATGGACACTCATAGTA AAGGACATATCATTTCTTTCTTTCAATTCATTATATTAGGTTTACTTAAAGTTTTCGTTCCTGGAAAATTGTGCACTTTGCTTAAGTTCTAATCCAATTC TTTTTCATTCTTAGTCCCTAAAATTTTAAAGCATTTGGTTATAGTCATTCTCCTAATGCGTCTATATCAAAATTGTCTACATCAACAATTATTAAGACAT TAAGACATATGACTAACTATGATAGTGACACATCGTTGCCTAGCTAACTTCTTTGCCTAACTAATTTCATAGGAACTTGGAAAAATAGTCAATTTTTGCA AGTTGCAAAAACTTATCCAAGCCTTCATTTTATTCCTTACATAGAGTTGAGTTAGTACTTTTATGTCAATAACCAGCTATATCTAACATGATGTTTTAGA AATAACTCTGGGATTAAAACGTGAAACTATATAGTCCCTGAAAATATTTTTCACATGATGTATGGTCAACAATGATTTCTTATAAGGGTTGAAGTTGTTG AATGAAAAACTTGTGAATGGATTTGTGTTATACTGGAGTCCAAATATCATAAACATTTATAACTAATAATGGGCCAAAATTAAGAAACACTGTAAGTAGA TTGAATATTATATCTTAATCCAAAATTATTAGGTAGTAGTTTAATGAGTTTTGTTCCTCGTAATCTCTGTCAATACTCACATCAAAAGATTCCAGCTTGT CACTCGTACTTGAATATATTGAACAACGATTCAACTTTAATACCACTAATAGGACTACCAAACAAGGAGTTCCAACTACTATGGGGTCACATTGCTCTAA GACCATGACAGTAGTGAAAATTTTTTTATGAGTTTACTCACTTATATGTTGTTTGCTCATTCATTCTTGATGTGGATTTATTAATTCGCTTATTCCTAAG AATTTGATTATCTAGCTCTTCAACTCTTTCTCCTAGAGTCAAAAATCTAGATTTAAAATGGTTATAGCATAGGCTTTGTTTTGCAAAACTGAAGGCTAAT TATGAGATTGCAGTAGTTTTCTAAAAAGTTAACCTATAATCTTCCTTTATTTGTTATTCACCAAATAGCTTTACAATATTTTTGGCCAACACAAAAAGTT ATTCAACCCATCCACCTATAAGAAGCCCAATATATCTATATATATTGCATTTGGAACAAAATTCAGTGTAATTCTAGGAAATTTCCCATGGCAACTAGTT TGGTTATGGAATCAATTTTGTTTTTGCAGGTTCCATGAGCTATCAGAATTTGATGACACAAAAAGGAGTTGTAGAAGGCGTTTAGCTGGACATAATGAGA GGCGTCGCAAAACTACAGCCGATTATAATGGAGAAGGATTTCATT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_159548;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_304277

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 3.4
• PS1: 1.8
• PS2: 0.1
• PS3: 0.4
• PW1: 5
• PW2: 2.6
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_304277

• Blastp: -
• Blastx: Squamosa promoter-binding protein 1 from Antirrhinum with 58.46% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425272.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;