Ll_transcript_304056

• Id Trinity: TRINITY_DN48295_c1_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_304056
• Sequence: GGTCAATTCAACCATTGTACCCAAAATGCCCTTGCCGTGAGTCTTCTCCTCCGCGCTGTTTAGATGTCAGCATTAGCATAGCACCAACCATTTCAGATAA GCAATTCCCTATCAAACAAACACGTGTCCATTTTTCATTTCATCATTTCTAAATTTCTCTGATATATAAGAATTAGATTTTTATTTTTCATAATTCAGAA ACATCACATACACCATACACTGAATTGAATAGAAAGAGATAAGCCAAAGTTAAAGATGTCTGCAACTTCTCTGTGTTCATCGACCCTTCAATCCCAAATC AATGGAATCAACAACCACCTTCAAAAAAATTCTCCTTTTCAACCCCGATCCCTCACTTTTTCCAGCTAGCAAATCCTAATTAATGAAGGAATCGGCTTTC CAAATTGTACAGCTGCAAAATTTTAAGATGGAATCTAACAATTTTATCGTATCTTAGAATGTCTTAAAAGTTTTGTTACGAGCTCTTTCCTTATTTAACT AATGGATTGATTATGTTATTTTGTCTCGTGTAATTGGTCTATAAATAGGACAAACCTTTTGTTCTTTTGGTTTACCATGAAATACACTAATTTATTCATA CCGCCCATTGTTTTTTTCTCCTCTATTTCTCAGTAATTATTACATATTTTAAGTTAGATACGGCTTTGTAGTATTTGAAAGATAATGTACTCTGCTTTAA TATCCTTTTGTTACTTGCTATTTTGTGAGTTTAGGAGGAAACTCTCAACCGTGGTGAAGGCTTCATCTCGTGTTGACAAGTTTTCAAAAAGCGATATCAT TGTCTCTCCATCTATTCTTTCTGCTAACTTTTCAAAATTGGGAGAGCAGGTTCGATATGTTCATATTCTGCAATCAGCATCCCATTTTTGGTTAAATTGG TCTAAATTGGTCTAAATTGTTCTATAATATATTCAATATGGTTATATTCTGCAATCAATATGCCTCGCATAATCATCTTCTCAAGTTTGTTAATCGCCAG TAAGTCCTTCCTATTGTTAGTAAGTCACTATCAGTATGCTTTCTGATTCTCAGAAATCCTGATTGTTGTAGTTTGGGTCATCATCTCTGCAGGTGAAAGC AGTGGAGTTGGCAGGTTGTGATTGGATTCATGTTGATGTAATGGATGGTCGCTTTGTTCCAAATATTACAATCGGGCCTCTTGTGGTTGATGCATTGCGA CCTGTGACAGATCTTCCTTTGGATGTGCACCTGATGATTGTAGAACCTGAACAGCGGGTGCCAGATTTTATCAAGGCAGGGGCTGACATAATCAGTGTTC ATGCTGAGCAATCTTCCACCATCCATTTGCATCGTACAGTTAATCAAGTAAGGTTTCCCTCGTGATCTATCATCTAACACTTGACCAGTTAAATAAAATT GATACTAAGGGGGTTAACTGATTAGCACTATTTTTGGTAACATTAGAGGTGCCAAACATATATTTACCCCACTATATATATTGCTATCACATGCAATTTC AGAATTTTGTTATCGAGGACAGAGTAAATCTCCATATTGATGCATGAGATGAAAGTCTATGGTTTAATGTTGAAAAAATGTCTTGGCTACTAACTTTATT ACATGAACATCAATAAAAGCATTGTTGAAGGGTGGCTCATTTTAATTTTTCATGGTATTTAAGATACCAACTTGCCTGGCTAAACTATTTTCTTAAAGTT GGCATTGTTGAAGGCCAAAGCACTCTTTTACAGGGATCCAGGAAAGTGTTTATAGTTCTTCTATATGTTATGTAAATGAAATCTCTGAGGCCTTAGAAAG AACATATAGTTTTCTAAAACTTTGTTTTACAAATGGAGTTTTTTTTGTTGCTGTTACATGGTCTCACAATATTATTATTGGGATGGACATGCGATGGTAA TTTTATTTCACATCTCTCTTTTTATCCTTTTTTTGTTTGTTTTGGGTTAGTAATCACCTATTATTTGGGTTATGCTAAAATCCAGTAGAAGGAATTGGTC TTGTTATAAAGGTAGCTAAAGCTATATGAAGTTGCCTACCTTATTCTTGACGAGGTAATGCTTTGCCTCTTCATGTTAATTAAGTGTCTAAATAAATAAT AGGACTTCAGCAGCCTCATTCCATCCCACAAGATTTCCTTCACCTAAAGTTTTGTTTACACCATAGCATGATATTTTAAGCCTTATTTACTGAGTAAATC TGTTTTAGAGTTTGATTCTTTTCTCGGAACTATGGGCTGTCATATGCTGTTGTGGGCAAAAATGTATAGAAGCAGACATCTAAGGCACTGGATACTAACA ATTATTACTTCAAGGCCTACATTTTACTCCTGTTTCACTTTTCCGGTTTATATCTTTATCTGACCCACAAAATCTCATAATTTAGGTGAAAAGCCTGGGA GCTAAAGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_159840;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_304056

FPKM

• PAB: 1.4
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.9
• PS2: 1.1
• PS3: 1.8
• PW1: 0.7
• PW2: 2.3
• PW3: 5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_304056

• Blastp: -
• Blastx: Ribulose-phosphate 3-epimerase, chloroplastic from Oryza sativa with 94.32% of identity
• Eggnog: ribulose-phosphate 3-epimerase activity(COG0036)
• Kegg: Link to kegg annotations (4331761)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019438542.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;