Id Trinity | TRINITY_DN48321_c5_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_440637 |
Sequence | TATCTGTTTTAGCTATTAAAATAATGACATGTGTCTGGTTTAACCCTTTCTACGTAAATATTTCTAAAAATAAAAAAATAGTATACAAAATAGACTGAAG GAAAAAACTTATCTCCCGATATGGGGAGATATTTTATTCTTATATATATATAGGTATATCTATATATAGAAACATTTGAAATAAACCTCTTATGGTTAAT GAGAAAGGAAGTAAAAGTGGATAAAAGAATACAAAGGACTATGGGCCTAGCAGGAATAGTTCAATGAAATTCATTTGTCCATATCCTATATCCATACTCT CCAACACTTATCCATAGGTATACATAGAGTATCGAAATTATTTTTAAAAAATAAATTATATATCCGATACTCTTCGTATACTCTTAAAATGTTTGTCCGG TACCACTCTAGACATCCGAACTATGATACATAAGCATTTTGAGGTAGAAAAAATAGAAGAAAGCATAACTCACAATCAATCAATTAGACGCGAGAAACAT GACATTCAATATATATGGTATATTACATAGATGAGAATGTTGTGTTGGACGAATGGACAAACTACAAAAGATAGGATGACAAATGAATGCATCAGAGATA AAATTCTCGTAGCTCCTATTGTAGAAAAGATGTTAAATCTCGCCTTAGGTGGTTTGGACATGTGTGGAGAAGAAAGATAGAAGCCTTTACAAGAAGAATA GATGAAATGGTGGTTACTCCAATTCCTAGAGGTAGAGGGAAACAGGAAAATGATAAGCAAGACTATGAGCAAAGATTTAGAGACCATACATTGTCAATGA ACATAATTTATGATAAAATATTATAAATTTGCGTGGGACACTGGGACTAAGGCTCGGTTGTTGTATATATATATGTGTGTGTTTGTTGGTTCTACATTCT AGAATATAACATAAGGATTCCATCCTATGTTGGTGTGTTTTATAAATAAAATAGAATAGGACACGAGGTTAGGAACTATGACAGTATGGTTCAACTCAGG TGTGGAGCCAAAGACAACAAATAGAACAACCTGGTTCATGCTCTCTGGTCACACCCCACATGCTATTTAATATGCTATTTCGAAAATACGATTTGTGCAG ATGATTTGGACAACTTCTTGCAACACTAATAGTTTATGTACAAATTGTGGATAAAAATATGAACTGTCGCGAGAAGTTGTGGGAATCAGGTTTTGAAAGT GCTCATGATATGTAGGGTGTTATAGAAATATAGGATTGGAGGGTTGAGAGGGAACAGAGCAGAGGGTAAAATTTTCATTTCTATAAAATGTATATTTTTT AAAGAACAAATTAGGCGTTTTATAAAATGTCTATAACATTTTATAAAGTGTTTATGAAAATAAATAAAGAATTATTGGATTCTTTTGGTTTAAAAATTTA GATGGTATAAGAATTTATTGGAACCACAAAATAGCTCTGTTTAGATCAATGGCACGCTGGATATCGAAGGCGGACAAACTGACATCATAATGCTTTTAAA GGAAGAAGAATCGGGAAGCATACTATATCGGCAACATATGTGGCTACAACATATCACACATTTATGTAAAGGAGTAGAAGGCTATTTCAACATAAAGCAC ACATTCCGACTCAAATGTTCAGAAAAATACAGAATGAGTTAGCTATTACCCCCGCTTAGAACTTTCCATTTTTCCTAATGTCAATACATGGCAAGATGTA GTTTGTCTTAGTCAATTTAGAGCTGATTATAACTTTGGCACAGCTTTGATAATTTGAGCCTCTTTGAACCTTTTCTAGAAGGTGACAAGGAGGCTTAAGT TACCCCCTATGTATTGTGGAAACATTTGCTAGTGGTAATGGAAGTATTTTACTTTACCCAGAGAAACAATAGAGAATTATTAGAAGGTTGCATGATAATA TCGGATTTGCCTTCTCATTTGTCAAAAGTTTTCAAATATAGAATTATGGGGAATGCTTACTTATTCCTTCCTCCAAACTTCCTTGATCCAAGCATACCCT TAGCATCACGAAACCAGCCATTGATGGTCATGACACTTGGTGGAAAGTGGGATGGTATCAAAATAGAGTAGTGGCTAAAAATGGTTTTCAATTGAAGGGT CTGTTTGGCGTCTTCTTAAAAATGAGTTTTAAAAATTCGATGAATAGCTCCATATTAACATGCTTGAAAAGTCACGATTGCAAATTATTTTACCAATATT TTTGTAGGGATGCCAAACTAACTCTTATTGTGAAAATGAATTGAATTCATTTTACAGTTTCTCAATATCATTTTTGGAAGTAGCACATAATGAAGTGATT TTCATTCCAAATTTTCTACATTTCACTTTTTTCACCTACTCAACTGAGCAGACCCTTATTTTTCTTAGATGTTTTAAATGACATGATTTTGTTAAAATTC ACATGGATATCAGCTCCTTTGATGTTATGTTGAATTTAATAGATACTTATTTTGTCATCTACCAATATGTGATTTGGAAAATTTTGTATGCATTATGACT TGTATTGCAACATGAGTGCTTGGTGGTTCTTTTAACATGATGTGTCCTCGCTTTCGGGGGGAAATAAGTAAAATACAGACTGCTGACCAAAAAGGCAACA AATTGAGGTGGTTGATAGAATGTTTAAAGGATTCATTGTTATTAATATGAATTCACTGACAAAACCTTCTTCTCAAAATTTTGTTATTAACATGAATTTA TTGCTTGTCACATGATTACAGGAAAGCACATAAATTTGAGTGATCTAAACTAAGAGGATAAGATTTGCATAACTCCACAATATTTAGTGTTGTTTTTTAC AGTTTCAAAAATTGCTATCTCCCGTATACTTTGTCTAGATAAGAAATTCACTACATCTTGCACATGACATTTTTTACCAATGGTGTGATTTGAACAAGCT TATATTTAAATTAGAAACTAATTTAAGCCAATTAGCATTTTAGATTCTTAAAGAATATTCTAGGCAGTGGTGTAAAAAATGAGCATTCGCCCAGCTGATT TCGCTTCATAAATAGGGTGAGTTGGGCTGCAGTTTTGACAACCCATTTAACGTGTGGAATTTTGGATCCATGGAGCCCAATTCCACACTGCAGTGGCTCA TAGGTGCATGCATGATGTAATTTTTCATTCTAATTACTACAATATTCTCACCAAATACATGTTTTACCACCCTTCTTGTAAATGTCCATGTTCTAATATT ATTAAAATTGGTTGTATTGTTTGTTCCAAATCCTGTTTGTAATTCTTTTTGTATATTCTTTCTATATATCTTTATTTTACATTTTGTTTATGGTTTTTGG ATTGAGCAATGAAAATGAGTGTGATACTACAGCTTTTCCTTGAGATTCAAGGGTTCTGTGATAACAAGAATTAGGGGAATGGGTTGCTTGTTCTTGCAAG AATATATGGTTTTATTTTACTTTTTTCATTCAGATGGCAGGGTTAAGTATAGATAGAGGAATACTTTGTCATGTAAGCTGGTAATACTTTTGTCTTTCGT TGTCTACCTTGGGCATTCTATGTGTAATGCTTTTCTCTTTCGTTGTCTACCTCGGGCATTCTATGTGCGCATTCTATTCATTTGTTCGGTGCAATGACAT TCTCAGATGGCTTTGTTTACTGCTTAAAGTATGCTTAAATAGACTCAGTCGTGTTTACCTTTATGTTAACTTATTTTTTTTTAATTGAGTGGAAAATCTA TTTATTTCTTTTTTTTGGCTTGAAATAGATTGTCACATTTTCTTGTGAACTCTTTTGCTTTCGTGCTCTTTCAGCTATTTAATTGCATCAATGGGACTTC AAGTGCTCTGGAGCTTCGGACTTGCATGTCTTGATATTTATGCTTTGAGGAGAAAGAGGGACCTGCAAAATCCAATTCTTGTCAGCCTGTTTGTCGTAGG TGATTGGGTAAATAATCAGTCCACTTTCCTCTTTTTTTCCGTGCAGAAAATAAGTTCATGTTTGTCAAAAGAAAGCTGAAGAAGAAAAATATGCTTGAAA TAATCACATTTAGGGGAACATGGATGGAGATACAAGTTACATGAAATGCTTGTTGGACTTTCATATTATAATTACAGCAGGCTCTGAAAGTCTTTACCAT GTCCGTGGCTTCAATTTTGCATGAACTCTGATTTTCGGATAGTAACTAATCAACTAATGAATCAATGGCAAGTTGGTCTGCATATTAACTTTTCTGCACA TGCATCATATACTTGTGAAAGGAAGAATAAAACTAATATCAGTTACTCCTTTAATATCAACGTAATTCATGTACTAATGCACTAATGCAGGATTGTACAT CTCTGTTATGTTATCATGTTAACCTCTTGTTGAAACCTAAGACTCTGGTGCAGTGTTGATAATTCCGGGCTTCGACTTCCAGATTTTATTTATGATAATA GATTGTGAATGAAACTTATGGCATTTTTATTTTTCTTTTGCA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_160033; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_440637
Blastp | - |
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Blastx | CASP-like protein 5B2 from Arabidopsis with 88.64% of identity |
Eggnog | CASP-like protein(ENOG410YH2M) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G53850) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (NP_001235139.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |