Ll_transcript_441085

• Id Trinity: TRINITY_DN48335_c1_g9_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_441085
• Sequence: GCTCAAGAACAATTTATTGCACTAATATCGACAAGAAGCTTACTCAAGCAGATGTCAAACAATTCTTTGAATCTATTTGTGGAGAGGTTCAACGCTTTAG GCTTCTTGGGGATTACGAGCATTCTACTCGAATTGCATTTGTCGAATTCACAGTGGTAACTACTCACTAACTTCTAAAACCTCCTTAATTTTATCTGAAT GGGCTCTGCTCCACATAGGTATTTTTTATATTATTCTCTATTTTGCTTTGTGAAATGTAAAACCTTGGATTGAGTGCTACTATTTGCTTCACAGTTATCT TTTGCTTTGATGCAGTAATCCCACCCCCAAAAGAAGTAAACTAAATAAAATAAACCTGAATATGTCCTTCTCGTGCTTACGCTCCTCTGAGTATTTGTGT TTTATAGTAATAGATGGTTGGTTACTGCTTTTGCGGATGTATTTGTACCTTATTATTTTAGCTGTTTCATATCAAAATGCAAGTTTTGGCTTCATTTATA TTTTAAAAAGATCACTATATTATGAATCACAGTAATCAAGGAAATATTGTTTATTGGATGCTAGTAATGTCAAGTGGTCTTAGGTGGCTCTTACTTTGAA AATAATGCATTGACTGTATTTATCCATTTTAGAGATCAACGTTTTGTCAAAGAGTATGATTTATGACAGAACATTATGGCACCGTTTGATCCATATAGCC GACCCCACCTAGTGAGATTAAGACTTGGTTGTTGTTGTAGTAGTATTTGCTCATTCCACTTTGTGTGTGCTGTGATCCTGTATGATGCTTTGGTGGTCCG GTGATTTAAGGATGGGTATGCATTTGCTATTTGTTTAAGGTGAAGGTTCATTTTAGGCCATTAAAAGGGCAGTATTTGTACAAATTTGACTTTCAGGAAT AACGTTGACTTTGACTCTTGGTTCAAACTTGTTGGTTTGTCTTTCATTATAGTCATCCATGACTGAGCTTCGATAGCTTGAGTTGATGGAGCTATTACAC TTGTTGGATTTTTTTTGTCTTCTGATGACGAATGTAACTTAAATTTTAAGTTAAATCGTTTTTTTAAGGGTGAATTTGAGTTTGTGTTGATAATTTTTTT GGAATATTTGTACCATAAAACAACTTCCCCCACCATTACCCCAACCCTCCACATCCAAATATTATAAACCTAAGCTTCACTTAATAGTAGCTGTACTTAC TTTACCTTCGGCTGTTGACCGGGATTATTGTCTACATTGAGTTGCTCGCGTATTTTTTTCCGATCTGTTCTTTGTCCAATGTGGTTGTTTACTATATCCC TTCATCTCATGCTTCTTTTTTCATGAAGTTTCTGGCAATGTTTAAAATTGTTTTGTTCCCTTTTCCCTGTTAACTTTATTGACTTTTAAGATGTTGCTTC TTTCAGTGTGGTATTTTTTTGCATTTGTGTATCCTCTTGGCTCCATTAGTTTCAAATTCTGTTGTTTTGTATAATACATTTGTATAGTTGTTTCTGTTCT TGTGTGGCCTTGGTATTCAATCCCCTTGTATAATTAAATTATTGGACTTCTATGTATATTTGAAATTGATCAAATCTTTTGATTTCAAGAATTATATGCT GTGCTTACAGGGTAAGTATTAACTTGTCTCCAAATACTTTTGATCTACTGTTTGTTTTTTCTTCTCTGTTTTTCTTTTGGCTTTGGTTGTCTGAAGTATT TTTGTCACATTCTTGCAGGCTGAAAGTGCAATTGCTGCTCTGAACTGTAGTGGTGTGGTTTTGGGTTCAATGCCTATAAGGGTTAGTCCATCCAAGACAC CAGTTCGGTCTCGTGTTCCTCGTGCTCCTATGCACTGAAATCATCTGTTCATGTTAATTATAAGTTACATATAATTAATGTGACTATGTTTTTACTTCCT CTACACCCCGAATGATCTGTACTCTTAAACTTCTTAAAGAAGTGCTTTTTTGTTTTGCCTTTTCTTTATCCAAATCTTCGTACGACACAGTTTAGTACCG GAAGTTCATCCTGTTCAAAACATGTGGATTCTCCATCAACCTCAATGGACACGTGGATGCAATGAGAAGCAGGTGTTACATTACATATATGTTTACGTAG GAAACTATGGTTCTGATCAAATGCGAGGTGGTTGTGTTGTACATATGCACTATATGGTACATGCACTAGAGGAGTGTTGGTTTTGGACACTTGTTCTTAT CATAAATTTTGATATTTGACTTGGATACCCTTTCTTTTTTAGAGAATAAAATATATTCGTGTACTAGGAGATAACTTATATCTTTAAATTCACTTATTGT TTGACATGTGTCTTACTTTTCTTCTTTCTAGAATTTTTTATTTTAAAATATAAAAAATAAGACATTAAAAATGAATGAATTTAAGAATATAAGTTATATA TGTGAAAATATTTTATTCCTTGTGGTCATTCGGTATTAATTTCCTCGACTATGGTGATATTTGATTCGATTTTATATTGAGTTAACATACTTCTATTAAT GTTAAAACGTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160151;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_441085

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.3
• PS2: 0.6
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.4
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_441085

• Blastp: -
• Blastx: Polyadenylate-binding protein-interacting protein 11 from Arabidopsis with 75.93% of identity
• Eggnog: Rna-binding protein(COG0724)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G32790)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433501.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;