Ll_transcript_441086

• Id Trinity: TRINITY_DN48335_c1_g9_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_441086
• Sequence: GCTCAAGAACAATTTATTGCACTAATATCGACAAGAAGCTTACTCAAGCAGATGTCAAACAATTCTTTGAATCTGTTTGTGGAGAGGTTCAACGCTTGAG GCTTCTTGGGGATTACCAGCACTACACTCGAATTGCATTTGTTGAGTTCACAGTGGTAATTACTCACTAACTTTTAACCTTCTTAATTTCATTCTATATT TTCTATTTTTATGAATTTTAAACCATTAGATTGAGTGGTACTGTTTGCTTCACATATATCATCTGCTTTGATGCATCCCCTCCATATAATGGAAGTTTTG TCCTTATGCAACTGCTTTTGTGGGGTCTTTATATCTTGTTATCTTAGCTGTCTCATGTCAGGATGCTTGTTTTGTCTTCATGTATATTTAATATATATTA TGACGCATGGTAATGAGGGAAATATTGTTTATGAATTGAAATATGGCCTATTTGTGAACATAATATGGTGAAAATAGGCTTAATGCTAAATCTGTTCATA CAATGTAATTGTGGTTAAATGTTTCTCTAACTGAATGTATCCCTTACTTCAATGGCTATTTATTGATGGTAATAATGTCAAGTGGTTTTAGCTTGCTCTT ACTTCGGAAATAATCTATTAACAGTGTTTGATCTGGTATAACTATGCTTTTCGCCATTAGAAGTGTCCAAATGCACAAGCACAGTTTTTATGCTTAATTT TACTCATTACACATAGCATGTATGTACTGTGATCTGGTATGATTCTTTCGTGATCTAGTGATTTGGGGATGAATATCCATTTCATATATTTTTTTAAGGT GAAGATTCATTTTAGCCCATTAGAGGGAAGTATTTCTTAGGCTTGCTTATAAGGTATGATTTTGATTATATCAAGAATAACATGATGTTGGTTCTTGGTT CAAAATTGTGGGTTTATCTTCTGTTACCGTCTTCCATGACTGAGCTTTGTGAGCTTGAATCGGTGTAACTATTATGCTTGTTCGATATTTTTCTTCTTGA TCTCCAACACTAGCAAATCAAATAATTCTATAGGGATGAGTTTGTGTTTGTATAGATATTTGTTGTGATAGACTTTACCTTAAAATCACTACCCCTCCCC ATATCCTATCAAGTATTATTTTTTAAGCCTAAGATTCACTATATAGGAGATGTACTTACTTTGCCTTTGGATATTGCCGGGGTAAGTGGTGACCTACAGT TGCTTACGTAATTTTTTTGGATCTGTCCTTTGTCCAATGCGGTTGTTTTCTGTTTTCAATTGCTCGTGCTTCTTTATTCACCACCTGTTTCGGGGAATGT TTAAAATTGTTTTGTTTCCTTTTTCCCTGTTAATTTTGTTGCGCAATAAAGTGCTATCAATAAGATGTTGTTACTTGCATCTTTTATTGAGGTATTTTTT TTGCAATTGTGCATTATCTTGCCTCCAATAGATGCAAGGAAATATGGTTTTGGTTTTCACTCCCCTACTAAAATTAAATTATTGAATTCTTTGTATATTT GAAATTGATCAAATCTTTTGATTTCAAGAATTATATGCTGTGCTTACAGGGTAAGTATTAACTTGTCTCCAAATACTTTTGATCTACTGTTTGTTTTTTC TTCTCTGTTTTTCTTTTGGCTTTGGTTGTCTGAAGTATTTTTGTCACATTCTTGCAGGCTGAAAGTGCAATTGCTGCTCTGAACTGTAGTGGTGTGGTTT TGGGTTCAATGCCTATAAGGGTTAGTCCATCCAAGACACCAGTTCGGTCTCGTGTTCCTCGTGCTCCTATGCACTGAAATCATCTGTTCATGTTAATTAT AAGTTACATATAATTAATGTGACTATGTTTTTACTTCCTCTACACCCCGAATGATCTGTACTCTTAAACTTCTTAAAGAAGTGCTTTTTTGTTTTGCCTT TTCTTTATCCAAATCTTCGTACGACACAGTTTAGTACCGGAAGTTCATCCTGTTCAAAACATGTGGATTCTCCATCAACCTCAATGGACACGTGGATGCA ATGAGAAGCAGGTGTTACATTACATATATGTTTACGTAGGAAACTATGGTTCTGATCAAATGCGAGGTGGTTGTGTTGTACATATGCACTATATGGTACA TGCACTAGAGGAGTGTTGGTTTTGGACACTTGTTCTTATCATAAATTTTGATATTTGACTTGGATACCCTTTCTTTTTTAGAGAATAAAATATATTCGTG TACTAGGAGATAACTTATATCTTTAAATTCACTTATTGTTTGACATGTGTCTTACTTTTCTTCTTTCTAGAATTTTTTATTTTAAAATATAAAAAATAAG ACATTAAAAATGAATGAATTTAAGAATATAAGTTATATATGTGAAAATATTTTATTCCTTGTGGTCATTCGGTATTAATTTCCTCGACTATGGTGATATT TGATTCGATTTTATATTGAGTTAACATACTTCTATTAATGTTAAAACGTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160151;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_441086

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0.2
• PS3: 0.3
• PW1: 0.2
• PW2: 0.2
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_441086

• Blastp: -
• Blastx: Polyadenylate-binding protein-interacting protein 12 from Arabidopsis with 78.85% of identity
• Eggnog: Rna-binding protein(COG0724)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G10610)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433503.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;