Ll_transcript_439653

• Id Trinity: TRINITY_DN48357_c3_g4_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_439653
• Sequence: CTTTTGTATCTCATAGCAACCTTTCTCAAATCTTCTCTTTACCTCTTCTCACTTCTCTACCCACAATGGCTTTAACAAAATCGATTAGACACCCTCAAAA AGCACTTATCAAGAAAATCCTTAAGAGATGCTCAAGTTTGGGGAAGAAGCAACAAGACTATGATGATCAAGGGATCCATTTGGACGTGCCAAAGGGTCAC TTTGTTGTATATGTTGGAGAAAACAGAAGCAGACATATTGTTCCTATTTCTTTTCTAAGTCACCCACAGTTTCAAAACTTGCTTCATCAAGCAGAAGAAG AGTTTGGCTTTGATCACGAAATGGGTCTCACAATTCCTTGCCAAGAACATGTTTTTGAGTCTCTTACATCCATGCTCAAATAAATTCCACTTATTCTCCA TTTTCTCGCTTTATGTGTGTATATATATATATATATCAACTAGAAGATATGACAATAATATAATTGTGCAAAATCAATGTGTTTGTGCAAAATCAATGTA TTTGCAGCATTTTGGTGTTTATGATAAAATAAATTAAAAAGTACCTTGATGTAAACAAGGACTCCATAAGGGGAGCACGTCTTCGGTTTGTGCCACTCAA TGTGTCGTCGTGATTGGTTGAAAAAAATGTATTTAAGTTAAAAGTTTAATTATGAAATATTTTTCTGACCAATCACAAGTCATGTCATATGAGCTGCGTG TGACACACCACCTCTTCTTCATGGCCTGTCAAATTAGTTTTTTTTTTGTTTTGATTAAACTGTTACAGTTTAATATATTTGCACTCTAATTAATAAAGCA TTTTACATTGTGAGTCCTTTTATGATCTCATTAAAGTAATGTCGTTCGATCTATATAACTGATCCTAGCTAGTGGGATTAGGATTTGTTAGGATTTGTTT ATTGTTGGTGTAATACAAATAGCATAAAAAACCTTACGCTACACTCAGTATTTTCTCCTCTCTACTTAAATAACTACAACAGCCAAGCCTTTATCTAGTA GTGGATCGGCTACATGGATCAAATGATGTCATTATGCATATGTATTTTGGCCACTAATTTGATTTTCTGTCATGTAACTACCGTTGCAGGTTCTATTGTT GCGAATGCTAGTCTGTTCCACTATGCTCAAGGTGAAGCAAGAGGAATGGCTACAAAGGCTAGAATTGCTGCCTATAAGATCTGTTGGAGTCAGGGTTGTT TTGATTCTGATATTCTTGCTGCTATGGATGAAGCTGTAGCTGATGGGGTTCATGTAATTTCTCTTTCTGTTGGATCATCTGGTTATGCATCACAGTATCA TCATGATTCCATTGCTATTGGAGCTTTTGGAGCAGCTCAGAATGGTATTGTTGTGTCTTGTTCTGCTGGGAATTCAGGACCTGGTCCTTATACTGCTGTG AACATTGCTCCTTGGATTTTGACTGTTGGTGCTTCAACTATTGACAGAGAGTTTCCTGCTGATGTGGTTCTAGGAGATGGTAGAGTTTTTGGTGGGGTGT CCCTTTATTCCGGTGAGAAATTGCCTGATTTTAAGCTTCCTTTGGTTTATGCATCTGAAGTCGGAAGCAGATATTGTTACTTGGGGTCATTGCAGCCAAG TAAAGTTCAAGGGAAAATTGTTGTTTGTGATAGAGGAGGGAATGCTAGGGTTGAAAAAGGCAGCGCAGTGAAGCTTGCAGGTGGGTTGGGAATGATTTTA GCCAATCTTGAAGACAGCGGTGAAGAGCTTCTAGCGGATGCACATCTTCTGGCCGCAACTATGGTGGGTCAAACTGCTGGTGACAAGATCAAGGAGTATA TAAGGTTGAGTCAGTATCCAACAGCAACCATAGAGTTTAGAGGGACTGTGATTGGAACTTCACCTTCTGCTCCTAGAGTTGCATCATTTTCTAGCCGTGG TCCAAACCATCTCACACCGGAGATTCTTAAGCCAGATGTTATAGCTCCTGGTGTTAACATCTTGGCAGGATGGACTGGAAAGGTAGGACCTACAGATTTG GAGATTGATCCTAGAAGAGTTGAGTTTAACATAATATCAGGTACTTCAATGTCTTGCCCCCATGTTAGTGGAATTGCAGCATTGCTTAGGAAGGCTTATC CAAAATGGTCACCTGCTGCAATAAAATCTGCTCTAATAACAACTGCATATAATGTCGATAATTCTGGGAATAATCTTCAGGACCTTGGAACTGGAAAAGA ATCAAACCCATTCATTCATGGGGCAGGACACGTTGATCCCAATAGGGCTCTCAATCCTGGGTTGGTTTATGATTTAGATGATAATGACTATTTGGCATTC CTATGCTCGATCGGGTATGATTCTAAGCAAATTGCGGTTTTCAATAAGCAGCCTGCTAGTTTGAACATTTGTGAAACAAAACTAGGCAGGACTGGGAGAT TAACTAGTCCTGGTAATTTGAATTATCCATCTTTCTCTGTAGAATTCGGCTCCAACAATGACTTGGTTACGTATAAACGGGTTGTTACTAATGTGGGAAG CTCAACAGATGCTGTTTACAATGTCAAAGTGAATGCTCCTTCTGGTGTTGAAGTCAGTGTTTCCCCCAGCAAGCTTGTGTTCAGTGCAGAAAACAAAACA CAAGCCTTTGAAGTAACATTTGTTCAAGGAATTGGGAGTGCAAATTCTGCGAGTTTCGGGGCAATTGAGTGGGTTGATGGAAGTCACATTGTGAGGAGCC CAATTGCTGTTAAATGGAGCAGTGAATTATCAGCATCCATGTGATATCCACCGAAGAGTGTTGCTGTGGAAACATATCAAGGATGGGTTATGGGTTTAGT ACTCTCTTTGTAATTTTTATGTTAGCTTATTGTACTTTGTACAAAATAATTATGGGTACTCTGTTTCACTCAATTCTCATCTTAACTTCAAAATAATTTA TGGATTGAAATGCTTAATTCAGATAATTGTTAGATCGCATTTTTATCATGTAACATGATAAAAATGAAAAAAAAAAACGTGCCTCATCCAATACATAGGT ACCATTGCACTTGTAGTATTTGTTATGGTAAAGATTTATATACAATTAGTATATCATTTATTTGTTTTACATTTTTTGAAAAGTTAATGATATAATTAAA TATGATTAGTGGATGATATAATAACAATGTTTCAAAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_160344;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_439653

FPKM

• PAB: 2.5
• PNAB: 1.6
• PS1: 0.2
• PS2: 0.8
• PS3: 1.6
• PW1: 1.3
• PW2: 2.3
• PW3: 2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_439653

• Blastp: Subtilisin-like protease SBT1.4 from Arabidopsis with 68.48% of identity
• Blastx: Subtilisin-like protease SBT1.4 from Arabidopsis with 68.48% of identity
• Eggnog: peptidase (S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin(COG1404)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G14067)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427925.1)
• Pfam: Subtilase family (PF00082.21)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;