Id Trinity | TRINITY_DN48367_c4_g1_i27 |
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Name Transcript | Ll_transcript_440159 |
Sequence | CTTCTTCAAATGCTGATCTCATTATCGGGTCACAGTCTTCATTTGGAAAAAGTAACCTTGACCAGCTTGATGAATTGCATTGGCTGATTTGGCATGGCCT TGTGCTATTGAGAACCAGAGAACATTCTGTTACCTGATGTACACTTCTGGATCAACCGGAAAGCCTAAAGGAGTGTGTGGCACTGAACAAGGTCTTTCAA ATCGATTTTTATGGATGCAAGGAATGTATCCACTGAATGGACAGGAACTTCTGTTGTTTAAATCATCAATTAGCTTTGTTGATCACCTGCAAGAATTTCT CAGTGCTATTATAACTGCTTGTGTGTTAGTTATTCCTCCTTTTAGTGAGCTCAAAGAAAACATATATTCTATAATAGATTTTCTGAAGGCTTATTTTGTT AATAGGCTTACAGCTGTGCCATCACTGATGAGGACAATTCTTCCTGGATTGCAAACTCATGATGACTCACGGATTCAAAGTTCGCTGAAATTGCTTGTGC TAAGCGGTGAAACATTTCCTTTTACCTTGTGGGAGATGATCTCAACCATATTACCAAATACATCAATCTTGAATTTATATGGAAGTACTGAGGTCTCTGG TGACTGTACGTATTTTGATTGCAAGAGGATACCATTGATTTCGAAGGAAGATATGCTACCTAGTGTGCCAATAGGTTTACCCATTAGTAACTGTGATGTG GTGCTTCTTGGTGAAAATGGTTCATCAAATGAGGGAGAGCTATATGTTGGTGGTTCCTGCATTTCTAGGGGCTACTATTCTGAGTTTAATATAATGTCTG ATAGATTTGTAAAGTTACCTCAAAGTTATGGTTGTAGAGATTCTGTTAATGCTTGCCGAAGCCAATTATACTTTAGAACTGGTGATTTAGCCAAACAATT GCCGACTGGTGATTTTATATTTCTGGGAAGAAAAGATCGCATTATAAAAGTCAACGGACAGCGTGTTGCCCTGGAAGAAATTGAAGATTTGCTAAGGGAA CATCCATATATAAATGCTGCTGCTGTGATTTGTCGAAATAATCAAGCAGAGCCTCTTCTTTTGGATGCCTTTATAATATTAAAAGACAATGGAAGATTGG GTGAACCATTAATACCTGCAATCAGAAGTTGGTTGATTAACAAACTACCATCAGTGGTGCTTCCTAATCGCTACATCTTTACAGAATCATTTCCCATGTC TTCTAGTGGTAAAGTTAATTACGAGTTGTTGGGTGGCTCAGCTTTATTGACAAAGAGTGCCCAGGATAAGGTTGGTAACATGGACTGTAGCAATCTTCTG CAACTTATTAAAAAGGCTTTTCTTGATGCCTTGATGGTTGAAAAAGTTTGCAGTGATGGCGATTTCTTTTCAATGGGTGGTAACTCTCTTTCTGCTGCAC ATGTTGCTCACAGTTTAGGGATTGATATGAGATTTCTGTATTACTACCCAAGTCCTTTTAAGCTTTGTATGGCTCTTCTCCAGAAAAGAGGATCATGCTC TTTGCATGACAGGCTGGATAATTGTTTAGAATTAAATACAGATGGAAAAAGTAGTTATTTTTCTTCCAGTCTTACTGGAAATTCTGGTCCACTTGAGTCA AAGATGATATCTAGAGGTAATGATGATTATTCTGTTCCTTCTAAACGCTTGAAGAGGGCTTCTATAGGTTTTACATCAGAGGTTGATGACAATTCTCCAT GGTATTCCTCTTCAATATTCTTACCGTCTTCATTTAGCCGATGCAACATGGTGTCATATAAAGAGAAGCCTGCACTGATTGATACACACCAACTAACTTG GTCTCCAAATATTCCAAGAGGTAGCAGAGGACTTATGAAAGACTTTTGGAAAGTTTACATGGAATCTTGTGTCGATGCTTCACCATTGCTTGTGTTTAAA GGCTCAGACACTTATTTGTTCATTGGATCCCACTCACATAAATTTCTCTGTATAAATGCCAGAAGTGGTTTTGTCCAGTGGGAGATCACACTAGAAGGGC GTATTGAATGTACTGCAGCAATTGTTTCTGATTTTACCCAAGTTGTCGTTGGGTGTTACATGGGGAAAATATATTTTCTTGATGTTTCAAATGGACACAT CTGCTGGACTTTCCAAACAGCTGGAGAGGTATCTGGTTTTAATGTTGTATCAAACTCCTGTTCTCATTTGAGGTGTCCTAGTGTCTTCTTGAAATTATTA GGTTTTCTTTAGTCGATATTTTTTTATTACAGTAGAGACCCTGTTAAGGGATGAGTAATTTCAGAAGGAATTGCAAAAATAATCTGGTTATATATACAGA GACAATTGGTGGAGTAGACTTACGGAGAAAGAGGTTCTGTGAAGAAAATTGTAGAATCAGACTGTTATATGTTATAGATATAATTAAACCATTAATATGT CATCACCTAAACAAGTTAAGCTTTTGGGAGAGTTGGTTCATGACATGGTATCAGAGCCTCTTTGACCAAGTGATCACGGGTTCAATCCTTGCCACATTCC TGTTAAATAAAAGTGAGTTTGGAAGGTTTATTCCCTTAGAAATGAACAAATCCAGAAGTTAGATTAGTTGTAGTTGTAGGGTTAGGTTTGGCAGATACAG TTGAATTGGGTACTTAATATATGGAACCAAATAGGAATATGGAATTGTTCATATTTGCTAGATTTGGGGAACTGAGCATTAGCTCAATGAATTTTCGGTC TCCAGTAAATACTTTCACTTTGATCAAAAAAATCTTAGTGGGATAATGAAATAATACTCGATCCTTCAAAACTTTCATACTGGAAATATTGGTGAGATTT TAGATAATTTGGTATGTTAGGATGTTAATGAACATATAAGAGATTTTATTCATGGATTTTCTTGTGTGTTTTGCTCATGCTTGTTTCGAGTGAGTTCTCA TTTCTGATAAAAAGAAACGCAGCAGCCCCTGCTACATCTCTTTTTCTTTTTCACATTCTTTGTATTAGTTTTCCCCTCTATTTTGGAGGGTATCTTATGT TATTATCTTTCCCCATGTTACTCATTTCTCTGGGATTAACTTTCTTTTTATAATTAAAAGACGCATCTCATTTATCTGACTTCTTTATGCAGTCCCCTCT CCTTTAAAAGAGAGGCCTAATGCATGAGGCCCCCCTCCCCTTTCATATGGTTAATTTCCAACTATTATAAACTCATGCAGGTAAAATCACAGCCAGTTGT AGATACACACAGACAACTGATCTGGTAATTTTTATGCTTCACTTTCTATATGACTGAGTAACAATGATGTTGCTTATCATTATTTTAAGTGCTACTTTAT TGTGAATATTTGACTGAAGAATTTAACACTATGTGCTTAAGTATAGGTGAAATTATGAACTTTTTTATGACAAATAGCATCCGTTCTGCTTAGAACCCTC CTATGTGGGATGAATGTGTTAGGCTGCTCCTTTAGAGCACTGCTGGTTTGTGAGGGTTATTCTTTGAAATAGCTATTTTTGGCATTTGCTTAAGTGTAGG AGTGGAATAAAAGAAAAGAAGATTCATGAGTGGATATAGGTTGGCATTTTTTTCACTTTGACCTATGCTAAGATTCATACCCAAGAAAGCAATTTTTTAT TGAGAAGTGCTGCATTTATGATTTTGAGAGGTGATATGTTTAATTTTCCCATGAAAACTTGTTTTTTGGGTTGCTAAATATGTGTCATTGGGCACACATA AAAAGAACTCCAACATAATAGATACAATGGTGAAGGTTAAAGTCCAACATTGTCTGTGTTTGGAAACTATTAACTTTTCGGCATTGGTTTAATATTTATA CAGGTGTGGCTCACACGATCATAACTTATATGCTCTCGATTACAAAAATCATTGTTTTGTCTATATGCTACCATGTGGAGGCAGTGTATATGGGTCACCT GCAATTGATGAGGATCGTGGTGTGCTGTATGTGGCCTCTACTGGTGGTCGTATAACAGCTATATCAATATTGGCTTCTCCATTTAATGTATTATGGCTAC ATGAGTTAGAAGTCCCTGTGTTTGGTTCTCTGGCTATCACCCAAAATGGAACTGTAATATGTTGCTCGGTAGATGGCTGTGTTCGAGCATTGGATCCAAA TGGATCCTTAGTTTGGAAGAAAACTACTAATGGTCCAATATTTGCTGGGTCATGCATATCTTCTGCTCTTCCTCATGAGGTGATCGTATGCTCCAGGAAG GGAAGTGTTTACTCGTTCAAACCGGACTCCGGGGATCTACTATGGGAATACAATGTTGGATATCCAATTACAGCATCTGCTTATGTTGATGAACACTTGC AGTTGAAATCTGATGCCTCCGATTCTTTAGACAGATTAATTTGCATTTGTTCTAGTTCTGGAGGCATTCATCTTCTTCGAGTGAACTCAAATTTCTCCGG AGATTCGGATCTTCCAACCATTGATGTGCAAGAATTTGCAAGGCTAAACTTGCCAGGTGATATATTCTCTTCACCTTTAATGATAGGTGGGCGAATCTTT GTCGGTTGTCGGGATGATTACTTGCACTGTGTTGCCATTGAAATTCCAAAGCAACATAAAACTTAAAGCTAATGTATTTAGTCCAAATTTTGTTAAACCA TATTAGGCAGTTTAGTTCTGTATTTAGATCCTCAAAACTACCTTCTAGCAGTTGAAATATTATATTTTCAGAAGAATAAAAACAAGGGAAAAGGCACAAT ATGTTTGATCATTCAGAGTTTCCTAAACTTAAGTGTTGTGATTGGTTAGTAAAATACTTAATTATTAAATTTTAACTTAAATATTTTTTTAACTAATCAC AAAAAGTGATATATAGAGTGACATACTTTGTGGGACAGCAGATGTCCTCCGATCTCCCATA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_160458; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_440159
Blastp | Putative acyl-activating enzyme 19 from Arabidopsis with 49% of identity |
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Blastx | Putative acyl-activating enzyme 19 from Arabidopsis with 49.16% of identity |
Eggnog | non-ribosomal peptide synthetase(COG1020) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G35930) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019431468.1) |
Pfam | AMP-binding enzyme (PF00501.27) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |